教育部科学技术研究重点项目(105146)
- 作品数：9 被引量：71H指数：6
- 相关作者：谢建平王洪海胡昌华刘雪梅宋洁更多>>
- 相关机构：西南大学复旦大学上海市肺科医院更多>>
- 发文基金：教育部科学技术研究重点项目国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 粟酒裂殖酵母全基因组中含信号肽蛋白质的研究被引量：9
- 2007年
- 对粟酒裂殖酵母全基因组3条染色体上的4,997个蛋白序列进行了全局性的分析,利用signalP3.0软件分析这些蛋白的N-末端信号肽序列,预测有N-末端分泌信号肽序列的蛋白196个;利用TMpred软件分析跨膜结构,预测跨膜蛋白117个;使用PrositeScan程序分析膜脂蛋白的脂结合位点,预测有膜脂结合蛋白13个,进而预测分泌性蛋白序列66个。使用TargetP分析66个分泌蛋白的蛋白序列,研究这些蛋白在细胞中的定位。这些分泌蛋白的功能涉及粟酒裂殖酵母的营养、生殖、细胞间以及细胞与环境间的交流等许多方面,对细胞的生存和繁殖有重要意义,在系统生物学的研究中有重要参考价值。粟酒裂殖酵母分泌组的研究也将为粟酒裂殖酵母作为药物筛选模型以及开发为外源蛋白表达的宿主提供基础。
- 刘玉岭柳云帆谢建平
- 关键词：粟酒裂殖酵母信号肽膜脂蛋白分泌蛋白
- 猫爪草提取物对结核分枝杆菌临床分离株的可能作用靶标被引量：20
- 2006年
- 利用双向电泳技术,对猫爪草提取物作用前后的结核分枝杆菌临床分离株的全细胞蛋白表达图谱进行差异比较和分析,发现其中22个蛋白质斑点的浓度具有差异,利用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱技术,对其中4个表达明显下调和1个明显上调的蛋白质斑点进行分析鉴定,获得5个明确的肽质量指纹图谱.通过数据库检索,确定这5个蛋白质分别为S-腺苷甲硫氨酸合成酶、吲哚-3-甘油磷酸合酶、烯酰-CoA水合酶、琥珀酰辅酶A合成酶和60 kD的分子伴侣2.其中前4个分子是首次报道参与结核分枝杆菌的重要生理活动.该结果有助于了解猫爪草提取物对结核分枝杆菌生理的影响,为进一步确定中药猫爪草提取物对结核分枝杆菌的作用靶标和机理提供了基础.
- 谢建平何颖乐军胡昌华王洪海唐翠魏秀莉梁莉刘雪梅宋洁
- 关键词：猫爪草结核分枝杆菌S-腺苷甲硫氨酸合成酶
- 微生物药物外排泵及其抑制剂研究被引量：10
- 2008年
- 细菌自身的不断进化及抗生素的不合理使用导致了耐药性细菌的出现和蔓延,微生物的主动外排是导致细菌产生多重耐药的重要原因。微生物外排泵的研究是目前的热点之一,也被认为是开发新抗生素的理想靶标。本文从基因组和比较基因组水平对外排泵的类型、作用机制、表达调控及研究方法等方面概述,并结合正在开展的分枝杆菌的药物外排泵进行了比较基因组分析。这些工作有利于开发新的抗生素或抗生素增效剂。
- 龙泉鑫周培富吴宗辉王洪海谢建平
- 关键词：药物外排泵耐药性分枝杆菌基因组
- 分枝杆菌噬菌体整合及裂解的分子机理
- 2005年
- 结核病仍旧威胁着全球人类健康,中国是结核病高发国家之一,寻求新的药物和疫苗势在必行。随着对噬菌体研究的深入,分枝杆菌噬菌体成为结核病新型药物发现和药敏实验的研究热点之一。噬菌体进入宿主菌体内,以裂解和溶源两种途径进入循环。以分枝杆菌的溶源性噬菌体为例,综述了分枝杆菌噬菌体整合和裂解分子机理。分枝杆菌溶源性噬菌体的整合需噬菌体基因组的附着位点attachment site(attP),宿主菌分枝杆菌基因组的附着位点attachment site(attB),整合酶integrase(Int)和整合宿主因子integration host factor(mIHF)。部分溶源性噬菌体如Ms6进入裂解循环,复制转录组装成新的子代噬菌体,在裂解素(Lysin)和穿孔素(Holin)的协同作用下裂解宿主菌,释放子代噬菌体。目前国内未见对分枝杆菌噬菌体的研究报道。研究分枝杆菌噬菌体整合及裂解机理对结核病治疗新药开发有一定的启示。
