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一种鸡品质性状分子微模块芯片及其应用
本发明公开了一种鸡品质性状分子微模块芯片及其应用,涉及家禽遗传育种领域。该鸡品质性状分子微模块芯片包括检测评价鸡品质性状的SNP位点组合中各SNP位点基因型的探针。本发明选取22个代表性地方鸡种资源和2个引入鸡种资...
韩威朱云芬周成浩殷建玫薛倩李国辉张会永蒋一秀黄兆祥苏一军
四川牦牛UCP1基因遗传多态性及其与品质性状的关联分析被引量:1
2023年
四川牦牛(Bos grunniens,yak)主要分布于我国海拔3000~5000 m的高原地区,以质细嫩、味美可口、低脂肪、高蛋白而受到国内外消费者的欢迎。牦牛全身都是宝,藏族人民的衣食住行都离不开它。解偶联蛋白1(uncoupling protein 1,UCP1)是棕色和米色脂肪细胞特异性表达的一种产热线粒体蛋白,通过线粒体中的电子传递链参与底物氧化和ATP分解进程,从而产生热量并为机体供能。本课题组前期通过组学分析发现:UCP1基因可能对脂质代谢具有重要调控作用。因此,本试验拟以四川牦牛为研究对象,探讨UCP1基因在四川牦牛群体中的遗传多态性,分析四川牦牛品质性状相关的潜在遗传标记位点。结果显示,UCP1基因的内含子4和外显子5中共发现4个SNPs位点,其中I4-769 G>A位点的AA型的背最长肌红度显著高于GG型;在I4-836 C>T位点中CC型的背最长肌红度和黄度显著高于CT型;E5-26 C>G位点的CC型的背最长肌亮度显著低于CG型,而CC型背最长肌红度和黄度显著高于CG型;E5-59 A>G位点的GA型的背最长肌24 h时的pH值显著高于AA型。单倍型分析结果表明:共有6种单倍型,其中H1H1和H1H2单倍型组合的背最长肌亮度显著低于H1H3单倍型组合;H2H2单倍型组合的背最长肌红度和黄度显著高于H1H3单倍型组合;而H2H2单倍型组合的背最长肌黄度显著高于H1H3和H2H3单倍型组合。本研究为选育优质品质性状牦牛提供有利的分子遗传标记,为进一步阐明UCP1基因的功能奠定基础。
陆惠娴于海滨谢涛阮梦茹Ambreen Iqal姜平赵志辉
关键词:牦牛单核苷酸多态性肉品质性状
立华麻黄鸡体重和品质性状全基因组关联分析
2023年
旨在利用全基因组关联分析(GWAS)方法挖掘影响鸡体重和品质性状的位点和功能基因,为快速型黄羽鸡的选育积累理论基础。本试验对象为393只立华麻黄终端父系公鸡,60日龄时进行称重并采集胸肌以测定品质性状。通过全基因组重测序获得个体遗传变异,使用PLINK、GEMMA和R软件对体重及品质性状进行GWAS分析。结果,共筛选到2个与体重、8个与品质性状显著关联的SNPs位点(P<1.15×10-7);在潜在显著水平鉴定到52个与体重、296个与品质关联的位点(P<2.31×10^(-6))。通过对这些关联的SNPs进行注释,共筛选到了99个与体重、27个与剪切力、28个与系水力、57个与pH、113个与色相关的候选基因。分析认为FSTL3、MBNL3、NPFF、PFKM、PRKG1、SLC13A5、MDFIC、FGD3、AQP 1等基因可作为鸡体重和性状的关键候选基因。以上研究结果为快速型黄羽鸡重要经济性状提供了重要的遗传变异位点和后续基因,为完善优质鸡分子选育方法、加快品种选育进展提供了关键的基础数据。
范晨宇单艳菊章明姬改革巨晓军屠云洁贺喜束婧婷刘一帆张海涵
关键词:全基因组关联分析体重肉品质
北京黑猪FABP3和SCD基因多态性与品质性状关联分析被引量:5
2023年
