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- 刘闯舒胜利詹秀秀张子柯
- 非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法及系统
- 本发明涉及一种非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法及系统,包括:(1)数据准备:通过微生物组学数据,得到细菌的相对丰度、样本的分组信息;(2)构建微生物共生网络;(3)分析微生物共生网络;(4)挖掘功能模块...
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- 一种基于微生物网络评估水生态稳定性的方法
- 本发明公开了一种基于微生物网络评估水生态稳定性的方法,涉及水生态稳定性评估技术领域,包括以下步骤:S1、关键因素和其他因素的识别与采集:关键因素包括水温、pH值、溶解氧、营养物质含量;其他因素包括光照强度、水流速度、底泥...
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- 面向生物网络的网络相似性搜索算法研究
- 2024年
- 目前生物网络数据库呈现指数性增长,为了能从网络数据库中准确找到目标网络,本文提出一种新的网络相似性搜索算法。首先用两种方法分别计算Top k的相似网络,然后将两种算法返回的相似网络经过Overlap分数筛选,通过加权重排序算法将两组数据进行整合重排序,最后返回一个精准的已经排好序的相似网络数据集。实验的结果显示,本文算法的查询精确度和查询速度优于其他算法,为解决网络查询中速度慢精确度低等问题提供了理论支撑。
- 戴芙蓉彭嘉钰江振宇邹欣琦戴小鹏
- 关键词:生物网络搜索算法
- 一种基于分子特征间不同比较方式的生物网络构建算法
- 本发明涉及一种基于分子特征间不同比较方式的生物网络构建算法,包括输入肝癌的组学数据,统计数据中的任意两个分子特征在相邻两类样本中水平比较关系和垂直比较关系下每种情况发生的频次和频率,并计算其包含的复杂程度和最大复杂程度,...
- 黄鑫苏本哲李梦君
- 基于生物网络的中医药学原理探索被引量:6
- 2024年
- 中医药生物学基础不清、方剂作用机制不明、缺乏符合中医药整体特点的研究方法学体系是中医药现代化研究面临的关键瓶颈.随着信息学与系统生物学等新兴学科的发展,以生物网络为切入点开展中医药学与人工智能、大数据、信息学等前沿科学技术的交叉研究,成为探索中医药科学原理、促进中医药现代化的重要途径.基于生物网络的“网络靶标”理论有望突破宏微观内在关联解析的鸿沟,实现还原论和整体论的有机融合,架起传统中医与现代医学研究桥梁,成为探索中医药学原理的突破口之一.“寒、热”等中医药核心诊疗概念、治未病等中医特色理论的科学内涵阐明是解读中医药学原理的重要组成部分.本文基于李梢课题组的研究,综述了基于生物网络的中医药研究理论与技术方法,及其应用于“寒、热”“治未病”等中医特色理论的病证结合科学原理探索所取得的进展,以期为利用现代科学技术解读中医药学原理,促进中医药现代化提供参考.
- 谌攀吴博文张鹏李梢
- 关键词:生物网络寒热证候治未病
- 基于生物网络对柑橘属植物果皮预防高尿酸血症的研究
- 2024年
- 初步阐明柑橘属植物果皮预防高尿酸血症的药效物质基础与作用机制。通过体外测定柑橘属植物果皮对黄嘌呤氧化酶的抑制作用,评价其预防高尿酸血症的效果,通过网络药理学预测柑橘属植物果皮预防高尿酸血症的物质基础及其潜在作用机制,通过分子对接以验证结果。柑橘属植物果皮对黄嘌呤氧化酶有一定的抑制作用,且在线性范围内呈现量效关系。网络药理学和分子对接技术预测结果显示,柚皮素和桔皮素为主要活性成分,可能通过脂质代谢、血管功能等途径抑制高尿酸血症。芸香科柑橘属植物果皮可应用于大健康产业,用于预防高尿酸血症。
- 闫平张华张彦柴希艳张艳
