国家自然科学基金(30771371)
- 作品数：13 被引量：61H指数：4
- 相关作者：张锐郭三堆周焘徐德昌张晓更多>>
- 相关机构：中国农业科学院生物技术研究所哈尔滨工业大学长春理工大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技部科研院所技术开发研究专项黑龙江省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 陆地棉雄性不育恢复系18R的BAC文库构建被引量：2
- 2009年
- 18R雄性不育恢复系农艺性状优良,恢复性状稳定,对不育系能够100%恢复,是研究棉花三系互作的重要材料。本研究以pCC1BAC(BamHI)为载体,构建了18R的细菌人工染色体(BAC)文库。建立的文库包含139,200个BAC克隆。分析结果表明,BAC文库DNA插入片段为50～200 kb,91%的克隆插入片段为80～150 kb,平均102 kb,空载率<2%,覆盖6.3倍基因组。
- 周焘郭红媛张锐梁成真石雅丽郭三堆
- 关键词：棉花雄性不育恢复系细菌人工染色体文库
- 棉花育性相关基因GhPG2的克隆与表达分析被引量：3
- 2009年
- 多聚半乳糖醛酸酶家族是一个细胞壁水解酶,在许多高等植物的花粉中都具有高水平外切多聚半乳糖醛酸酶(PG)活性,可能在花粉成熟和花粉管伸长中发挥重要作用。利用已报道与恢复基因连锁的分子标记STS679筛选陆地棉Y18恢复系核基因组BAC文库,获得一个阳性克隆Z55E7,对该克隆测序获得6个基因,其中一个为编码多聚半乳糖醛酸酶(polygalacturonase)基因,暂被命名为GhPG2。在棉花细胞质雄性不育系、保持系和恢复系中对该基因进行序列和表达分析,以便进一步了解该基因与棉花细胞质雄性不育的关系。从BAC克隆中分离到GhPG2基因,对其进行序列分析,以半定量RT-PCR和实时定量PCR分析该GhPG2基因在棉花恢复系、保持系和不育系各个组织中的表达模式。分离到GhPG2基因的基因组序列为1518bp,其开放阅读框序列为1239bp,共编码412个氨基酸,包含PG基因家族的4个保守结构域。系统进化树分析表明,GhPG2基因与其他物种花粉表达的PG基因同属C分支。表达分析表明,该基因在恢复系和保持系的花药、花瓣和VI级花蕾中高表达,而不育系的相应组织该基因表达量明显降低。GhPG2基因归类于花粉表达的一类PG基因。实验结果暗示GhPG2基因可能与棉花正常的花器官发育相关。
- 侯思宇张锐郭三堆
- 关键词：棉花多聚半乳糖醛酸酶花粉发育表达谱分析
- miRNAs芯片数据的聚类分析与羽扇豆醇抗癌途径预测
- 2011年
- 羽扇豆醇是一种植物天然提取物,具有高效低毒的抗癌活性,对于药物开发领域有很高价值。目前对其抗癌机制还不是十分明确。使用TaqMan MicroRNA Assay芯片技术,从羽扇豆醇处理的hela细胞中miRNA的差异表达入手,探索扇豆醇抗癌分子途径。运用聚类分析等统计学方法和targetscan,RNAfold等序列分析工具进行信号组分的预测筛选,再结合对NC-BI,Gene Ontology等大型生物信息数据库的检索,最终在生物信息学层面上,分析得到hela细胞中羽扇豆醇抗癌的分子调控途径,即以受体酪氨酸激酶ERBB4介导的,hsa-miR-23b,hsa-miR-200b等几种miRNA参与的分子通路。
- 刘大川代翠红徐德昌
- 关键词：羽扇豆醇MIRNAERBB4生物芯片
- 环二肽生物活性的研究进展被引量：20
- 2011年
- 随着越来越多的天然产物环二肽被发现,人们对其各种生物活性的研究也随之增多。本文综述了近20年来,在环二肽及其类似物生物活性方面的研究进展,其中主要包括:胞间信息传递、抑制毒素、促癌细胞凋亡和镇痛作用等。
- 卢曦元徐德昌
- 关键词：毒素
- 棉花细胞质雄性不育与育性恢复研究进展被引量：7
- 2010年
- 棉花细胞质雄性不育在杂种优势的利用上具有重要的作用。利用棉花细胞质雄性不育和育性恢复系统突破了传统人工去雄杂交育种的瓶颈,为棉花杂交种制种的商业化推广展现了光明的前景。详细阐述了棉花细胞质不育系和恢复系遗传学的研究及利用,细胞质雄性不育相关线粒体基因、育性恢复基因相连锁分子标记的开发以及恢复基因的遗传精细定位,育性相关基因的克隆等方面的研究工作,提出了存在的问题,展望了今后工作的研究方向。
- 侯思宇张锐张晓郭三堆
