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国家重点基础研究发展计划(2013CB967502)

作品数:7 被引量:60H指数:4
相关作者:谷峰郑武邢东军黄秀峰金子兵更多>>
相关机构:温州医科大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划浙江省杰出青年科学基金更多>>
相关领域:医药卫生生物学更多>>

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 4篇医药卫生
  • 3篇生物学

主题

  • 2篇酸酶
  • 2篇锌指
  • 2篇锌指核酸酶
  • 2篇回文
  • 2篇核酸
  • 2篇核酸酶
  • 2篇MUTATI...
  • 1篇影响因素
  • 1篇色素变性
  • 1篇视网膜
  • 1篇视网膜色素
  • 1篇视网膜色素变...
  • 1篇转录
  • 1篇转录激活
  • 1篇外显率
  • 1篇网膜
  • 1篇网膜色素变性
  • 1篇基因诊断技术
  • 1篇靶向
  • 1篇RNA

机构

  • 5篇温州医科大学

作者

  • 4篇谷峰
  • 1篇余新平
  • 1篇陈鼎
  • 1篇金子兵
  • 1篇童绎
  • 1篇黄秀峰
  • 1篇邢东军
  • 1篇葛香连
  • 1篇郑武
  • 1篇何秀斌

传媒

  • 2篇Intern...
  • 1篇遗传
  • 1篇生物工程学报
  • 1篇中国生物工程...
  • 1篇国际眼科杂志
  • 1篇分子诊断与治...

