国家自然科学基金(81172234)
- 作品数：8 被引量：30H指数：3
- 相关作者：杨拴盈李维孟夏张玉萍明宗娟更多>>
- 相关机构：西安交通大学铜川市人民医院西安医学院附属医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金陕西省科技统筹创新工程计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 盐酸埃克替尼对人肺腺癌细胞系PC-9作用的比较蛋白质组学研究被引量：1
- 2015年
- 目的应用比较蛋白质组学方法分析盐酸埃克替尼作用前后人肺腺癌细胞系PC-9细胞相关蛋白的变化,从蛋白质水平探讨埃克替尼的作用机制。方法应用人类EGFR基因突变检测试剂盒和实时定量PCR仪检测PC-9细胞EGFR突变;应用MTT法检测埃克替尼对PC-9细胞增殖的影响;应用双向凝胶电泳(2-DE)技术分别对未经干预的PC-9细胞总蛋白和经埃克替尼作用的PC-9细胞总蛋白进行分离,获得蛋白质表达谱;应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)结合生物信息学进行蛋白质鉴定。结果 PC-9细胞的EGFR基因存在第19外显子缺失突变;在10-4-10-9M浓度范围内,埃克替尼明显抑制PC-9细胞的生长,且呈浓度依赖;埃克替尼诱导前后表达水平≥1.5倍的蛋白点共有56个。选取差异≥1.7倍的29个蛋白点进行MALDI-TOF-MS分析,最终鉴定出16种蛋白质。根据功能,这些蛋白可分为代谢酶类、细胞骨架类、分子伴侣、信号传导分子、转录及翻译相关蛋白。结论应用比较蛋白质组学方法初步鉴定了16种蛋白质,这些蛋白质与埃克替尼作用机制密切相关,部分可能成为新的分子治疗靶点。
- 刘晓丽李维孟夏张玉萍明宗娟史红阳石婕钟玉洁王薇杨拴盈
- 关键词：埃克替尼比较蛋白质组学
- 检测肺癌患者血清Cathepsin X及Cystatin C的临床意义被引量：9
- 2013年
- 背景与目的组织蛋白酶X(Cathepsin X,Cat X)是最近发现的一种组织蛋白酶(Cathepsins,Cats)家族成员。近年来研究表明CatX与多种恶性肿瘤发生、发展有关。本研究旨在探讨肺癌患者血清CatX及cystatinC的表达与临床特征及预后的关系。方法采用ELISA法定量检测84例肺癌患者及36例健康对照者血清CatX及cystatinC表达。结果肺癌患者血清Cat X和cystatin C水平明显高于健康人(P<0.01);CatX水平与肺癌病理类型之间有相关的趋势(P=0.076)。血清cystatin C水平与肺癌TNM分期正相关(P=0.01),cystatinC/CatX与淋巴结转移之间有相关趋势(P=0.058)。CatX表达水平与肺癌患者总生存期(overallsurvival,OS)相关,高水平CatX肺癌患者OS更短。Cox单因素回归示CatX高表达以及TNM分期是影响肺癌预后独立因素,Cox多因素回归显示,仅TNM分期是患者预后的独立危险因素。结论肺癌患者中血清CatX和cystatinC水平升高,检测肺癌患者Cat X和cystatin C血清水平对于指导临床肺癌诊断、评估预后有重要意义。
- 张学德侯彦丽牛泽群李维孟夏张娜杨拴盈
- 关键词：CATHEPSINCYSTATIN肺肿瘤血清
- 人端粒酶逆转录酶抗原HLA-A0201限制性CTL表位预测及鉴定被引量：1
- 2017年
- 目的应用生物信息学方法对人端粒酶逆转录酶(h TERT)HLA-A2+限制性细胞毒性T细胞(CTL)表位进行预测和鉴定,寻找诱导机体特异性杀伤肺癌肿瘤细胞的抗原表位。方法应用生物信息学软件BIMAS、SYFPEITHI对h TERT蛋白进行HLA-A0201限制性CTL抗原表位预测,筛选优势表位;应用肽亲和力实验、乳酸脱氢酶(LDH)释放实验及人干扰素γ(IFN-γ)ELISPOT实验验证表位,筛选出激发机体产生特异性免疫反应的表位。结果生物信息学软件筛选出优势表位为:ILAKFLHWL、ELLRSFFYV及ILSTLLCSL;肽亲和力实验得到优势表位荧光系数(FI)为:ILAKFLHWL0.67、ELLRSFFYV0.66及ILSTLLCSL0.90;LDH释放实验显示ILAKFLHWL所诱导CTLs的杀伤率明显高于其它各表位,也明显高于阴性表位,差异均具有统计学意义(P<0.05);人IFN-γELISPOT实验证明ILAKFLHWL所诱导的CTLs产生的IFN-γ斑点数多于其他表位,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论ILAKFLHWL的免疫原性强,可用于后续制备肺癌多肽疫苗。
- 袁竞妍王宇刘博轩孟夏孙瑞瑛吕欣李维石婕明宗娟史红阳杨拴盈
- 关键词：支气管肺癌HTERT表位预测
- OAT在非小细胞肺癌中的表达及生物信息学分析被引量：3
- 2012年
