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基于叶绿体基因组的八角枫属及近缘属植物系统发育分析: 2025年; 为明确八角枫(Alangium chinense(Lour.)Harms)叶绿体基因组的结构特点及系统发育关系,通过Illumina高通量测序技术对八角枫叶绿体基因组进行测序,并进行组装、注释和结构分析。利用mVISTA和Geneious软件对八角枫、毛八角枫、高山八角枫、八角枫MG524996和八角枫NC044840叶绿体基因组进行同源比对和共线性分析,采用MEGA 11软件构建植物系统发育树。结果表明,八角枫完整的叶绿体基因组全长156 672 bp,呈双链环状结构,GC占37.69%;叶绿体基因组共有130个编码基因,包括81个蛋白质编码基因(PCGs)、38个tRNA转运基因、8个rRNA基因和3个假基因,其在叶绿体基因组序列中占比分别为62.31%、29.23%、6.15%和2.31%。同源比对和共线性分析发现,5种植物(八角枫、其他4种八角枫属植物)叶绿体基因组间具有高度相似性和共线性。系统发育分析表明,八角枫与高山八角枫亲缘关系最为接近,暗示他们在进化上具有共线性,推测该八角枫为新亚种。; 杨玉霞李静婷李颖苏晨闫睿魏泽昶; 关键词：叶绿体基因组八角枫属近缘属植物系统发育

基于甘蔗及其近缘属参考基因组开发SSR标记及数据库: 2025年; 甘蔗(Saccharum spp. hybrid)是重要的糖料和能源作物。甘蔗基因组复杂,群体遗传学研究相对落后。目前,甘蔗参考基因组仍有待完善。利用甘蔗及其近缘属参考基因组开发甘蔗SSR标记及数据库有助于推动甘蔗群体遗传学的研究。本研究基于3个甘蔗种(割手密种、热带种和栽培种)和2个甘蔗近缘种(芒和高粱)的基因组进行SSR检测,统计各基因组SSR的数量和类型,挑选多态性好的SSR标记对104份甘蔗及近缘属种质材料进行遗传多样性分析。在5个物种的基因组中共鉴定到了1,860,645个SSR,以单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复单元类型为主。基因组间SSR的共线性信息显示,甘蔗栽培种和其他物种间的亲缘关系由近到远为:R570、热带种、割手密种、芒、高粱;基于SSR及InDels标记的甘蔗种质资源的遗传多样性分析显示,斑茅92-105最先被单独划分,割手密种为一个类群,大茎野生种和热带种分为一个类群,栽培种为一个类群。最后,围绕5个基因组鉴定的SSR以及引物等相关信息,开发了一个基于Web界面的甘蔗SSR数据库。本研究为甘蔗研究和育种提供了重要的分子工具。; 匡博文韦妳刘金典陈美燕毛兴洁段维兴杨细平; 关键词：甘蔗 SSR标记数据库

玉叶金花属及其近缘属植物的叶脉序特征研究: 2024年; 玉叶金花属(Mussaenda L.)种间变异式样复杂,属内杂交现象突出,其分类一直备受争议。为探索玉叶金花属及其近缘属裂果金花属(Schizomussaenda Li)、假玉叶金花属(Psudomussaenda Wernham)叶脉序特征在属间及种间分类学意义,从而为其作为药用以及园林植物资源的鉴定、开发利用提供依据,该研究采用清净法制作叶脉标本,观察了22种该类群的叶脉序特征,基于叶脉序特征进行了聚类分析,并编制了分种检索表。结果表明:(1)玉叶金花属及其近缘属叶脉序特征具有一致性,一级脉都为羽状脉,间二级脉频度均为每个脉间区少于一条,粗二级脉与中脉夹角均为锐角,三级脉多为贯穿型,脉间区排列均不规则。(2)属间或属内种间有分类学价值的叶脉序特征为粗二级脉脉序类型、粗二级脉与中脉夹角、粗二级脉间距、粗二级脉与中脉连接方式、间二级脉及近缘二级脉的存在与否、三级脉贯穿类型、四级脉类型、游离端小脉分支情况、脉间区发育情况。(3)聚类分析显示该类群22种植物聚为12支,聚类分析中,裂果金花属及假玉叶金花属嵌入玉叶金花属内,显示了较近的亲缘关系。综上可知,玉叶金花属及其近缘类群的叶脉序特征可以为其分类提供新的研究资料。; 张朵李进段婷婷; 关键词：茜草科玉叶金花属叶脉序分类学聚类分析

中国北方地区牛肝菌科分子系统学及几个近缘属的分类学研究: 牛肝菌科是一类子实体肉质,多数伞菌状少数腹菌状的大型真菌,在食药用经济产业上和生态方面都扮演着重要的角色。本研究主要聚焦于缺乏细致研究的我国北方地区的牛肝菌科的物种。通过自采、馆藏和借阅的北方地区牛肝菌科物种标本,本研究...; 汪阳; 关键词：生物地理学

