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基于多层次特征提取的蛋白质家族分类研究: 下一代测序技术已经产生了大量新的测序蛋白质,将这些蛋白质分类为不同的功能家族是生物蛋白质特性研究领域的重要任务。由于传统生物实验方法测定成本高、耗时长,因此基于机器学习的蛋白质分类研究已成为热点。然而,现有工作存在特征层...; 周国凯; 关键词：分布式编码

恶性疟原虫ApiAP2蛋白质家族研究进展被引量：2: 2022年; 疟疾是由顶复门寄生虫——疟原虫引起的一种人畜共患病。疟原虫不仅可以感染人,还能够感染家禽、鼠、食蟹猴等多种动物,其中,鸡疟原虫病、鼠疟原虫病对畜牧业影响较大。为完成其复杂的生命周期,疟原虫需要严格的基因调控,而转录因子对基因表达的调控作用十分关键。截至目前,ApiAP2蛋白质家族是在所有顶复门原虫中作为候选转录因子出现的唯一蛋白质家族。论文在总结已有研究的基础上,预测恶性疟原虫ApiAP2蛋白质家族中未知功能蛋白质的调控机制,并开展对ApiAP2蛋白质家族发生蛋白质翻译后修饰功能的展望,为畜牧业研发原虫病疫苗提供借鉴与参考。; 郑雨昕张义伟姜宁; 关键词：疟疾恶性疟原虫基因调控转录因子蛋白质翻译后修饰

常染色体显性钙化不全型釉质发育不全相关基因序列相似性83蛋白质家族成员H及其突变的研究进展被引量：1: 2022年; 常染色体显性钙化不全型釉质发育不全(ADHCAI)是一种影响釉质结构的遗传性疾病,基本病变为釉质基质形成正常但无明显的矿化。该疾病具有明显的临床和遗传异质性,临床表现为患牙的釉质厚度正常而硬度降低,影响功能和美观。序列相似性83蛋白质家族成员H(FAM83H)在人体的多种组织和细胞中普遍表达,包括成釉细胞、成牙本质细胞和牙槽骨。该基因编码的细胞内蛋白质被认为与角蛋白细胞骨架和桥粒相关,在细胞内分子运输、细胞骨架网络调节和釉质形成中发挥作用。FAM83H基因中的许多突变已被证实可在不同人群中导致ADHCAI。近年来一些研究从囊泡运输、细胞骨架等多角度入手,探究FAM83H突变与AD‐HCAI发生发展之间的关系,本文就ADHCAI相关基因FAM83H及其突变的研究进展进行综述。; 郭思敏陈婷

蛋白质家族图谱: 提供了用于识别与疾病选择信息相关联的感兴趣候选实体的计算机实施方法的方法、装置、系统和计算机实施方法。该方法包括：接收预测为与疾病选择信息相关联的第一实体集；检索已知与疾病选择信息相关联的第二实体集；生成第一实体集的实体...; O·厄克斯勒

一种基于蛋白质家族聚类的PPI知识图谱表示学习方法: 本发明的基于蛋白质家族聚类的PPI知识图谱表示学习方法，通过以下步骤来实现：a).PPI知识图谱中实体分类；b).预表示学习；c).构建子父类损失函数；c‑1).距离误差平方和的计算；c‑2).距离误差平方和的归一化处理...; 刘容恺; 文献传递

基于转录组信息的黑果枸杞WD40蛋白质家族分析被引量：7: 2019年; WD40蛋白质为真核生物中一种常见蛋白质,广泛参与植物生长发育的多种生物过程,在蛋白质-蛋白质及蛋白质-DNA的相互作用中发挥重要作用。为系统分析黑果枸杞WD40蛋白质家族成员,本研究以黑果枸杞青色期、转色期和成熟期3个发育时期的果实转录组测序数据为基础,结合Nr、Nt、Pfam、KOG/COG、Swiss-prot、KEGG及GO 7个数据库和NCBI网站,对黑果枸杞WD40蛋白质编码基因进行筛选注释。结果表明,共得到77个黑果枸杞WD40蛋白质家族成员,黑果枸杞WD40蛋白质结构域组成多样,且在不同物种间高度保守;亚细胞定位预测分析表明,黑果枸杞WD40蛋白质家族成员多位于细胞核及细胞质中;黑果枸杞和拟南芥WD40蛋白质共建的系统进化树可分为五个亚家族; WD40蛋白质家族成员编码基因随果实发育的表达模式表明,黑果枸杞WD40蛋白质家族成员可能参与了其果实花青素的变化调控。本研究结果为枸杞WD40蛋白质的分离及功能研究奠定了一定的理论基础。; 严莉陈建伟王翠平仝倩王晨乔改霞李健; 关键词：黑果枸杞转录组测序

