国家自然科学基金(30570401)
- 作品数：8 被引量：30H指数：4
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- 乙二醇和1,2-丙二醇增强富含GC碱基人类基因组DNA模板的PCR扩增被引量：1
- 2009年
- 基因(组)操作者常会遇到高GC序列难于扩增的问题。全球范围内也还没有很成熟的通用方法来解决这个问题。经过系统的摸索,发现选用有机试剂乙二醇和1,2-丙二醇能得到比较满意的特异的PCR产物。104段随机选取的GC含量在60%～80%之间的人类基因组序列(长度在700～800bp)基本上全部得到较好的扩增。
- 杨霞刘芳孟良玉张治洲
- 关键词：乙二醇1,2-丙二醇
- Tup1突变对转录抑制局部网络中基因表达的非线性影响被引量：1
- 2009年
- 研究基因网络的非线性行为特征是研制基因网络技术的基础。Tup1基因是酵母中作用最为广泛的转录抑制因子之一,利用酵母生物信息学数据库中蛋白相互作用关系,构建一个以Tup1为中心,4个层次741个基因的局部基因网络。统计分析六张Tup1不同突变的基因表达芯片数据,将局部基因网络中的全部基因按照3个网络特征进行统计分析:必需\非必需基因、网络层次和网络节点,并研究这些特征与基因表达之间的关系。初步发现基因表达变化的强度与节点数目成一定的反比关系,必需基因的平均变化程度较非必需基因为低,且由Tup1突变引发的其他基因的表达变化在以Tup1为中心的局部基因网络中近层次网络变化程度较大,远层次网络变化程度较低。
- 丛建国王志伟任德华张治洲
- 关键词：基因表达变化非线性
- 纳米材料对DNA热变性行为的影响被引量：1
- 2009年
- 在基因操作过程中经常需要对脱氧核糖核酸(DNA)进行高温处理,如在聚合酶链式反应PCR操作中就需要对模板DNA进行升降温的操作,因此,DNA的热变性行为是关系到一些基因操作效率高低的关键.琼脂糖凝胶电泳实验显示,1,972,bp的短链λDNA高温处理后在1,000,bp左右处出现额外一条下带,而且此条带经过37,℃处理数小时即可恢复到1,972,bp,不像48,000,bp长链λDNA那样在高温处理后出现弥散现象.另外,显著添加不同的纳米材料对下带出现的温度有明显的影响,意味着添加适量纳米材料可以改变DNA分子结构对温度的敏感性.所发现的下带可能具有尚未报道过的特殊结构.
- 张治洲季巧丽崔宝宁
- 关键词：纳米材料DNA高温处理热变性
- 检测纳米材料毒性的若干实验方法被引量：8
- 2009年
- 纳米材料进入生命体和环境以后可能带来的生物安全问题需要定量的测定。现有的检测纳米材料生物安全性的方法大致可分为体内和体外实验两种,但是还没有证据表明既有的某个方法单独能作为一种检测所有纳米材料毒性的通用方法,也没有证据表明这些方法合在一起就能全面评估纳米材料的生物安全性。在总结既有的若干方法的同时,报道了一种基于rpsL基因的复制保真性来定量检测纳米材料毒性的方法。纳米材料对rpsL基因的体内体外复制过程保真性的影响均可方便地定量测定。
- 杨文娟沈涔超张治洲
- 关键词：纳米材料毒性RPSL
- 纳米银颗粒增强聚合酶链式反应长片段DNA反复扩增的特异性被引量：9
- 2007年
- 基因操作者经常需要把数量稀少的DNA样品进行反复扩增以供进一步研究之用.在反复扩增过程中,上一次扩增产物当作下一次扩增的模板使用.对于较短的DNA片段(几百个碱基),一般反复扩增不会遇到特别的困难;但是较长DNA片段(几千到几万个碱基)的反复扩增一般会极大地降低聚合酶链式反应(PCR)的特异性.实验中发现,当扩增较长片段基因时,在常规PCR热循环体系中添加粒径平均为70 nm的银颗粒,使反应体系纳米银颗粒浓度达到0.1～1.2μg/μL,可以在一定程度上保持PCR反复扩增反应的特异性.其机理之一可能是常规PCR反应体系在添加了纳米银颗粒后改善了溶液的导热性能.
- 王群李静曹小红张治洲
- 关键词：聚合酶链式反应纳米银特异性
- 配伍西药可能是中药现代化的一个核心战略目标
- 国际范围内系统生物学的兴起和发展在为中药现代化发展提供机遇的同时,更容易为西药的创新研发提供方便的手段,因为西药在分子水平上的研究基础比中药要强大得多。系统生物学对分子网络包括基因网络的深层把握将自动把西药的设计引向配伍...
- 张治洲
- 关键词：中药现代化系统生物学网络
- 文献传递
- 中药现代化在系统生物学时代所面临的若干潜在危机被引量：5
- 2007年
- 近几年系统生物学包括系统生物医学的发展很快。系统生物学相关学科的发展将在一定程度上逐步改进人们在生物技术上的研究手段和研制理念;系统生物医学正在逐渐把西药与中药联系起来,但是在这个联系的过程中蕴涵着中药现代化的重大危机。从其中的一个角度来看,中药是一种多位点定向或定点改变基因表达的技术;但是中药成分复杂,系统庞大,很难在几十年的时间内实现在基因水平上对中药的全面理解;而西药已经把基于基因网络和细胞信号传导系统结构的药物设计方法变成了常规技术。当基因网络相关的基础研究达到一定深度时,就可以发展一套成熟的多位点定向或定点改变基因表达的技术,很可能研制出中药化的配伍西药。从技术层面和研究资金强度上看,国际上大的生物制药公司实现西药中药化的目标已经准备了很好的条件,正在时间上与中药现代化进行赛跑并可能逐步与个体化医学接轨。
- 张治洲
- 关键词：中药现代化系统生物学
- 基于DNA分子密码算法的防伪认证技术被引量：1
- 2006年
- 基于DNA分子的密码实现方法和DNA分子的防伪认证技术的研究进行了综述。介绍了DNA防伪技术的发展背景以及目前该领域的主要研究进展及其应用,并指出了此技术今后的发展前景。
- 张治洲俞洋王秀锦
- 关键词：DNA防伪密码生物传感器
- 从系统生物学到配伍西药:中药现代化的一个核心战略被引量：4
- 2007年
- 国际范围内系统生物学的兴起和发展在为中药现代化发展提供机遇的同时,更容易为西药的创新研发提供方便的手段,因为西药在分子水平上的研究基础比中药要强大得多。系统生物学对分子网络包括基因网络的深层把握将自动把西药的设计引向配伍的道路,而配伍西药可能就是中药现代化的一个终极目标。所以说中药现代化其实面临着潜在的巨大危机。如何化不利形势为有利形势,需要中药现代化的决策部门在战略战术上提出及时的应对方案。需要从国家利益的角度吸纳不同领域的研究力量并在分子水平上极大地拓展相关研究,不失时机地开展与西药配伍潜势相结合的具体研究。
- 张治洲
- 关键词：中药现代化系统生物学
