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“天河一号”在生命科学研究中的应用: 2012年; 本文首先对高性能计算和"天河一号"超级计算机进行了简要概述。随后详细描述了高性能计算在生命科学领域中的两大重要应用:一个是生物大分子的动力学模拟,介绍用户在"天河一号"取得的一些应用成果和进行的应用性能测试;另一个是生物信息学研究,重点介绍了华大基因在基于"天河一号"开展的GPU并行软件测试取得的良好结果。最后展望了高性能计算在生命科学领域中的发展趋势。; 菅晓东李扬冯景华孟祥飞朱小谦; 关键词：天河一号分子动力学生物信息学

“天河一号”大规模科学与工程计算应用被引量：2: 2012年; 安装在国家超级计算天津中心(以下简称天津超算中心)的"天河一号"超级计算机系统是目前世界上最快的超级计算机,已广泛应用于多个高性能计算领域,并取得了一系列具有国际影响力的应用成果。本文主要介绍了"天河一号"在石油勘探数据处理、生物信息与生物医药、环境科学、工程仿真、磁约束聚变领域的最新应用成果,其成果表明"天河一号"在上述领域具有良好的可扩展性和并行效率,对自主科技创新和产业技术提升给予了巨大支撑。; 雷秀丽张婷赵洋冯景华徐斌孟祥飞朱小谦; 关键词：天河一号并行计算大规模科学计算 GPU

“天河一号”大规模并行应用程序测试被引量：4: 2012年; 目前安装在国家超级计算天津中心的"天河一号"是我国首台千万亿次超级计算机,在2010年11月世界超级计算机Top500排名中,位列世界第一。"天河一号"采用了CPU与GPU相结合的异构融合计算体系结构,自主设计实现了高速互连通信系统,在多个高性能计算应用领域具有应用适应性强、系统运行稳定可靠、性能可扩展性好等特点,为科学研究和应用提供了重要的高性能计算平台。采用石油地震数据处理、飞行器流场模拟、生物分子动力学模拟、磁约束聚变数值模拟、湍流数值模拟、晶体硅分子动力学模拟、全球大气浅水波全隐式数值模拟、地球外核热流动数值模拟等应用的典型算例对"天河一号"进行了大规模并行程序测试,结果表明,"天河一号"在上述应用领域具有良好的可扩展性和并行效率。; 朱小谦孟祥飞菅晓东冯景华; 关键词：天河一号

Modified variational iteration method for an El Nio Southern Oscillation delayed oscillator: 2012年; This paper studies a delayed air-sea coupled oscillator describing the physical mechanism of El Nino Southern Oscillation. The approximate expansions of the delayed differential equation＇s solution are obtained successfully by the modified variational iteration method. The numerical results illustrate the effectiveness and correctness of the method by comparing with the exact solution of the reduced model.; Cao Xiao-QunSong Jun-QiangZhu Xiao-QianZhang Li-LunZhang Wei-MinZhao Jun

基于GPU的遥感图像IHS小波融合并行算法设计与实现被引量：2: 2012年; 遥感图像融合是遥感图像应用的一个重要处理步骤。随着遥感图像数据规模与融合算法计算复杂度的增大,遥感图像融合面临着处理速度的挑战。最近几年,GPU计算能力得到极大提升,面向通用计算的应用得到了快速发展。本文基于GPU编程模型和硬件特性,深入研究了遥感图像融合的并行加速算法,提出了适合融合执行流的并行映射模型。本文选取计算量大、计算精度高的IHS增强小波融合算法进行GPU并行设计,并针对主流的GPU平台在数据传输、循环优化、线程设计等方面进行了优化,最后在nVIDIA GTX 460 GPU上进行了实验。实验结果表明,本文设计的并行映射模型及优化策略能够很好地适用于遥感图像融合应用,最大加速比达到了114倍。研究表明,GPU通用计算技术在遥感图像处理领域具有广阔的应用前景。; 徐如林周海芳姜晶菲; 关键词：GPU 遥感图像融合 IHS 小波 CUDA

Boussinesq方程组的广义变分原理被引量：1: 2011年; 半反推法是何吉欢为了寻求物理问题的变分原理而提出的,可避免由拉氏乘子法引起的临界变分现象.应用半反推法分别获得了描述水波运动的两类Boussinesq方程组的一族广义变分原理,并验证了它们的正确性.; 曹小群宋君强张卫民朱小谦赵军; 关键词：半反推法广义变分原理 BOUSSINESQ方程组

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国家自然科学基金(61070041)