旨在研究脂肪酸结合蛋白-3(fatty acid binding protein 3,FABP3)和硬脂酰基辅酶A脱氢酶(stearoyl-CoA desaturase,SCD)基因的多态性及其与品质性状的关联,从而能够在分子水平上指导北京黑猪的育种工作。本研究以413头北京黑猪为材料,收集品质性状数据并提取DNA和RNA,根据FABP3和SCD基因序列设计20对引物进行PCR扩增及测序,运用DNAStar软件分析测序结果,对FABP3和SCD基因进行不同基因型与北京黑猪肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量的关联分析并运用荧光定量PCR对其进行基因表达差异分析。结果发现,FABP3基因存在1个错义突变(c.681A>G),SCD基因存在1个错义突变、2个同义突变以及2个3′UTR区突变。使用Duncan’s多重检验统计分析发现,SCD基因内的SNPs与品质性状关联均不显著;FABP3基因错义突变位点c.681A>G与色L*和IMF含量显著关联(P<0.05)。该错义突变导致FABP3蛋白第51位氨基酸残基由异亮氨酸(I)突变为苏氨酸(T)。利用qPCR开展FABP3 c.681A>G两种纯合基因型(AA和GG)个体表达量差异分析,发现该突变位点两种纯合基因型个体间基因表达量差异不显著,说明FABP3 c.681A>G错义突变位点可能通过影响蛋白功能来调控肌内脂肪含量和色L*性状。上述两个基因中只有1个位点与色L*和IMF含量关联显著,可以作为北京黑猪品质性状的候选基因功能位点,也能为北京黑猪品质育种提供了新的分子标记。
苏艳芳杨曼牛乃琪侯欣华张龙超
关键词:北京黑猪SCD肉品质
四川牦牛ACOT12基因多态性及其与品质性状的相关分析被引量:1
2023年
为了研究酰基辅酶A硫脂酶12(acyl-CoA thioeaterase 12,ACOT12)基因的多态性及其与品质性状的关系,本试验采用DNA测序技术对102头四川牦牛ACOT12基因的多态性进行了研究,使用Haploview 4.2软件对ACOT12基因的多态性位点进行连锁不平衡分析,并通过SPSS 23.0软件分析ACOT12基因的SNPs位点及其单倍型与品质性状的相关性。结果发现,四川牦牛ACOT12基因外显子1上存在3个SNPs位点,分别为E1-285 T>C、E1-603 T>A、E1-675 C>G,其中E1-603 T>A、E1-675 C>G位点分别与pH_(45 min)值、背膘厚性状显著相关(P<0.05),说明以上2个SNPs可分别作为四川牦牛宰后pH_(45 min)和背膘厚性状的相关分子标记;H2H2单倍型组合的宰后pH_(45 min)值显著高于其余H1H4单倍型组合,因此可作为四川牦牛宰后pH_(45 min)值性状的最优单倍型组合,为未来优质牛的早期选育提供分子理论依据。
阮梦茹王浩铸谢涛陆惠娴于海滨姜平赵志辉
关键词:单核苷酸多态性肉品质
四川牦牛PRSS2基因遗传多态性及其与品质性状的关联性分析被引量:1
2023年
为了探讨丝氨酸蛋白酶2 (serine protease 2,PRSS2)基因的遗传多态性及其与四川牦牛品质性状的相关性,试验采用DNA直接测序法对93头四川牦牛PRSS2基因的遗传多态性进行研究,并使用Haploview 4.2软件对PRSS2基因的多态性位点进行连锁不平衡分析,探讨PRSS2基因单倍型组合个体与品质性状的相关性。