ECPF：高效的聚簇同源蛋白质家族拓展算法: 伴随着基因测序技术的飞速发展,蛋白质序列数据库也迎来了爆炸式增长。如何处理如此大量的蛋白质序列,如今已成为了不可避免的问题。一种处理方法是将同源蛋白质聚类到不同的蛋白质家族。那些隶属于同一个蛋白质家族的蛋白质可能拥有结构...; 左中扬; 关键词：蛋白质家族相似度蛋白质序列蛋白质功能预测; 文献传递

Bcl-2蛋白质家族调控细胞凋亡机制的研究进展被引量：61: 2017年; 细胞凋亡是一种受基因调控的响应凋亡刺激的细胞程序性死亡方式.通过线粒体途径引发的凋亡主要由Bcl-2(B-cell lymphoma 2)蛋白质家族成员之间复杂的相互作用进行调控,然而科学界对其具体的相互作用模式一直存在争议.首先综述了近年来Bcl-2蛋白质家族成员之间相互作用的生物学机制,然后总结了细胞凋亡具有双稳性和该家族成员相互作用模式的数学模型,最后通过对目前流行的3种作用模式(即直接激活模式、间接激活模式、统一模式)进行数值模拟和分岔分析,认为统一模式是更合理的作用模式.以期能更好地理解病理细胞中可能存在的作用机制,从而为因凋亡异常引起的癌症、阿尔兹海默症等疾病的治疗和控制提供思路.; 尹智勇杨俊元祁宏; 关键词：细胞凋亡癌症治疗

La蛋白质家族与肿瘤关系被引量：1: 2017年; La蛋白相关家族（La-related proteins,LARPs）包括LARP1、LARP1b、LARP3,（Genuine La）、LARP4a、LARP4b、LARP6和LARP7.LARPs结构包含中度保守的RNA识别模体（RNA recognition motif,RRM）和多个其他结构、运输元件,可定位于不同的亚细胞部位与RNA相互作用,在细胞转录和翻译等方面发挥重要的作用.人LARPs最初是在系统性红斑狼疮和Sjogren＆#39;s综合征患者的血清内发现的自体抗原,目前随着研究深入普遍认为LARPs作为一种RNA分子伴侣参与RNA代谢能发挥多种生物学功能.此前国内有学者研究验证LARPs能稳定乙型肝炎病毒（hepatitis B virus,HBV）的mRNA,帮助其在肝细胞中复制与翻译,在乙型肝炎进展中具有重要作用.近年发现,LARPs在多种恶性肿瘤如子宫颈癌、乳腺癌、肝癌和前列腺癌等的细胞增殖、分化、迁移、血管形成的调节等方面起重要作用.而恶性肿瘤的发生与演进是由环境与遗传因素相互作用而导致的许多基因突变,实际上基因突变产生的编码蛋白质执行细胞生命活动,因而LARPs在肿瘤中扮演的分子角色将可能在肿瘤的诊断与治疗中提供潜在的新靶点、新策略和新途径.; 童双梅潘佳倩汤静; 关键词：LA蛋白肿瘤

Bcl-2蛋白质家族调控细胞凋亡最优模式的研究: 在大多数细胞中，线粒体外膜的通透可诱发细胞凋亡，该途径主要由Bcl-2家族蛋白调控(因此也称为Bcl-2凋亡机制)。该家族蛋白具有不同的生物活性，可分为四类:效应者，保护者(也称抑制者)，激活者和致敏者。虽然目前对于Bc...; 尹智勇; 关键词：蛋白质细胞凋亡; 文献传递

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