辽宁省教育厅高等学校科学研究项目(2009A125)
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
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- 相关领域：生物学更多>>
- RNA二级结构的数学表示及其应用
- 2010年
- 根据RNA二级结构的基本序列在3-D空间中定义了使核苷酸集与点集之间一一对应的映射,进而利用这个映射在3-D空间中得到了RNA二级结构的新的3-D有向图形表示,然后基于3-D有向图形表示把RNA二级结构转化为特征向量序列和L/L矩阵,提取特征向量序列的夹角余弦和的平均值和L/L矩阵的不变量(特征值),并作为特征向量来刻画RNA二级结构,最后利用特征向量之间的距离来描述序列或结构的不变性来分析了AIMV-3等九种病毒的RNA二级结构的相似性,得到了比较好的结果.
- 白凤兰徐丽
- 关键词：RNA二级结构向量夹角特征值
- 模糊矩阵理论在蛋白质二级结构分类中的应用
- 2012年
- 提出一种基于蛋白质二级结构特征序列的三维结构相似性比较方法.以八字母结构字母表中字母组成的联体在整个特征序列中出现的频率为特征源,构造联体频率矩阵,利用离散数学中的模糊矩阵理论对其进行分析处理,最终可以求得一个模糊等价矩阵,并利用此矩阵对待比较的蛋白质进行分类.该方法并不是基于人们熟悉的一维氨基酸序列,而是基于蛋白质二级结构特征序列,该序列由一系列具有局部空间折叠形式的二级结构片段组成.
- 白凤兰高华龙李英
- 关键词：蛋白质二级结构模糊矩阵