- 申严杰胡昌华王洪海谢建平
- 关键词：分枝杆菌噬菌体裂解
- 结核分枝杆菌膜蛋白的异源表达与纯化研究进展被引量：5
- 2007年
- 膜蛋白是一类与生物膜相互作用、具有重要功能和独特结构的蛋白质。异源表达纯化一直是了解膜蛋白结构和功能的重要瓶颈。结核分枝杆菌作为典型的胞内致病菌,其膜蛋白的研究具有很好的代表性以及重要意义。目前用于表达膜蛋白的有大肠杆菌、酵母、哺乳动物细胞等表达系统,但结核菌膜蛋白的表达宿主还往往局限于大肠杆菌。异源表达需要综合考虑蛋白的来源、疏水性、跨膜区等特性。低温、加入共表达因子以及改变培养条件有助于结核菌膜蛋白的可溶性表达。另外,包涵体复性也是获得结核菌目的膜蛋白的重要途径。随着新的表达系统,新的促可溶表达策略,新的包涵体复性手段,新的纯化方法的应用,将有更多的膜蛋白异源表达纯化成功,为蛋白质功能研究奠定基础。
- 廖丹谢建平王洪海
- 关键词：结核分枝杆菌膜蛋白异源表达纯化
- 基于Ras信号转导途径的药物靶标研究进展被引量：6
- 2008年
- 综述ras基因及Ras蛋白的结构和主要功能,尤其是Ras蛋白在细胞分裂、增殖、凋亡等方面所起的重要作用,并着重概述Ras信号转导网络以及基于这些信号转导途径的抗肿瘤和抗微生物药物靶标研究。ras基因及其编码的Ras蛋白参与体内多种信号转导途径,在细胞信号传递中发挥"分子开关"作用,是信号转导的重要组织者。
- 刘雪梅邓平费良润谢建平王洪海
- 关键词：RAS基因RAS蛋白信号转导途径药物靶标
- 卷曲霉素作用机制和耐药机制的功能基因组学研究进展被引量：8
- 2008年
- 随着一线抗结核药物的长期和广泛使用,结核病耐药性亦不断增加,其中耐多药结核分枝杆菌和持留菌感染已经成为结核病有效防治的关卡。寻找新型抗结核药物迫在眉睫。卷曲霉素被认为是较理想的二线结核病治疗药物,也是开发新的肽类结核病药物的模板。本文综述了从功能基因组学角度研究卷曲霉素的生物合成基因簇、转录组水平的作用机制和细菌耐药新机制,为合理使用卷曲霉素和开发新一代肽类抗生素提供借鉴。
- 刘雪梅谢建平
- 关键词：卷曲霉素生物合成基因簇结核病耐药机制
- 猫爪草提取物对临床分离结核分枝杆菌蛋白质组表达的影响被引量：21
- 2005年
- 猫爪草已经临床治疗耐药结核病,但其作用机理和有效成分尚不清楚。为研究其可能的作用靶标,采用双向电泳技术比较分析猫爪草提取物作用前后结核分枝杆菌临床分离株的全细胞蛋白表达差异。发现22个蛋白质斑点具有明显差异,对其中3个表达明显下调的蛋白质斑点进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析,获得了肽质量指纹图谱。数据库检索分析确定这3个点代表的蛋白质分别为硫代硫酸硫转移酶,延长因子Ts和热休克蛋白X,分别参与厌氧硫代谢、蛋白质翻译和蛋白质折叠分泌、转录调控等过程。这有助于深入研究猫爪草对结核分枝杆菌的作用机理,也为发现新的抗结核病治疗药物靶标提供了线索。
- 何颖乐军胡昌华王洪海谢建平唐翠魏秀莉刘雪梅宋洁
- 关键词：猫爪草结核分枝杆菌蛋白质组双向电泳
- 结核分枝杆菌RPF样蛋白家族及其功能被引量：1
- 2007年
- 上世纪末,Mukamolova等从藤黄微球菌(Micrococcus luteus)发现一种分泌蛋白-复苏促进因子(Rpf)。该因子在皮摩尔浓度下能促进休眠期的藤黄微球菌及其他数种高G+C含量的革兰氏阳性菌复苏和生长。结核分枝杆菌全基因组发现和该因子同源性较高的5个基因,预测产物都是分泌蛋白,一级结构都含有一个转粮基域。5个基因有一个共同的功能未知的域,3级结构预测该保守结构域和溶菌酶同源。重组表达的Rpf对不同种均有活性。5个rpf在不同生长时期均有表达,但调控有差异。
- 柳云帆刘平谢建平
- 关键词：结核病结核分枝杆菌细胞因子
