国家科技支撑计划(2012BAD01B0604)
- 作品数：11 被引量：57H指数：5
- 相关作者：饶龙兵段红平郭洪英陈益泰杨汉波更多>>
- 相关机构：中国林业科学研究院云南农业大学四川省林业科学研究院更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 不同倍性桤木属植物遗传差异的AFLP分析被引量：3
- 2014年
- 采用AFLP技术对桤木属4种不同倍性的116份材料指纹图谱进行了分析,5对引物组合共得到301个位点,282个为多态位点,多态位点百分率为93.7%。4个种群多态位点百分率为35.2%~72.4%,平均多态位点百分率为54.6%。总的Nei＇s基因多样性为0.3043,总Shannon多态信息指数为0.4578。种群间及种群内部均具有较丰富的遗传多样性,种群间的遗传差异大于种群内部的遗传差异。NJ聚类分析与主坐标分析结果一致,所有的供试材料明显的分为3个组,地理分布距离较近的种群优先聚在一起。
- 饶龙兵杨汉波郭洪英段红平陈益泰
- 关键词：桤木属AFLP分析
- 桤木属植物AFLP反应体系的建立与优化被引量：4
- 2014年
- 为了建立桤木属植物AFLP体系,筛选扩增条带丰富的引物,本研究以欧洲桤木(A.glutinsoa)为材料,对AFLP反应过程中的关键因素(DNA质量和浓度,酶切,扩增体系等)进行了研究。结果表明:预扩增稀释产物3.0μL,酶切时间以5 h,连接16 h,连接产物稀释10倍用于预扩增,预扩增产物稀释20倍为宜。确定桤木AFLP-PCR 20μL的反应体系:模板DNA 300 ng,10×Taq DNA聚合酶Buffer(含Mg2+)2.0μL,dNTPs0.3μL,引物1.0μL,Taq DNA聚合酶0.6 U,加ddH2O至20μL,并利用建立的体系筛选出7对扩增条带多、条带清晰、多态性好的引物。本研究建立了适用于桤木属植物的AFLP反应体系,并筛选出适合桤木属植物的引物,为今后利用AFLP标记技术进行桤木属遗传多样性分析提供了一定的实验依据。
- 饶龙兵杨汉波郭洪英段红平陈益泰
- 关键词：AFLP多态性
- 不同倍性桤木属植物的转录组测序和分析被引量：1
- 2016年
- 本研究采用Illumina高通量测序技术对3种不同倍性的桤木属植物混合样品进行转录组测序,利用生物信息学方法开展基因表达谱的研究、功能基因的预测。测序结果组装获得85 769个Unigene,总长50 200 910 bp,功能注释到NR、NT、Swiss-Prot、KEGG、COG、GO库的Unigene分别是45 172、38 673、29 181、25 096、14 968和30 675个,所有注释上的Unigene是48 204个。根据KEGG pathway数据库,对桤木转录组的Contig进行pathway生物学通路的注释和预测,共识别出25 096个Unigene具有对应的功能,并关联到128条生物学通路。SSR查找发现,从85 769个Unigene中找到8 678个SSR位点,占Unigene总数的比例为10.11%。其中,二核苷酸重复所占比例最高,达到65.87%,其次是三核苷酸重复,为28.36%,四、五、六核苷酸重复类型的数量很少,总计5.77%。SSR不同重复单元类型中,出现频率最高的为AG/CT,其次是AAG/CTT和AT/AT。
- 饶龙兵杨汉波郭洪英段红平陈益泰
- 关键词：桤木属转录组SSR
- 氮水平对桤木属幼苗根系形态及氮累积利用影响被引量：3
- 2013年
- 采用温室沙培试验,通过不同浓度氮处理,研究红桤木、喜马拉雅灰桤木、欧洲桤木和灰桤木4种国外引种的桤木属幼苗对不同氮水平的响应差异,分析了氮胁迫对桤木属幼苗根系形态和氮累积利用的影响。结果表明:随着氮水平(N0、N1/2、N1(标准E.G.Bollard营养液)、N2)的增加,各桤木属植物的生物量、氮累积量和根长、根体积、根表面积、须根数等生长参数均呈先增后降的趋势,且在N1/2水平中各参数值最大;细根比例及氮利用效率、氮利用率均呈持续下降趋势。参试的4种桤木中欧洲桤木、红桤木的生物量、氮累积量、根系形态参数均较高,且在N1/2时氮利用率较高,分别为44.57%、40.14%,具有在我国长江中下游地区作为生态防护和短周期工业用材树种推广应用潜力;灰桤木和喜马拉雅灰桤木各生长参数均较低,不宜推广。试验结果也表明尽管桤木属植物具有一定的固氮能力,但在低地力河滩沙地、丘陵等地区集约化经营中仍需采取一定施肥措施。