- 关键词：棉花细胞质不育育性恢复基因分子标记
- 抗菌肽在棉花、烟草组织培养中的应用初探被引量：4
- 2008年
- 经0．1％氯化汞处理5min后，用无菌水冲洗3～5次，再用0．12mg／mL抗菌肽溶液浸泡棉花去壳种子能有效地防止棉花组织培养中常见的真菌污染，且对棉花根系的发育没有影响，同时在愈伤诱导阶段使用抗菌肽对棉花愈伤没有影响。在烟草组织培养中使用抗菌肽对愈伤及芽和芽生根没有影响，单独使用抗菌肽对细菌的杀菌效果没有头孢菌素好，但是抗菌肽与头孢菌素配合使用能有效地防止细菌污染。经初步研究抗菌肽可以应用于棉花、烟草组织培养，并对组织培养中的污染有良好的防治效果。
- 贾云超白玮张锐罗淑萍郭三堆
- 关键词：污染抗菌肽
- 外源基因在烟草绿色组织中的高效表达研究
- 2011年
- 研究外源基因在受体绿色组织中的特异表达情况,分别构建由棉花PsbP启动子驱动的GUS基因及CP4 epsps基因的植物表达载体pBI121-P、pBI121-PE。农杆菌介导法转化到烟草中,获得20株转pBI121载体、40株转pBI121-P载体和32株转pBI121-PE载体的烟草阳性植株。组织化学染色分析表明,GhPsbP启动子驱动的GUS基因只在转基因烟草的叶片和茎中表达,在根中不表达;Real-time PCR分析表明,PsbP启动子驱动CP4 epsps基因在叶和茎中的表达量分别是根中的15倍和10倍;草甘膦抗性试验证明,PsbP启动子驱动的CP4 epsps基因在烟草叶及茎的绿色组织中的表达量足以忍受1%浓度草甘膦的毒害。证明GhPsbp启动子可以有效地驱动外源基因在烟草的绿色组织中高效特异的表达。
- 杨大伟周焘张锐罗淑萍郭三堆
- 关键词：GUS活性REAL-TIMEPCR特异表达
- 优化的反向PCR结合TAIL-PCR法克隆棉花线粒体atpA双拷贝基因及其侧翼序列被引量：8
- 2012年
- 双拷贝基因及其侧翼序列的克隆是分子生物学中的一个难点。将优化的反向PCR(Inverse PCR,iPCR)与TAIL-PCR相结合,有效地克隆双拷贝基因及其侧翼序列。先用Southern blotting方法确定一种能获得合适长度片段的限制性内切酶,然后用优化的iPCR方法对该酶切产物进行自连和扩增,将2个拷贝的侧翼序列区分开。根据iPCR结果,进一步用TAIL-PCR扩增更远侧翼的序列。利用这套方法,获得了棉花可育胞质和不育胞质线粒体双拷贝atpA基因的所有EcoR I限制片段(2.2～5.1 kb)和HindⅢ限制片段(8.5～11.7 kb),克隆到2个拷贝各自的侧翼序列。研究结果说明,优化的iPCR与TAIL-PCR相结合是克隆双拷贝基因及其侧翼序列的一种高效方法。
- 张晓张锐孙国清史计孟志刚周焘侯思宇梁成真于源华郭三堆
- 关键词：反向PCRTAIL-PCR细胞质雄性不育棉花ATPA侧翼序列
- 基于同源搜索的甜菜miRNAs计算识别被引量：1
- 2008年
- microRNAs(miRNAs)是一类调控真核基因转录后表达的非编码小分子RNA,在调节生物功能方面起着重要的作用,采用基于同源搜索的计算方法预测未知miRNAs是当前发现和鉴定miRNAs的有效策略之一,甜菜是一种重要的制糖工业原料,其miRNAs的识别尚未见报道,本文根据公共数据库中的甜菜EST和GSS信息,采用Blastn同源搜索技术,预测了甜菜(Beta vul-garis)中的候选miRNAs。通过分析候选miRNAs的序列特征,包括碱基错配、二级结构、(A+U)含量、能量水平等,从中获得了54个miRNAs,其中,3个miRNAs与miRBase中已知的其他物种高度相似的序列,其余可能为新miRNAs。
- 徐德昌李勇程大友代翠红朱延明
- 关键词：MIRNAS生物信息学预测甜菜
- 棉花生殖器官发育的分子生物学研究进展被引量：3
- 2008年
- 棉花生殖器官发育与棉花的经济价值紧密相关,因此一直以来都是研究热点。随着棉花三系育种体系的应用推广,棉纤维发育相关基因的克隆、棉花生殖器官高效表达启动子的克隆和应用,棉花生殖器官发育的分子生物学研究的重要性也日益凸显。为方便相关研究人员了解该领域的最新进展,就国内外在棉花核质互作雄性不育、核不育、棉纤维发育以及棉花生殖器官特异型启动子等方面取得的分子生物学研究进展作了详细介绍,并对以上各方面的研究趋势进行了展望。
- 周焘张锐孟志刚孙国清孙书琦郭三堆
- 关键词：棉花生殖器官发育分子生物学克隆
