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猪细小病毒自然弱毒N(PPV-N)VP1基因的扩增与生物信息学分析
对猪细小病毒自然弱毒PPV-NVP1基因扩增及测序,利用生物信息学技术预测VP1蛋白的二级结构与B细胞抗原表位以及分析该蛋白的氨基酸差异位点及密码子偏爱性。结果表明,PPV-NVP1基因与弱毒参考毒NADL-2VP...
赵武李斌梁家幸梁保忠白安斌姚瑞英黄安国何颖蒋玉雯
关键词:猪细小病毒PPV-N株VP1基因生物信息学分析亲缘关系
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猪细小病毒自然弱毒N(PPV-N)VP1基因的扩增与生物信息学分析
对猪细小病毒自然弱毒PPV-NVP1基因扩增及测序,利用生物信息学技术预测VP1蛋白的二级结构与B细胞抗原表位以及分析该蛋白的氨基酸差异位点及密码子偏爱性.结果表明,PPV-NVP1基因与弱毒参考毒NADL-2VP...
赵武李斌梁家幸梁保忠白安斌姚瑞英黄安国何颖蒋玉雯
关键词:PPV-N株VP1基因扩增生物信息学分析
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猪细小病毒自然弱毒N(PPV-N)VP1蛋白二级结构及B细胞抗原表位预测
PPV-N的VP1蛋白基因序列为材料,采用Chou-Fasman方法、Gamier-Robson方法和Karplus-Schultz方法来预测VP1蛋白的二级结构,用Kyte-Doolittle方法预测VP1蛋白的亲...
赵武李斌梁家幸梁保忠姚瑞英黄安国何颖蒋玉雯
关键词:PPV-N株VP1蛋白B细胞抗原表位
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猪细小病毒自然弱毒N(PPV-N)VP1蛋白二级结构及B细胞抗原表位预测
PPV-N的VP1蛋白基因序列为材料,采用Chou-Fasman方法、Garnier-Robson方法和Karplus-Schultz方法来预测VP1蛋白的二级结构,用Kyte-Doolittle方法预测VP1蛋白的...
赵武李斌梁家幸梁保忠姚瑞英黄安国何颖蒋玉雯
关键词:PPV-N株VP1蛋白B细胞抗原表位
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PPVN弱毒疫苗有效预防猪细小病毒
2007年
广西兽医研究所白安斌等,用3批PPV-N弱毒疫苗分别在3个规模化猪场进行了较大范围的区域试验,共免疫后备母猪32930头,观察其安全性和免疫效力,结果表明,3批苗均能使豚鼠产生良好的抗体反应,猪只注苗后食欲、体温均正常。无任何不良临床反应,平均每胎产健活仔10.96头,而死胎仅为0.52头,说明PPVN弱毒疫苗是预防猪细小病毒感染安全、有效的弱毒疫苗。
白安斌
关键词:猪细小病毒弱毒疫苗PPV细小病毒感染免疫效力规模化猪场
猪细小病毒自然弱毒NVP2基因的克隆、测序及生物信息学分析被引量:3
2010年
本研究对猪细小病毒(porcine parvovirus,PPV)自然弱毒N(PPV-N)VP2基因进行克隆、测序并利用生物信息学技术分析PPV-NVP2蛋白基因的同源性、遗传进化、密码子偏爱性、糖基化位点、磷酸化位点、B细胞抗原表位及其二、三级结构。结果表明:成功扩增出包含VP2基因完整目的片段(1901bp),构建了VP2基因的克隆重组质粒pMD18-T-VP2,测序获取VP2基因序列(1740bp)并将该序列登录到GenBank(HM355807)。PPVVP2基因属高度保守的基因;PPV-NPPV弱毒代表毒NADL-2亲缘性近,推测PPV-N属于弱毒;PPV-NVP2基因氨基酸密码子偏爱以A结尾的密码子;PPV-NVP2蛋白可能存在7个糖基化位点,其丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸可能分别有9、7、8个磷酸化位点,可能存在24个B细胞抗原表位;PPV-NVP2蛋白二级结构预测,α-螺旋占11.74%,β-折叠占22.97%,无规则卷曲占65.28%,而三维结构预测VP2蛋白主要以无规则卷曲为主,存在多个螺旋和折叠区域。本研究结果为进一步阐释PPV-N自然弱毒的分子机理提供依据,并为PPV分子诊断试剂及基因工程疫苗研究等提供有益借鉴。
李斌梁家幸赵武苏乾莲何颖梁保忠秦毅斌何苹萍
关键词:PPV-N株VP2基因测序生物信息学分析
猪细小病毒N的安全性试验
PPV-N常规接种量的5倍和10倍接种PPV HI抗体阴性四月龄小猪、后备母猪和怀孕母猪,接种后5、7、9天未能从血液中检测到病毒血症,鼻咽和直肠拭子未分离到病毒,无任何异常临床症状,母猪产仔正常,初生仔猪PPV H...
