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喹啉酮类BRD4抑制剂的3D-QSAR 研究 2024年 QSAR 模型建立,研究了其化学结构和生物活性间的关系,并用计算机辅助药物设计(computer-aided drug design,CADD)设计出7个喹啉酮类抑制剂。结果表明,建立的CoMFA(q^(2)=0.926,r^(2)=0.997,r^(2)_(pred)=0.744)和CoMSIA(q^(2)=0.939,r^(2)=0.991,r^(2)_(pred)=0.786)模型具有较好的预测能力,基于这些模型设计的7个新喹啉酮类BRD4抑制剂具有高活性,并对其进行ADMET性质评价和类药性分析。以上研究结果有助于改造和开发更加有效的喹啉酮类BRD4抑制剂。关键词：3D-QSAR COMFA COMSIA ADMET 类药性 自分泌运动因子(ATX)抑制剂的3D-QSAR 和分子对接研究 2024年 QSAR )和分子对接研究。采用CoMFA和CoMSIA模型对40个ATX抑制剂构建3D-QSAR 模型,阐明了抑制剂结构与生物活性之间的关系,同时利用Surflex-Dock进行分子对接,研究该类化合物与ATX蛋白的结合模式。CoMFA模型(q^(2)=0.668,r^(2)=0.992)和CoMSIA模型(q^(2)=0.727,r^(2)=0.988)表明其具有良好的预测能力和机制可解释能力,分子对接表明上述化合物与ATX均能很好地结合,Ser306、Glu232和His121是影响上述化合物与ATX结合的主要氨基酸残基。本研究为进一步设计合成ATX抑制剂提供理论依据,对开发高效ATX抑制剂具有指导意义。关键词：自分泌运动因子 抑制剂 三维定量构效关系 构效关系 基于3D-QSAR 的多氟烷基磷酸二酯对斑马鱼的脂毒性预测 2024年 QSAR ),分别对6∶2和8∶2的DiPAPs与PPARβ结合亲和力进行预测;基于分子对接分别研究6∶2和8∶2 DiPAPs与PPARβ的相互作用;分别考察6∶2和8∶2 DiPAPs暴露对斑马鱼Pparβ表达的影响,对3D-QSAR 预测结果进行验证。结果表明,6∶2和8∶2 DiPAPs的半数竞争效应浓度(pIC_(50))的预测值分别为3.73,3.63 mol/L,说明二者可能均具有过氧化物酶体增殖活性;6∶2和8∶2 DiPAPs主要通过氢键和疏水作用与PPARβ结合,且6∶2 DiPAP结合活性更强;二者分别暴露后,PPARβ表达量均显著上调,且50 ng/L 6∶2 DiPAP组比50 ng/L 8∶2 DiPAP组的表达量更高,与模型预测结果一致。综上,6∶2和8∶2 DiPAPs可通过影响斑马鱼PPARβ的表达,产生脂毒性。研究结果可为评估DiPAPs这类新型全氟/多氟烷基化合物在水环境中的生态风险提供理论依据。关键词：三维定量构效关系 脂毒性 过氧化物酶体增殖物激活受体 利用CoMFA和CoMSIA对氟乐灵抗体识别特异性进行3D-QSAR 分析 2024年 QSAR )研究,并建立相应的模型。结果表明:CoMFA模型的交叉验证系数(r_(cv)^(2))为0.497,非交叉验证系数(r_(ncv)^(2))为0.999;CoMSIA模型的交叉验证系数(r_(cv)^(2))为0.498,非交叉验证系数(r_(ncv)^(2))为0.979。CoMFA模型中立体场和静电场的贡献值分别为63.10%和36.90%,CoMSIA模型中疏水场、静电场和立体场的贡献值分别为54.90%、38.40%和6.70%。各力场的贡献比例表明基团的疏水作用对化合物影响较大,推测出抗原疏水性的增强特别是N,N-二丙基部位的疏水性增强,有利于诱导出亲和力更强的抗体,为设计氟乐灵半抗原提供了信息。关键词：氟乐灵 多克隆抗体 向列相液晶分子结构与黏度关系研究及BPNN-QSAR 模型建立 2024年 QSAR 定量构效模型,模型测试组预测值跟真实值之间的相关系数q^(2)=0.607>0.5,说明模型可用于液晶化合物的黏度性能预测,并对影响黏度性能的分子结构描述符进行了探讨.从实际应用出发结合本课题研究,设计了两个系列7个大双折射率液晶分子,BPNN模型测试黏度量度小于同类型分子,实验测试值与模型测试值相近.关键词：向列相液晶 黏度 分子结构 定量构效关系 苯并咪唑类化合物抗宫颈癌活性的3D-QSAR 及分子对接研究 2024年 QSAR )分析,同时采用分子对接研究化合物与PI3Kα亚型激酶4JPS、微管蛋白1SA0之间的相互作用方式。