山西省基础研究计划项目(2012021028-1)
- 作品数：2 被引量：5H指数：1
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- 猪繁殖与呼吸综合征病毒Shanxi-6株全基因序列分析被引量：5
- 2014年
- 采用RT-PCR方法,分段扩增出猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）Shanxi-6株15个基因片段,并将这15个片段分别连接到pMD18-T载体上进行克隆测序、拼接后,得到PRRSV Shanxi-6株全基因组长15 320 bp（不包含PolyA尾）,包含9个开放阅读框,5＇UTR长189 bp,3＇UTR长150 bp。基因组序列分析结果表明,Shanxi-6株与欧洲型代表毒株LV的核苷酸序列同源性为54.35%,与美洲型代表毒株VR-2332的核苷酸序列同源性为88.80%,与HPPRRSV毒株（JXA1、HUN4、HuN、HUB1）亲缘关系最近,核苷酸序列同源性高达97.44%-97.74%,且在非结构蛋白Nsp2上有30个氨基酸的缺失。
- 韩一超刘文俊姚敬明吴忻王娟萍武守艳陈剑波孟帆郭慧慧杨丽华雷宇平樊振华
- 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组
- 猪繁殖与呼吸综合征病毒山西分离株ORF5基因的序列分析
- 2013年
- 采用RT-PCR方法对2009—2011年山西省疑似猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)阳性病料进行克隆和测序,获得5个ORF5基因片段,并对其基因序列和推导的氨基酸序列与国内外毒株进行了同源性分析。序列分析结果表明,5个ORF5基因序列之间核苷酸同源性为97.7%～98.5%,与欧洲型代表株LV、美洲型代表株VR-2332、2006—2007年国内分离的PRRSV变异株(JXA1、HuN、HUN4、HUB1)、2006年以前中国分离毒株(CH-1a、HB-1(sh)、HB-2(sh))和2个疫苗株(RespPRRS MLV、MLV RespPRRS/Repro)核苷酸同源性分别为63.5%～64.0%、88.7%～89.2%、97.7%～99.3%、88.1%～96.7%和88.6%～89.1%;氨基酸同源性分别为56.1%～56.6%、87.8%～88.8%、96.6%～98.5%、85.9%～93.2%、86.8%～87.9%。结果表明山西地区的PRRSV流行毒株均属于美洲型,且毒株同源性很高,亲缘关系紧密。
- 刘文俊姚敬明吴忻王娟萍孟帆韩一超樊振华米瑞娟罗甜甜温永亮
- 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因