甘蔗属种及其近缘属种蔗茅的全基因组密码子偏好性分析: 2024年; 【目的】为解析甘蔗基因组的密码子使用特征,提高异源基因在甘蔗中的表达效率。【方法】以已发布的甘蔗属种(热带种LA-purple、割手密NP-X和AP85-441)及其近缘属种蔗茅(Yunnan2009-3)基因组为数据,利用Python、CodonW1.4.2进行密码子偏好性分析,同时通过中性绘图、ENC-plot、PR2-plot等分析探讨密码子偏好性形成的影响因素,并结合转录组测序数据分析密码子偏好性参数与基因表达水平的相关性。最后,基于RSCU均值与7个主要模式生物种(玉米、高粱、水稻、拟南芥、烟草、大肠杆菌、酿酒酵母)的密码子使用模式进行比较分析。【结果】显示热带种、割手密和蔗茅的基因组都富含GC,平均GC含量为56.3%,且GC3>GC1>GC2,倾向于使用以G/C结尾的密码子,平均ENC值为48.45,偏好性较低。中性绘图、ENC-plot和PR2-plot分析表明它们的密码子偏好性受到自然选择、突变压力等多种因素的共同影响,其中自然选择占主导作用。相关性分析表明密码子偏好性参数与基因实际的转录表达水平存在显著相关性,但相关性不强。根据RSCU和?RSCU值,确定了13个最优密码子,均以C或G结尾,密码子使用特性在全基因组和染色体组水平上无差异。通过比较发现,甘蔗的核苷酸组成及密码子偏好性与玉米、高粱和水稻较为相似,而与拟南芥、烟草、大肠杆菌和酵母具有显著差异。【结论】甘蔗热带种、割手密和蔗茅的密码子偏好性高度相似,其形成受自然选择和突变因素的影响。此外,对甘蔗优异基因功能异源验证时可优先选择玉米、水稻和高粱作为异源表达系统。; 田春艳李旭娟李旭娟毛钧李纯佳; 关键词：甘蔗属蔗茅基因组

藜属及近缘属植物（苋科）叶绿体基因组比较分析及物种特异性分子标记开发: 藜属(Chenopodium)及其近缘属植物因其丰富的营养价值和耐盐性而备受关注。然而,物种之间高度相似的形态特征和有限的基因组资源,极大地限制了藜属及其近缘属植物的研究和利用。叶绿体基因组结构保守、进化速率慢、富含遗传...; 魏子翔; 关键词：叶绿体基因组密码子偏好性分歧时间分子标记

中国小蝇狮属及其近缘属的系统发育和分类（跳蛛科：跳蛛亚科：斑蛛族）: 小蝇狮属Parvattus Zhang&Maddison,2012是蜘蛛目Araneae、跳蛛科Salticidae、跳蛛亚科Salticinae、斑蛛族Euophryini中报道自中国的一单型属,与产于中国及东南亚地区...; 王苇杭; 关键词：新属新异名比较形态学

中国良苔蛾属团及其近缘属分类学研究（鳞翅目：目夜蛾科：灯蛾亚科）: 本论文的研究对象是鳞翅目、夜蛾总科、目夜蛾科、灯蛾亚科的苔蛾族昆虫,检视标本主要为东北林业大学昆虫标本室馆藏标本,以及本人与实验室成员在学习期间前往我25省(区、市)所采标本,少部分标本借阅于南开大学昆虫标本馆。本研究共...; 赵婷婷; 关键词：鳞翅目分类学

来自小麦近缘属种抗锈病基因Lr53和Yr35遗传定位及候选基因分析: 小麦锈病是一类严重危害小麦生产的真菌病害,主要包括条锈病(stripe rust)、叶锈病(leaf rust)和秆锈病(stem rust)三种。其中,由小麦条锈菌(Puccinia striiformis f.sp....; 许斌洋; 关键词：候选基因

甘蔗属及其近缘属代表性种质的转录组比较分析: 2023年; 甘蔗近缘种斑茅(Tripidium arundinaceum)、甘蔗属内野生种割手密(Saccharum spontaneum)和大茎野生种(Saccharum robustum)具有茎部强壮、耐旱、耐涝、耐霜和抗病性等对现代甘蔗品种改良具有重要价值的性状。本研究通过比较甘蔗属及其近缘属四个代表性种质,包括一个甘蔗属近缘种质(斑茅)、两个甘蔗属野生种(割手密、大茎野生种)和一个甘蔗属驯化种(热带种)的转录组,以探讨它们在转录层面的差异。研究发现,甘蔗近缘种斑茅与甘蔗属野生种割手密(BM vs Y83)、甘蔗属内的两个野生种割手密与大茎野生种(Y83 vs N57)以及甘蔗属内的野生种割手密和驯化种热带种(N57 vs NJ)之间的差异表达基因主要涉及光合作用、次级代谢和信号转导等,这可能导致甘蔗属及其近缘属物种间在光合能力、抗生物和非生物胁迫能力以及营养利用方面存在差异。割手密在氮代谢表现出较斑茅和大茎野生种更强的潜力,表明其在氮素利用上可能更具优势。此外,割手密的特异表达基因涉及光感受器、昼夜节律时钟和开花途径,这可能与其开花特性相关。本研究还鉴定了甘蔗属及其近缘属、甘蔗属内野生种和驯化种之间的4325个直系同源基因,这些基因的正选择分析结果表明割手密可能在自然选择下逐渐改变基因表达模式以适应环境,而热带种从大茎野生种驯化后的分化和适应可能与植物激素信号转导的改变相关。; 李思程冯梦凡杨细平; 关键词：甘蔗斑茅割手密

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