结果与结论构建的CoMFA(q^(2)=0.618,R^(2)=0.877)和CoMSIA(q^(2)=0.612,R^(2)=0.855)模型具有良好的统计学意义和预测能力,依据该模型设计9个新化合物,其中化合物33预测值最高。分子对接显示化合物33可与4JPS的Asn467、1SA0的Asp251氨基酸残基形成氢键作用,结合能高于模板化合物16。本研究可为苯并咪唑类PI3Kα和微管蛋白双重抗宫颈癌药物的设计和结构优化提供参考。关键词：3D-QSAR 分子对接 双重抑制剂 吴茱萸肝毒性机制的阐明——基于QSAR 毒性预测和代谢组学研究 2024年 QSAR )构建,通过吸收、分布、代谢、排泄和毒性预测因子(ADMET Prodictor)预测化合物的潜在毒性。此外,研究整合了服用潜在毒性成分后的血清代谢组学分析,以阐明潜在毒性物质对小鼠代谢的影响。[结果]比较不同提取方法及炮制前后对小鼠的急性毒性,吴茱萸醇提物毒性最高,吴茱萸毒性的靶器官为肝脏。吴茱萸醇提物的生物碱组分具有较强的细胞毒性。ADMET Predictor对吴茱萸的潜在毒性进行了计算和预测,认为生物碱是导致吴茱萸毒性的主要原因。而吴茱萸碱在体外显著减少细胞数量,提高线粒体膜电位。吴茱萸碱给药后,小鼠血清代谢组学对不同的代谢产物进行了显著鉴定,其中胆汁酸代谢和类固醇激素生物合成是肝毒性的关键途径。[结论]通过比较不同提取方法在加工前后的急性毒性,阐明吴茱萸炮制品临床应用的科学意义。将基于QSAR 的毒性预测与体内外毒性筛选相结合,可以鉴定吴茱萸的潜在毒性靶器官和毒性成分。通过代谢组学研究,初步揭示吴茱萸的肝毒性可能与胆汁酸代谢和类固醇激素生物合成有关。本研究为阐明吴茱萸的作用机理、评价其安全性和质量奠定了基础。关键词：吴茱萸碱 肝毒性 LD50 新型查尔酮衍生物抗乳腺癌活性的3D-QSAR 模型构建及分子设计 2024年 QSAR )研究。其中14个化合物作为训练集用于构建3D-QSAR 模型,其余化合物(含模板分子)作为测试集对所建模型进行验证。所建3D-QSAR 模型的交叉验证系数R^(2)_(CV)为0.569,非交叉验证系数R^(2)为0.974,说明所建模型具有良好的稳定性和预测能力。该模型中立体场、静电场对pIC_(50)的贡献分别为58.8%和41.2%,表明影响该类化合物抗肿瘤活性的主要因素是取代基的疏水性、空间位阻和电荷分布。通过对模型的分析,设计了5个具有较高pIC_(50)的新化合物,有待通过后续医学实验加以验证。关键词：三维定量构效关系 分子设计 陕西茯茶抗氧化成分的提取及其定量构效关系(QSAR )研究 2024年 QSAR )的研究可以为陕西茯茶抗氧化产品的开发提供理论依据。关键词：溶剂萃取 抗氧化性 茯砖茶 定量构效关系 In silico identification of antiviral compounds for the treatment of chikungunya virus infection:qsar modelling and md simulation analysis 2024年 QSAR model and molecular docking.Top binders(5279172,78161839,6474310,and 5330286)were selected for MD simulation based on the control(Silvestrol).All compounds had the highest binding scores,with 78161839 showing the most consistent RMSD and the least conformational variation,indicating high stability.It also showed the lowest binding free energy(ΔG¼31.31 kcal/mol),indicating energetically favourable binding.PCA and FEL also depicted the stable complex confirmation of the protein and 78161839 complex during the 100 ns simulation.Overall,this study aimed to identify helicase function antiviral binders that could be experimentally tested for treating CHIKV.关键词：HELICASE
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