年份

  • 1篇2017
  • 1篇2016
  • 2篇2015
  • 3篇2014
7 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
基因组编辑脱靶研究进展被引量:4
2017年
近年各种基因组编辑技术的成功研发为人类疾病的治疗与预防谱写了新的篇章,这些技术对应的基因组编辑工具主要包括锌指核酸酶(ZFNs)、转录激活子样效应因子核酸酶(TALENs)和最近发现的规律成簇间隔短回文重复(CRISPR)/Cas系统。这些工具相应的脱靶问题目前是制约基因组编辑技术介导人类疾病治疗的重要瓶颈。本文将分别从基因组编辑工具的介绍、脱靶的现状、解决优化的方案和检测方法进行总结与探讨,通过比较,进一步了解基因组编辑工具的优缺点及相关脱靶检测方法的适用性。
何秀斌谷峰
Novel mutations in PDE6B causing human retinitis pigmentosa被引量:1
2016年
AIM: To identify the genetic defects of a Chinese patient with sporadic retinitis pigmentosa(RP).METHODS: Ophthalmologic examinations were performed on the sporadic RP patient, 144 genes associated with retinal diseases were scanned with capture next generation sequencing(CNGS) approach.Two heterozygous mutations in PDE6B were confirmed in the pedigree by Sanger sequencing subsequently. The carrier frequency of PDE6B mutations of reported PDE6B mutations based on the available two public exome databases(1000 Genomes Project and ESP6500 Genomes Project) and one in-house exome database was investigated.RESULTS: We identified compound heterozygosity of two novel nonsense mutations c.1133G>A(p.W378X) and c.2395C>T(p.R799X) in PDE6B, one reported causative gene for RP. Neither of the two mutations in our study was presented in three exome databases. Two mutations(p.R74 C and p.T604I) in PDE6B have relatively high frequencies in the ESP6500 and in-house databases,respectively, while no common dominant mutation in each of the database or across all databases.CONCLUSION: We demonstrates that compound heterozygosity of two novel nonsense mutations in PDE6B could lead to RP. These results collectively point to enormous potential of next-generation sequencing in determining the genetic etiology of RP and how various mutations in PDE6B contribute to the genetic heterogeneity of RP.
Lu-Lu ChengRu-Yi HanFa-Yu YangXin-Ping YuJin-Ling XuQing-Jie MinJie TianXiang-Lian GeSi-Si ZhengYe-Wen LinYi-Han ZhengJia QuFeng Gu
关键词:HETEROZYGOSITYRETINITISMUTATIONCAPTURESEQUENCING
Leber遗传性视神经萎缩病外显率的影响因素研究进展被引量:1
2015年
Leber遗传性视神经萎缩病(Leber's Hereditary Optic Neuropathy,LHON)的发生是由于视网膜神经节细胞死亡进而导致视神经萎缩,表现为急性或亚急性双眼视力下降,是目前研究最为广泛的由线粒体基因突变引起的母系遗传病之一。超过90%的LHON是由线粒体基因组的3个原发致病突变之一所致,即G11778A、T14484C和G3460A。LHON临床表型不同,外显率的不同以及发病率的性别差异都提示可能存在其他相关基因(核基因和线粒体基因组)在其发挥着重要作用。本文主要对近二十年来该病的分子遗传学,特别是可能的外显率影响因素的研究进展作一阐述,为该病预防与临床治疗提供参考。
仲俊维陈鼎余新平童绎谷峰
关键词:LHON外显率影响因素
CRISPR/Cas9的应用及脱靶效应研究进展被引量:40
2015年
CRISPR/Cas9基因编辑技术在生命科学领域掀起了一场全新的技术革命,该技术可以对基因组特定位点进行靶向编辑,包括缺失、插入、修复等。CRISPR/Cas9比锌指核酸酶(ZFNs)和转录激活因子样效应物核酸酶(TALENs)技术更易于操作,而且更高效。CRISPR/Cas9系统中的向导RNA(Single guide RNA,sg RNA)是一段与目标DNA片段匹配的RNA序列,指导Cas9蛋白对基因组进行识别。研究发现,设计的sg RNA会与非靶点DNA序列错配,引入非预期的基因突变,即脱靶效应(Off-target effects)。脱靶效应严重制约了CRISPR/Cas9基因编辑技术的广泛应用。为了避免脱靶效应,研究者对影响脱靶效应的因素进行了系统研究并提出了许多降低脱靶效应的方法。文章总结了CRISPR/Cas9系统的应用及脱靶效应研究进展,以期为相关领域的工作提供参考。
郑武谷峰
关键词:RNA
R102W mutation in the RS1 gene responsible for retinoschisis and recurrent glaucoma被引量:1
2014年
AIM: To identify the mutations in RS1 gene associated with typical phenotype of X-linked juvenile retinoschisis(XLRS) and a rare condition of concomitant glaucoma. ·METHODS: Complete ophthalmic examinations were performed in the proband. The coding regions of the RS1 gene that encode retinoschisin were amplified by polymerase chain reaction and directly sequenced. ·RESULTS: The proband showed a typical phenotype of XLRS with large peripheral retinal schisis in both eyes,involving the macula and combined with foveal cystic change,reducing visual acuity. A typical phenotype of recurrent glaucoma with high intraocular pressure(IOP) and reduced visual field was also demonstrated with the patient. Mutation analysis of RS1 gene revealed R102W(c.304C>T) mutations in the affected male,and his mother was proved to be a carrier with the causative mutation and another synonymous polymorphism(c.576C>CT). ·CONCLUSION: We identified the genetic variations of a Chinese family with typical phenotype of XLRS and glaucoma. The severe XLRS phenotypes associated with R102W mutations reveal that the mutation determines a notable alteration in the function of the retinoschisin protein. Identification of the disease-causing mutation is beneficial for future clinical references.
Xiu-Feng HuangChang-Sen TuDong-Jun XingDe-Kang GanGe-Zhi XuZi-Bing Jin
关键词:GLAUCOMAGENEMUTATION
视网膜色素变性的基因诊断技术历史与进展被引量:7
2014年
视网膜色素变性(RP)是最常见的眼科遗传性疾病,以夜盲和视野狭窄为临床特征,具有高度遗传异质性。目前共报道67个致病基因,由于RP的致病基因多、遗传方式多样,基因诊断相对比较困难。随着新一代测序技术的发展,RP的基因诊断效率大大提高。本文力求回顾RP基因诊断技术的发展历程,介绍RP基因诊断的最新手段,并展望RP基因诊断技术的未来前景。
邢东军黄秀峰金子兵
关键词:视网膜色素变性基因诊断技术
新型靶向基因组编辑技术研究进展被引量:6
2014年
传统的靶向基因组编辑技术改造基因效率非常低,严重制约了基础研究和临床应用。因此,新的靶向基因组编辑工具的研究显得非常重要,以此来提高基因原位修复、定点整合及高通量基因敲除的效率。主要论述了近年来发现的新型靶向基因组编辑技术即锌指核酸酶(ZFN)、转录激活子样效应因子核酸酶(TALENs)、规律成簇间隔短回文重复(CRISPR)/Cas系统。从它们的发现、结构和研究进展及应用前景等方面进行了总结;通过比较三者的优缺点,发现规律成簇间隔短回文重复(CRISPRs)具有明显的优点。
杨发誉葛香连谷峰
关键词:EFFECTORNUCLEASES
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