结果表明:在四川牦牛PRSS2基因中一共发现了6个SNPs位点,分别为I3-151 G>A、I3-328 C>T、E4-53 C>T、E4-110 C>T、I4-87 A>T、I4-127 C>T,其中I3-328 C>T、E4-110 C>T位点与剪切力相关、I4-87 A>T位点与蒸煮损失和pH24 h值相关;I4-127 C>T位点与pH45 min值相关;H4H4单倍型组合个体的红度(a*)显著高于H1H4单倍型组合个体(P<0.05);H1H3和H2H3单倍型组合个体的蒸煮损失显著低于H2H4和H3H3单倍型组合个体(P<0.05);H2H4、H1H2、H1H4和H3H3单倍型组合个体的剪切力显著高于H1H1和H1H3单倍型组合个体(P<0.05)。说明四川牦牛PRSS2基因中存在6个SNPs位点,H4H4、H1H3、H2H3和H1H1单倍型组合可作为筛选牦牛色、系水力和嫩度的最优单倍型组合。
单晓雨陆惠娴王君瑜颜黎东田孟鑫孔品晴姜平赵志辉
关键词:肉品质
蒙古牛生长、品质性状和血清生化指标全基因组扫描及其拷贝数变异图谱构建
蒙古牛原产于蒙古高原地区,是当地牧民不可缺少的乳、之源,且役用能力大、持久力强,能吃苦耐劳的优良品种。锡林郭勒草原属温带大陆性气候,风大、干旱和寒冷是其主要气候特点。锡林郭勒盟年均气温3.4℃,寒冷期长达7个月,1月份...
张剑
关键词:蒙古牛基因芯片拷贝数变异
松辽黑猪与引入猪种品质性状的综合对比分析被引量:4
2022年
为了对比松辽黑猪与引入猪种猪品质间的差异,试验以松辽黑猪、巴克夏猪、长白猪、大白猪、杜洛克猪、杜长大三元猪及长大二元猪为试验对象,屠宰后采集背最长肌和腰大肌,测定嫩度、熟率、压榨水分、离心失水率、滴水损失、亮度(L^(*))值、红度(a^(*))值、黄度(b^(*))值、pH_(24h)值、初水分、肌内脂肪品质指标,分析不同品种和品种组合猪上述指标间的差异和相关性,并基于主成分分析方法对不同品种和品种组合猪的品质进行了综合评价。结果表明:松辽黑猪肌内脂肪最高(2.89%),巴克夏猪离心失水率最低(13.72%),长大二元猪滴水损失和L^(*)值最高(4.86%和58.46),杜长大三元猪初水分最低(67.91%)。肌内脂肪与pH_(24h)值呈极显著正相关关系(P<0.01),与压榨水分和离心失水率呈极显著负相关关系(P<0.01)。各指标通过降维处理后得到6个主成分,其累计贡献率达88.143%,第1主成分的贡献率最大,该成分与肌系水力相关,大白猪、长大二元猪第1主成分得分较高,说明其的保水能力较差;第2主成分主要与色相关,松辽黑猪和巴克夏猪的第2主成分得分较高,说明其质颜色较好。说明松辽黑猪和巴克夏猪的品质优于大白猪、杜大长三元猪和长大二元猪。
李娜张琪刘洪亮高一王多伽王蕾刘丽宅赵云辉金香淑张志彬张鑫于永生
关键词:松辽黑猪肉品质主成分分析
特色小体型优质鸭屠宰性能和品质性状及其相关性分析被引量:5
2022年
为了探讨乌嘴白羽小体型优质鸭屠宰性能、品质与营养成分及其相关性,本实验随机挑选63日龄的小体型优质鸭(公母各15只)进行屠宰性能、品质和营养成分测定。结果表明:63日龄公鸭宰前活重、屠体重和头重极显著高于母鸭,半净膛重、全净膛重、脚重显著高于母鸭,而腹脂率显著低于母鸭。公母鸭胸腿肌色、pH、剪切力、失水率等常规品质无显著差异。肌营养成分结果显示,公鸭胸肌蛋白质和脂肪含量极显著高于母鸭,而水分含量极显著低于母鸭;母鸭腿肌蛋白质含量、胶原含量极显著高于公鸭,而水分含量极显著低于公鸭。相关性分析结果显示,小体型优质鸭胸肌pH_(1)值和pH_(24)值极显著正相关,水分含量与头重显著正相关;色L值(亮度值)和头重,蛋白含量与脚重,脂肪含量与头重均呈极显著负相关,色b值(黄度值)和剪切力,蛋白含量与头重,脂肪含量与活重均呈显著负相关;腿肌蛋白含量和头重极显著正相关,pH_(1)值和pH_(24)值,pH_(24)值和剪切力显著正相关;pH_(1)值和腿肌重呈极显著负相关,头重和L值、剪切力,水分含量和胶原含量、腿肌重、脚重均呈显著负相关。本研究结果表明,特色小体型优质鸭屠宰率高,腹脂率低,肌水分和脂肪含量高,这些结果为特色小体型优质鸭的选育和种质资源开发利用提供了理论参考。