- 关键词:柑橘属果皮高尿酸血症网络药理学
- 肠道微生物网络在高草酸诱导大鼠肾损伤中的保护作用
- 2024年
- 目的探讨肠道菌群移植(FMT)对高草酸饮食大鼠草酸代谢的影响及肾脏保护作用。方法将24只雄性SD大鼠随机分为SC组、SC+FMT组、OD+PBS组及OD+FMT组。其中,SC组为对照组,正常大鼠饲料喂养;OD+PBS组及OD+FMT组采用5%草酸含量的饲料喂养。第14天起,OD+PBS组、OD+FMT组及SC+FMT组分别给予PBS溶液及豚鼠粪便滤液灌胃,连续7 d。收集各组大鼠的24 h尿液、粪便及静脉血清,测定肠道菌群及血清尿液生化指标;取大鼠肾脏进行实时定量PCR及免疫组化检测肾素、ACE及OPN的表达情况。结果肠道菌群移植影响了大鼠的肠道菌群,SC+FMT组大鼠的肠道菌群偏离了SC组大鼠的肠道菌群并与豚鼠肠道菌群的相似度提高;与OD+PBS组比较,OD+FMT组的尿草酸、尿素、尿酸、肌酐、血尿素氮/肌酐以及血尿酸明显降低。此外,经FMT治疗后,与OD+PBS组相比,OD+FMT组上调的肾素mRNA表达的被降低,下调的OPN mRNA表达得到了恢复;免疫组化得到了类似的结果。结论肠道菌群移植激活了大鼠肠道中以Muribaculaceae等草酸降解菌为代表的微生物网络。高草酸诱导的肾脏损伤因微生物网络对草酸的降解而恢复,肠道菌群移植对大鼠肾脏具有保护作用。
- 王演潘铁军刘振宇孙进波周宇李超圣高磊
- 关键词:草酸钙结石肾脏保护
- 基于生物网络的环状RNA和疾病关联关系预测
- 李十莹
- 人工智能结合生物网络对“养血清脑制剂”和“逍遥丸”组方的优化及验证被引量:2
- 2024年
- 目的:利用人工智能和大数据探寻符合中医药传统的复方中药组方优化思路,为复方中药二次开发提供参考。方法:围绕“君臣佐使”理论,基于中药材安全性预测模型,预测养血清脑制剂、逍遥丸中佐药和使药的安全性:(1)剔除安全性低的药材后获得改良方;(2)保留安全性高的药材,结合中药材成分吸收、分布、代谢和排泄性质(ADME)及靶点网络分析获得改良方。随机游走算法计算养血清脑制剂改良方、逍遥丸改良方与其原方的相关性。取ICR小鼠112只,随机分为模型对照组、阿司匹林肠溶片0.2 g/kg组、养血清脑制剂原方7、14、28 g/kg组和改良方7、14、28 g/kg组,每组14只。末次给药后1 h各小鼠腹腔注射0.6%醋酸溶液,观察药物对小鼠扭体反应的影响。随机将78只SD大鼠分为正常对照组、盐酸氟西汀0.01 g/kg组、慢性不可预知温和刺激(CUMS)结合孤养抑郁大鼠模型对照组、逍遥丸原方4.34 g/kg组、改良方4.44 g/kg和4.40 g/kg组,每组13只。在试验第0、7、14、21、28、35、42、49、56、63 d分别称体质量,进行糖水消耗试验和敞箱试验;采用酶联免疫吸附(ELISA)法检测大鼠海马中多巴胺(DA)、去甲肾上腺素(NE)、5-羟色胺(5-HT)、脑源性神经营养因子(BDNF)的含量。结果:养血清脑制剂改良方和原发性头痛显著相关(Z score=11.95);与模型对照组相比,养血清脑制剂原方7、14、28 g/kg组和改良方7、14、28 g/kg组均能明显抑制醋酸所致小鼠扭体次数,呈现明显镇痛作用(P<0.05或P<0.01)。逍遥丸改良方与抑郁症显著相关(Z score=23.61);与正常对照组相比,第63 d模型对照组大鼠出现显著抑郁症状(P<0.01);与模型对照组相比,逍遥丸改良方(减薄荷和茯苓)4.40 g/kg组显著改善模型大鼠的抑郁症状(P<0.01),大鼠海马中DA、NE、5-HT、BDNF的含量显著增加(P<0.01),优于逍遥丸原方4.34 g/kg组和改良方(减薄荷)4.44 g/kg组。结论:养血清脑�
- 赵倩魏宇郭凯敏王文佳周水平孙鹤方坚松胡蕴慧
- 关键词:逍遥丸人工智能君臣佐使
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