- 李霞饶龙兵郭洪英段红平陈益泰
- 关键词：桤木属氮水平氮利用效率
- 16种桤木属植物种子发芽和幼苗生长比较分析被引量：5
- 2014年
- 为了研究桤木属植物不同种源和家系种子的发芽及幼苗生长情况,笔者对16种桤木属植物以及江南桤木10个家系的种子千粒重和发芽率以及苗期生长做了比较分析。结果表明,桤木属植物种子千粒重和发芽率差异较大,种子千粒重平均值为0.90 g,多数集中在0.5~1.5 g的范围内;桤木属植物种子的平均发芽率、发芽势分别为9.69%、5.4%,家系的平均发芽率及发芽势分别为20.40%、18.92%;桤木种子千粒重和发芽率相关性不显著。16种桤木中欧洲桤木的高、地径生长最大,分别达到32.12、7.03 mm,具有明显生长优势。
- 李阳饶龙兵郭洪英段红平
- 关键词：千粒重发芽率幼苗
- 美国黑桦、欧洲桤木和川桤木对重金属Cu胁迫的响应研究
- 2016年
- 为了研究美国黑桦、欧洲桤木和川桤木3种植株对Cu胁迫的响应以及3个树种间的耐Cu性差异。通过盆栽试验的方法研究不同浓度Cu处理下的3种植株的生长、抗氧化酶系统的变化以及Cu积累特征。研究结果表明:(1)高浓度Cu(≥1 mmol/L)处理显著降低3种植株的株高、地茎生长量以及生物量,抑制植株的生长;(2)随Cu胁迫时间的延长,幼苗叶片SOD、POD、CAT活性均呈先升高后下降的趋势,欧洲桤木中3种酶活性更强,且酶活性持续时间最长;(3)川桤木和欧洲桤木根、茎、叶Cu积累量均随处理浓度的升高而增加,美国黑桦根、茎Cu积累量随处理浓度升高而增加,而叶片Cu积累量随处理浓度升高而减少。高浓度Cu处理对3种植株的生长都有显著的抑制作用,3种植株的都表现出对Cu离子的根部富集特征。欧洲桤木整体耐Cu能力最强,美国黑桦在Cu浓度较低时有较强的耐Cu能力,川桤木对Cu胁迫相对比较敏感。
- 张志超饶龙兵段红平
- 关键词：桤木CU胁迫
- 桤木属7种植物的核型分析被引量：8
- 2013年
- 利用改良去壁低渗法对分布于欧美地区的桦木科(Betulaceae)桤木属(Alnus Mill.)7种植物进行染色体数目与核型分析。结果显示:所有材料染色体形态比较一致,多为由中部(m)及近中部(sm)着丝点染色体组成。意大利桤木(A.cordata)为六倍体,体细胞染色体数为2n=6x=42,核型公式为2n=6x=42=36m+6sm;绿桤木(A.viridis)为八倍体,体细胞染色体数为2n=8x=56,核型公式为2n=8x=56=46m+10sm(SAT);薄叶桤木(A.tenuifolia)、灰桤木(A.incana)、欧洲桤木(A.glutinosa)、裂叶桤木(A.sinuata)和红桤木(A.rubra)均为四倍体,体细胞染色体数均为2n=4x=28,其核型公式分别为2n=4x=28=16m(1SAT)+12sm、2n=4x=28=22m+6sm、2n=4x=28=24m+4sm、2n=4x=28=24m+4sm、2n=4x=28=26m+2sm。其中红桤木(A.rubra)的核型属于1B型,其余均为2B型。
- 饶龙兵杨汉波郭洪英段红平陈益泰
- 关键词：桤木属染色体核型分析
- 基于桤木属转录组测序的SSR分子标记的开发被引量：14
- 2016年
- [目的]基于转录组数据开发适用于桤木属树种的SSR标记,揭示其在转录组序列中的分布类型及特征,为桤木属树种分子标记辅助育种提供有利工具。[方法]利用Micro SAtellite(MISA)软件对所有转录组序列进行SSRs搜索,并对SSR位点的数量、分布特征进行统计分析。设计100对SSR引物,采用琼脂糖凝胶电泳和毛细管电泳分离检测方法对3种不同倍性桤木属植物(12份材料)进行遗传多样性检测,确定引物多态性及通用性。[结果]85 769条Unigenes序列中发现8 678个SSR位点,分布在8 298条Unigenes中发生频率为9.67%,转录组序列中平均每14.04 kb长度就有一个SSR位点分布。其中,二核苷酸重复类型数量最多,占65.87%。根据转录组Unigenes序列,利用Primer 3软件共设计出4 531对符合要求的引物,挑选出的100对SSR引物中,获得18对多态性高、稳定性好的SSR引物。[结论]本研究可扩增出多态性位点的引物重复单元以二、三核苷酸重复为主。基于桤木属转录组序列的SSR标记开发是可行的,开发的引物为桤木属遗传多样性分析、分子育种、遗传图谱构建和功能基因的挖掘提供了丰富的候选分子标记。
- 饶龙兵杨汉波郭洪英段红平陈益泰
- 关键词：桤木属转录组SSR引物
