黑龙江省教育厅科学技术研究项目(12521149)
- 作品数:2 被引量:17H指数:2
- 相关作者:束永俊郭长虹王丹苏文悦王明波更多>>
- 相关机构:哈尔滨师范大学更多>>
- 发文基金:黑龙江省教育厅科学技术研究项目国际科技合作与交流专项项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 小麦长链非编码RNA的预测及功能分析被引量:4
- 2013年
- 生物体有部分基因被转录成RNA,但是不编码相应蛋白质,称为长链非编码RNA(lncRNA)。它们参与基因的表观调控,这一过程对动物、植物的生长发育都有重要作用,但是,目前植物中发现和研究的lncRNA较少。为了研究lncRNA在植物中的功能,本研究建立了基于小麦全长cDNA的lncRNA识别程序。从6162条小麦全长cDNA中发现了231条lncRNAs,并从中鉴定出两个新miRNAs,这表明lncRNAs可以通过形成miRNAs前体基因形成其功能。此外,通过序列富集分析,我们从小麦lncRNAs中鉴定出三个保守的调控元件,结果显示小麦lncRNAs可能通过和其它蛋白质或DNA等分子作用,进而参与小麦生长、发育等过程的调控,这些结果对进一步研究植物体内的lncRNA的功能和作用机制具有重要意义。
- 束永俊张晶红王明波郭东林王晓萍郭长虹
- 关键词:小麦长链非编码RNA全长CDNA微小RNA
- 利用比较基因组学开发山羊草属InDel分子标记被引量:13
- 2012年
- 为开发和利用小麦野生近缘种的优异基因,采用比较基因组学方法,通过拟斯卑尔脱山羊草EST(expressed sequencetag)与小麦UniGene序列的比对分析,发现山羊草插入/缺失(InDel)位点137个,在这些位点两端序列设计引物24对,通过在15个小麦野生近缘属种基因组DNA的扩增分析,发现11对引物具多态性,可以作为InDel标记。这些包含突变位点的基因涉及亚细胞定位、蛋白质结合与催化以及代谢等过程。
- 吴磊王丹苏文悦郭长虹束永俊
- 关键词:比较基因组学小麦