国家自然科学基金(30871341)
- 作品数：17 被引量：21H指数：3
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- 三阶隐马氏模型算法及其与一阶隐马氏模型的关系被引量：2
- 2011年
- 为了考虑更多的统计特征,提出了一类三阶隐马氏模型,其中状态转移和输出观测同时取决于当前状态和前面两个状态.研究和推导了这类三阶隐马氏模型中估值问题的向前—向后算法、解码问题的Viterbi算法和学习问题的Baum-Welch算法.对此类三阶隐马氏模型,构造了一个与之等价的一阶隐马氏模型,提出并证明了它们的等价性定理.研究结果丰富了隐马氏模型的算法理论,可为一些实际应用提供更好的方法.
- 叶飞衣娜王翼飞
- 关键词：VITERBI算法
- 基于小波的肿瘤基因表达数据聚类分析模型被引量：1
- 2011年
- 运用小波的降噪性建立一种基于肿瘤基因表达谱的聚类分析模型,采用小波变换、信息抽取、双向聚类的方法对基因表达谱进行有效的分析.通过这种模型,可以降低基因表达谱的噪音以及样本错聚率.最后,将该方法应用于结肠癌基因表达谱的分析.
- 黄文佳冯铁男王翼飞
- 关键词：基因表达数据小波变换特异表达基因聚类分析
- 二阶HMM算法改进及在miRNA靶基因预测中的应用被引量：5
- 2010年
- 隐马氏模型在语音识别和生物信息学中有重要的应用.本文研究二阶隐马氏模型(HMM2)的基本算法,利用归一化和递推原理,改进模型的前向-后向算法及Baum-Welch训练算法并给予证明,使得该算法更容易理解和机器实现,并保证数值稳定性.将HMM2应用到miRNA靶基因预测的后期过滤处理中取得了较好的结果.
- 高松秦殿刚冯铁男马成荣王翼飞
- 基于禁忌搜索和遗传算法的智能化双聚类方法被引量：2
- 2009年
- 在基因表达数据中寻找重要双聚簇的难度随数据规模的增长而增长.该文讨论一种智能化的双聚类方法,充分利用禁忌搜索和遗传算法自身的爬山能力,很好地平衡了区域搜索和全局搜索的关系,并使输出结果不依赖于预先设定的阐值.实验表明,该方法具有很好的收敛性,并可发现比传统方法更好的双聚簇.
- 吕玉龙沈青松石铁流王翼飞
- 关键词：遗传算法禁忌搜索基因表达数据
- 基于局部非负矩阵分解的人脸识别被引量：1
- 2010年
- 提出了一种基于局部非负矩阵分解的人脸识别方法。以单个人的训练样本集获取其人脸特征子空间,将识别图像向每一个特征子空间中进行映射及重构,在子空间内实现人脸识别。ORL标准人脸库进行的计算机仿真证实了该方法的有效性。
- 于彬
- 关键词：非负矩阵分解人脸识别子空间
- 基于小波分析的BP神经网络膜蛋白跨膜螺旋区段预测被引量：4
- 2010年
- 基因组计划所产生的大量蛋白质序列迫切需要从理论上预测跨膜螺旋区段。提出了基于小波多分辨分析的BP神经网络膜蛋白跨膜螺旋区段的预测新方法,并把此方法称之为WnnTM。从MPtopo数据库中随机抽取80条三维结构已知的膜蛋白质序列构建数据集,把它们映射成疏水值序列,通过小波分解和重构得到小波系数,并结合BP神经网络构造小波BP神经网络预测模型,对膜蛋白跨膜螺旋区段的位置和数目进行预测。实例验证,WnnTM预测方法比单独用BP神经网络对膜蛋白跨膜螺旋区段进行预测更有效。
- 于彬
- 关键词：小波分析BP神经网络膜蛋白
- 基于GA-SVM方法的结肠癌基因表达谱数据分析被引量：2
- 2012年
- 对结肠癌的基因表达谱数据进行分析,提出选取其特征基因的新方法。首先考虑到基因表达谱数据高维数、小样本的特点,采用Bhattacharyya距离对数据进行降维,运用遗传算法生成特征基因子集,以支持向量机作为分类器,建立了基于GA-SVM的结肠癌两类别分类模型。实验结果表明,仅需提取10个特征基因就可获得95.62%分类准确率。
- 于彬张岩
- 关键词：基因表达谱肿瘤分类特征基因支持向量机
- 基于MiRfilter系统的毛果杨miRNA预测
- 2010年
- 从参数训练、参数范围训练、候选成熟体打分等方面改进miRNA预测系统MiRfilter,使其适应拥有更长前体的植物miRNA的预测.预测毛果杨基因组上的miRNA,并对系统进行精度检验.利用MiRfilter系统共预测出3 860条候选miRNA;在110个正样本中,正确识别91条前体和80条成熟体,前体预测精度为82.73%,成熟体预测精度为72.73%;在毛果杨第4号染色体(LG_Ⅳ)上得到的1 968个负样本中,有12个数据可认为是miRNA,假阳性率为0.61%.
- 赵洁苑龚云路王翼飞
- 关键词：植物MIRNA
- 混合高阶隐马氏模型的EM算法被引量：2
- 2013年
- 提出了一类混合高阶隐马氏模型.基于模型降阶法,通过Hadar等价变换方法将混合高阶隐马氏模型分别转换为与之等价的两个混合一阶隐马氏模型,然后利用混合一阶隐马氏模型的EM算法建立了混合高阶隐马氏模型的EM算法,给出了混合高阶隐马氏模型的参数重估公式,并使用一阶隐马氏模型的标准技术来计算这些参数重估公式.该研究推广了Rabiner,Hadar和杜世平等人的结果.
- 叶飞王翼飞
- 关键词：EM算法
- 微丝相关蛋白HSPC300/hHBRK1与肌球蛋白Ⅵ相互作用位点的计算机预测
- 2010年
- HSPC300/hHBRK1蛋白作为BRK1的人类同源蛋白,参与细胞运动和物质运输.肌球蛋白Ⅵ是肌球蛋白家族的成员.HSPC300/hHBRK1和肌球蛋白Ⅵ共同定位于细胞的胞浆,hHBRK1可能通过与肌球蛋白Ⅵ相互作用,参与细胞内的物质运输.从结构角度出发,通过计算机模拟蛋白质间相互作用,预测二者作用区域,找出相关残基PHE43,LYS105,THR676和LEU40,即可能成为相互作用位点的重要残基,为进一步实验研究提供了重要信息.
- 王飞飞薛晓怡王翼飞
