李向真
作品数： 3被引量：27H指数：1
  • 所属机构:中国药科大学生命科学与技术学院
  • 所在地区:江苏省 南京市
  • 研究方向:生物学

相关作者

李娟
作品数：9被引量：33H指数：2
供职机构：南京大学医学院附属鼓楼医院
研究主题：代谢网络 百科全书 路径图 代谢途径 生物信息学
方慧生
作品数：80被引量：244H指数：9
供职机构：中国药科大学生命科学与技术学院
研究主题：蛋白质 褶合光谱法 神经网络 光谱分析 W
刘子朋
作品数：3被引量：30H指数：2
供职机构：中国药科大学生命科学与技术学院
研究主题：生物信息学 百科全书 路径图 代谢网络 代谢途径
艾观华
作品数：7被引量：12H指数：3
供职机构：中国药科大学
研究主题：药物 癌症诊断 高亲和力 多肽 整合素
郭诚
作品数：1被引量：0H指数：0
供职机构：中国药科大学生命科学与技术学院
研究主题：蛋白质 侧链 数据库建立 优势构象
作品列表
KEGG数据库的进展及其在生物信息学中的应用被引量：27
2012年
KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库作为整合了基因、酶、化合物及代谢网络信息的综合性数据库,在生物信息学研究中提供了非常重要的平台。首先,人工获得实验数据并将其组织为计算格式,构建成一个系统功能知识体系:包括KEGG通路图,BRITE等级分类以及KEGG modules。其次,建立并完善跨物种注释步骤KO,把基因组同分子网络联系起来。文章主要介绍KEGG数据库的最新进展以及KEGG在生物信息学中的应用。KEGG特有的图形代谢通路以及KO注释,对于重构代谢网络以及跨物种的代谢网络分析提供了很好的信息,KEGG数据库在生物合成以及药物设计方面将会得到越来越广泛的应用。
李向真刘子朋李娟方慧生
关键词：代谢网络生物信息代谢途径路径图
RNAProbeDesigner:mRNA探针特异性序列搜索方法
2012年
mRNA不仅是生物体内蛋白质合成的"图纸",还参与生命活动的很多调节过程。随着分子影像技术的发展,mRNA探针在医药领域的应用越来越广泛。探针的特异性是衡量探针效果的重要指标。本文基于BLAST的序列搜索方法,根据目标mRNA中的每个片段与细胞中其他RNA的相似程度,筛选可用于特异性识别mRNA的寡核苷酸片段,并将该方法编写为一套自动化的mRNA探针特异性序列的搜索程序——RNAProbeDesigner。选取4种蛋白的mRNA对该程序进行测试,结果显示,该程序搜索出的片段中,有部分结果在以往的文献中已被报道用于相应探针的设计,从而证明了该方法的可靠性。
刘子朋艾观华李向真徐晓燕张莹李娟方慧生
关键词：BLAST探针设计
平均结构相似性方法在蛋白质侧链优势构象数据库建立的应用
2011年
蛋白质侧链的研究尤其是天然构象预测的侧链安装是非常重要的研究课题之一。文章基于结构平均相似性方法,初步构建了一个蛋白质侧链优势构象数据库,由于它在总体上与各种环境下的侧链构象相似性最大,为蛋白质天然构象预测的侧链安装提供了很好的构象,可以为蛋白质构象的优化节省一定的时间。
李娟李向真郭诚薛林锋陆佳方慧生