董钊绮杨宝龙白蒙李潇凡宋倩倩卞友庆江勇陈国宏白皓常国斌
关键词:屠宰性能肌肉品质
四川牦牛SLC27A6基因遗传多态性及其对品质性状影响的分析被引量:2
2022年
为了探讨溶质载体家族27成员6(solute carrier family 27 member 6,SLC27A6)基因的遗传多态性及其对四川牦牛品质性状的影响,试验采用DNA直接测序法对92头四川牦牛SLC27A6基因的遗传多态性进行了研究,使用Haploview 4.2软件对SLC27A6基因的多态性位点进行连锁不平衡分析,最后用SPSS 22.0软件中的LSD法分析SLC27A6基因的基因型及单倍型对品质性状的影响。结果表明:在SLC27A6基因第4内含子中发现5个SNPs位点,分别为I4-19114G>A、I4-19160C>T、I4-19262A>G、I4-19480G>A和I4-19644G>A,这5个SNPs位点的AA、TT、AA和AG、AA、AA基因型个体宰后pH_(45 min)值均显著高于同一位点的GG、CC、GG、GG、GG和GA基因型(P<0.05);GA、CT、AA、GA、GA基因型个体的蒸煮损失均显著低于同一位点的AA、TT、AG、AA、AA基因型(P<0.05);5个SNPs位点存在强连锁遗传,在85个个体中发现了H_(1)H_(1)、H_(1)H_(2)、H_(1)H_(3)和H_(2)H_(2)共4种单倍型组合,其中H_(1)H_(1)和H_(1)H_(2)单倍型组合个体的pH_(45 min)值显著高于H_(2)H_(2)单倍型组合(P<0.05),H_(1)H_(2)单倍型组合个体的蒸煮损失显著低于H_(1)H_(1)单倍型组合(P<0.05)。说明5个SNPs位点和H_(1)H_(2)单倍型组合可作为牦牛宰后pH_(45 min)值和蒸煮损失性状的分子遗传标记和最优单倍型组合。
陆惠娴于海滨阮梦茹IQBAL Ambreen谢涛姜平赵志辉
关键词:牦牛单核苷酸多态性肉品质蒸煮损失

相关作者

赵桂苹
作品数:250被引量:893H指数:15
供职机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
研究主题:北京油鸡 肉鸡 肌内脂肪 白羽肉鸡 分子标记
郑麦青
作品数:220被引量:1,041H指数:18
供职机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
研究主题:北京油鸡 肉鸡 肌内脂肪 白羽肉鸡 黄羽肉鸡
刘冉冉
作品数:149被引量:278H指数:8
供职机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
研究主题:北京油鸡 白羽肉鸡 肉鸡 分子标记 肌内脂肪
文杰
作品数:323被引量:1,637H指数:25
供职机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
研究主题:北京油鸡 肉鸡 肌内脂肪 黄羽肉鸡 白羽肉鸡
许尚忠
作品数:326被引量:1,280H指数:19
供职机构:中国畜牧业协会
研究主题:肉牛 PCR-RFLP 多态性 胴体性状 肉牛产业