安徽省高校省级自然科学研究项目(KJ2007B173)
- 作品数：5 被引量：23H指数：3
- 相关作者：殷志祥支凌迎黄晓慧崔建中孙侠更多>>
- 相关机构：安徽理工大学华中科技大学福建师范大学更多>>
- 发文基金：安徽省优秀青年科技基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术理学更多>>
- 编码问题在DNA计算中的现状及展望
- 2010年
- 在DNA计算中DNA编码的质量和数量都对所得到的解空间有重要的影响。文中首先简要的介绍了DNA计算概况,然后通过目前在DNA编码设计的过程中所用的约束条件大概的介绍了编码问题的现状。通过编码设计的方法和评价标准指出了DNA编码问题目前的缺陷并且展望了DNA编码中需要解决的问题。
- 范胜殷志祥丁啸汪勇
- 关键词：DNA计算
- 可满足问题的分子信标计算模型(英文)被引量：10
- 2008年
- 分子信标(Molecular Beacon)是一种发夹状的荧光探针,它可以特异地和那些与分子信标的环(Loop)互补的核酸靶序列杂交,具有单个碱基错配的检测能力.肽核酸(Peptide Nucleic Acid)是人工合成的核酸(DNA)的类似物.PNA骨架为酰胺键,与DNA补链杂交更稳定,可以阻止聚合酶延伸反应.文中将可满足问题的约束变量编码于分子信标的环部识别区,通过分子信标与使得给定范式为真的变量的PNA补链杂交,再利用PNA链可以阻止聚合酶延伸反应的性质,用限制性内切酶EcoRI降解对应于非解的分子信标,最后通过加热表面使分子信标构形发生变化,产生荧光读解.提出的可满足问题的分子信标计算模型具有可靠性高、无需观察和记录计算的中间结果、读解简单等优点.
- 殷志祥崔建中支凌迎孙侠黄晓慧
- 关键词：DNA计算分子信标肽核酸荧光
- DNA自组装的可满足性问题模型被引量：9
- 2011年
- DNA自组装技术在DNA计算和纳米技术领域都发挥着极其重要的作用,许多小规模NP完全问题都可以通过自组装模型得以解决.文中以可满足问题为模型,通过构造范式中变量的特殊补链,使其与初始数据库中初始DNA链发生杂交反应,形成发夹结构,利用形成发夹结构的DNA链与没形成发夹结构的DNA链长度不同的特点,通过凝胶电泳将这些带发夹的DNA链提取出来;然后加入与这些特殊补链完全互补的DNA链,在一定温度下,通过碱基互补配对原则,发夹结构又将被重新打开.该模型充分利用了DNA分子间的自组装能力,在计算过程中只需要用到凝胶电泳操作,在一定程度上大大减少了因生物操作过多而引起的各种实验误差.
- 宋勃升殷志祥甄诚华程
- 关键词：DNA计算NP完全问题自组装
- DNA计算研究概述与分析被引量：6
- 2009年
- 基于生化反应机理的DNA计算模型受到科学领域内许多不同学科学者们的关注。DNA计算已经形成国际科学前沿领域内研究的一个新的热点。主要介绍了Sticker模型的应用及布尔电路的仿真应用,并分析了DNA计算模型中存在的问题。最后,简要介绍了DNA计算研究存在的问题及未来的研究方向。
- 支凌迎殷志祥黄晓慧胡娟
- 关键词：DNA计算
- 解非线性不等式组的L-M方法被引量：1
- 2009年
- 文章研究了非线性不等式组的求解问题,利用等价转化把非线性不等式组转化为非线性方程组来加以求解,通过引进光滑参数构造了一个新的光滑函数来逼近方程组问题中的目标函数,利用构造的光滑函数给出了相应的求解非线性方程组的Levenberg-Marquardt算法,并在一定的条件下证明了该算法的整体收敛性。
- 蒋利华殷志祥马昌凤
- 关键词：非线性不等式组非线性方程组LEVENBERG-MARQUARDT算法整体收敛性