梁家幸白安斌梁保忠杜坚赵武李斌黄安国姚瑞英蒋玉雯
关键词:猪细小病毒PPV-N株
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猪细小病毒自然弱毒NVP1基因的扩增与序列分析
2008年
对猪细小病毒自然弱毒N(PPV-N)VP1基因扩增及测序,利用生物信息学技术预测VP1蛋白的二级结构与B细胞抗原表位,以及分析该蛋白的氨基酸差异位点及密码子偏爱性。结果表明,PPV-NVP1基因与弱毒参考毒NADL-2VP1基因同源性最高,亲缘关系最近。PPV-NVP1蛋白的二级结构较为复杂,以β-折叠为主,并有较多的转角和无规则卷曲区域,在序列的20~56、61~80、86~130、136~188区域为B细胞抗原表位的优势区域。PPV强、弱毒VP1蛋白存在5个氨基酸差异位点(T-365-I,G-528-D,Q-533-H,P-586-S,K-715-R),这些位点处氨基酸残基抗原性与毒力成正相关。PPV-NVP1蛋白在A、C、E、G、H、I、K、N、Q、R、S、T、V和Y氨基酸于密码子选择上存在一定的偏爱性。
李斌赵武梁家幸梁保忠白安斌姚瑞英黄安国何颖蒋玉雯
关键词:VP1基因生物信息学分析
猪细小病毒自然弱毒NVP1蛋白二级结构及B细胞抗原表位预测被引量:2
2008年
PPVN的VP1蛋白基因序列为材料,采用Chou—Fasman、Garnier—Robson和Karplus—Schultz预测VP1蛋白的二级结构,用Kyte—Doolittle法预测VP1蛋白的亲水性,用Emini法预测VP1蛋白的表面可能性,用Jameson—Wolf法预测VP1蛋白的抗原指数,然后综合分析VP1蛋白的B细胞抗原表位。结果表明,PPVNVP1蛋白的二级结构以β-折叠为主,并有较多的转角和无规则卷曲区域,在序列的20~56、61~80、86~130、136~188区域最有可能是B细胞抗原表位的优势区域。本研究为PPVN的自然弱毒分子机理以及反向疫苗学研究提供了一定的理论依据。
李斌赵武梁家幸梁保忠姚瑞英黄安国何颖蒋玉雯
关键词:VP1蛋白B细胞抗原表位
猪细小病毒自然弱毒N结构蛋白VP1基因的扩增及序列分析
设计两对引物,对猪细小病毒自然弱毒N(PPV-N)结构蛋白VP1基因进行分段PCR扩增与测序,并与中国湖北、四川及加拿大、西班牙等地PPV的VP1基因进行比对分析,结果表明PPV VP1基因变异很小,同时发现PP...
白安斌李斌梁家幸保忠姚瑞英黄安国杜坚陈西宁卢树莲赵武蒋玉雯
关键词:PPV-N株VP1基因PCR扩增测序
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梁家幸
作品数:190被引量:511H指数:13
供职机构:广西兽医研究所
研究主题:猪细小病毒 试剂盒 弱毒 N 猪流行性腹泻病毒
赵武
作品数:307被引量:803H指数:14
供职机构:广西兽医研究所
研究主题:猪细小病毒 试剂盒 弱毒 猪流行性腹泻病毒 N
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作品数:413被引量:1,033H指数:16
供职机构:广西大学
研究主题:猪细小病毒 试剂盒 弱毒 猪流行性腹泻病毒 N
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作品数:85被引量:260H指数:11
供职机构:广西兽医研究所
研究主题:猪细小病毒 弱毒 N PPV-N株 PPV
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