- 背景与目的已有的研究表明,鸟氨酸氨基转移酶(ornithine aminotransferase,OAT)可能参与多种恶性肿瘤的发生和发展,本研究旨在检测非小细胞肺癌(non-small cell lungcancer,NSCLC)中OAT mRNA和蛋白质的表达,并对其进行生物信息学分析。方法通过RT-PCR的方法比较A549和16HBE细胞间OAT mRNA水平的差异;采用免疫组织化学SP法检测55例肺癌组织和17例癌旁肺组织中OAT蛋白表达;利用生物信息学的方法对OAT蛋白的生物信息学特征和相互作用蛋白进行分析,并对筛选出来的相互作用蛋白进行GO注释和信号通路分析。结果①A549中OAT mRNA相对含量较16HBE中低,两者差异约2.85倍。②NSCLC中OAT蛋白的表达明显高于癌旁肺组织(P<0.05);OAT蛋白在鳞癌和腺癌间的表达差异有统计学意义,而与患者性别、年龄、有无淋巴结转移、肿瘤直径及TNM分期无关。③生物信息学分析提示OAT蛋白定位于线粒体、为高度保守的亲水性蛋白,具有Aminotran-3结构域,可能存在多个丝/苏氨酸磷酸化位点,在信号转导、转录和分子转运等方面发挥一定的作用;在筛选出来的54种可能和OAT存在相互作用的蛋白质中,TNF和TRAF6这两种蛋白参与了NF-κB信号通路。结论 OAT可能在NSCLC的发生和发展中发挥重要作用,有望成为肺癌的早期诊断标志物和治疗的新靶点。
- 周丹菲程西安杨拴盈明宗娟李维张秋红张玉萍
- 关键词：肺肿瘤生物信息学
- Sex-determining Region of Y Chromosome-related High-mobility-group Box 2 in Malignant Tumors： Current Opinions and Anticancer Therapy被引量：3
- 2015年
- Shi-Guang Cao Zong-Juan Ming Yu-Ping Zhang Shuan-Ying Yang
- 关键词：性别决定Y染色体信号传导途径
- 肺癌患者血清EGFR突变诊断实验的Meta分析被引量：2
- 2014年
- 目的评价肺癌患者血清EGFR突变诊断试验的准确性。方法收集关于肺癌患者血清与肺癌组织表皮生长因子受体(EGFR)突变检测相关研究的文献,并进行Meta分析,绘制SROC曲线。结果共纳入9篇文献,包括555例研究对象,合并敏感度为0.65,合并特异性为0.92,合并阳性似然比为8.29,合并阴性似然比为0.37,SROC曲线下面积0.94。结论肺癌患者血清与肿瘤组织的EGFR突变具有较高的一致性,利用外周血进行EGFR突变检测是一种可行办法。
- 张学德李维刘晓丽张玉萍侯彦丽牛泽群杨拴盈
- 关键词：肺癌表皮生长因子受体META分析
- 人肺腺癌细胞系A549线粒体差异蛋白质组学研究被引量：1
- 2014年
- 目的 研究人肺腺癌细胞系A549与人正常支气管上皮细胞系16HBE线粒体蛋白质组的差异表达.方法 传代培养细胞系A549及16HBE,用线粒体提取试剂盒获取细胞线粒体蛋白质,进行双向凝胶电泳,运用液相色谱串联质谱分析技术筛选出A549和16HBE细胞系线粒体间表达水平显著差异的蛋白,所得结果通过Data Analysis软件标峰,用MASCOT进行结果搜索和数据分析.结果 双向电泳结果显示A549、16HBE细胞系线粒体存在差异的蛋白质点共41个,3倍以上差异的16个,A549细胞系中表达上调的15个,表达下调的26个,其中3倍以上差异表达上调的7个,表达下调的9个.运用液相色谱串联质谱技术鉴定出A549细胞系线粒体表达上调的蛋白质2个：AAA＋ ATP酶家族结构域蛋白3B、tRNA鸟嘌呤糖基转移酶,表达下调的蛋白质7个：热休克蛋白75、复合物Ⅲ亚基1、复合物Ⅲ亚基2、鸟氨酸氨基转移酶、异柠檬酸脱氢酶亚基α、SLP-2、抗增殖蛋白.结论 应用亚细胞蛋白质组学方法,鉴定出肺腺癌细胞系线粒体差异表达蛋白,为阐明肺腺癌发生的分子机制、筛选早期诊断标志物提供了有益的线索.
- 刘延峰杨拴盈兀威曹博淦王胜昱刁鑫陈晖牟建
- 关键词：肺腺癌细胞系线粒体蛋白质组学
- 多靶点酪氨酸激酶抑制剂在晚期非小细胞肺癌治疗中的是与非被引量：10
- 2015年
- 多靶点酪氨酸激酶抑制剂（tyrosine kinase inhibitors,TKIs）理论上可以同时作用于肿瘤细胞的多个靶点,对各靶点产生协同作用,能够直接作用于肿瘤细胞和血管,故多靶点TKIs较单靶点TKIs更有优势。尽管多靶点TKIs的作用位点大致相似,但不同的多靶点TKIs抑制每个靶点的效力并不完全相同,故每种多靶点药物的疗效和不良反应也有所区别。一、索拉非尼（sorafenib）索拉非尼是一种口服的TKIs,其能同时抑制多种细胞内和细胞膜上的激酶,如RAF激酶、VEGFR-2、VEGFR-3、PDGFR-β、c-KIT及FLT-3等。
- 杨拴盈孟夏王薇
- 关键词：多靶点酪氨酸激酶抑制剂靶向治疗
