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基于图卷积网络预测蛋白质-蛋白质结合亲和力的方法
本发明提出了一种基于图卷积网络的蛋白质蛋白质结合亲和力预测的方法,涉及生物信息学领域,基本原理如下:将蛋白质蛋白质复合物与相互作用区域分别转化为原子级别的图,通过基于图卷积网络构建的模型对复合物进行分子内和分子间节点...
吴欣雨左超
蛋白质-蛋白质结合亲和力预测方法、计算机和存储介质
本发明公开一种蛋白质蛋白质结合亲和力的预测方法,包括:获取蛋白质蛋白质复合物的结构信息,并根据所述结构信息计算所述蛋白质蛋白质复合物中原子的表面信息和界面信息;按照氨基酸类型将所述蛋白质蛋白质复合物中原子的表面信...
杨雍逍王攀朱宝亭
一种在基因转录水平评价蛋白质结合效率的方法、设备、介质和程序产品
本发明提供了一种在基因转录水平评价蛋白质结合效率的方法、设备、介质和程序产品,涉及生物分析领域。所述方法包括:获取至少一个待测SNP;基于SNP调取Ref和Alt序列对;提取所述序列对与Ref和Alt序列结合的调控蛋白质...
王宏徐良德
一种基于卷积块注意力机制密集网络的RNA-蛋白质结合位点判别方法
本发明涉及一种基于卷积块注意力机制密集网络的RNA‑蛋白质结合位点判别方法,属于生物信息学领域。首先,获取公共RNA‑蛋白质结合位点数据集,然后,采用4种特征提取方法构建特征空间,最后,运用基于卷积块注意力机制改进的密集...
马磊杨慧
一种蛋白质结合位点预测方法、装置、终端及存储介质
本发明公开了一种蛋白质结合位点预测方法、装置、终端及存储介质,涉及生物制药领域。所述方法通过获取待预测蛋白质蛋白质序列信息和蛋白质结构信息;根据所述蛋白质序列信息和所述蛋白质结构信息构建融合信息,根据所述融合信息确定所...
刘子敬章琳炜李煜幺宝刚
一种蛋白质结合位点预测方法、装置、终端及存储介质
本发明公开了一种蛋白质结合位点预测方法、装置、终端及存储介质,涉及生物制药领域。所述方法通过获取待预测蛋白质蛋白质序列信息和蛋白质结构信息;根据所述蛋白质序列信息和所述蛋白质结构信息构建融合信息,根据所述融合信息确定所...
刘子敬章琳炜李昱幺宝刚
一种蛋白质-蛋白质结合界面的筛选方法及装置
本发明公开了一种蛋白质蛋白质结合界面的筛选方法及装置,方法包括:首先确定目标蛋白质蛋白质对接构象和目标蛋白质蛋白质对接构象的界面和表面信息,利用构建的筛选模型然后基于目标蛋白质蛋白质对接构象的界面和表面信息,利用...
杨雍逍
一种蛋白质结合位点预测方法、系统、介质、设备及产品
本发明涉及蛋白质相关数据处理技术领域,本发明公开了一种蛋白质结合位点预测方法、系统、介质、设备及产品,包括:构建蛋白质分子的图,通过端到端的分层几何深度学习模型,预测得到结合位点;所述端到端的分层几何深度学习模型包括一层...
柳军涛张仕卓
一种蛋白质结合位点预测方法、系统、介质、设备及产品
本发明涉及蛋白质相关数据处理技术领域,本发明公开了一种蛋白质结合位点预测方法、系统、介质、设备及产品,包括:构建蛋白质分子的图,通过端到端的分层几何深度学习模型,预测得到结合位点;所述端到端的分层几何深度学习模型包括一层...
柳军涛张仕卓
一种药物-蛋白质结合亲和力预测方法
本发明属于数据挖掘技术领域,具体涉及一种药物‑蛋白质结合亲和力预测方法,包括:获取多模态的药物‑蛋白质数据,将其输入训练好的亲和力预测模型,得到预测值;所述亲和力预测模型的训练过程包括:获取多模态的药物‑蛋白质数据,将其...
万厚源 刘文裕 吴思奇刘彬

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唐祖明
作品数:64被引量:209H指数:8
供职机构:东南大学生物科学与医学工程学院
研究主题:蛋白质芯片 微生物 硅烷化 蛋白质结合 纤维表面
陆祖宏
作品数:679被引量:1,882H指数:21
供职机构:东南大学
研究主题:微阵列 碱基 生物芯片 基因芯片 LB膜
沈红斌
作品数:125被引量:194H指数:8
供职机构:上海交通大学
研究主题:蛋白质 蛋白质序列 蛋白质结构 冷冻电镜 网络
王伟
作品数:102被引量:228H指数:9
供职机构:河南大学
研究主题:黄河流域 影响因素 乡村 专业村 旅游
赵远
作品数:6被引量:0H指数:0
供职机构:河南大学
研究主题:蛋白质结合 结合位点 蛋白质 残基 药物