国家高技术研究发展计划(863-2008AA10Z144)
- 作品数：3 被引量：13H指数：2
- 相关作者：杨章平毛永江吴海涛陈仁金吴正常更多>>
- 相关机构：扬州大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划江苏省高校优势学科建设工程资助项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 牛亚科6个群体LYZ基因序列分析及系统进化研究被引量：5
- 2009年
- 对牛亚科6个群体溶菌酶(LYZ)基因的编码区核苷酸序列进行PCR扩增和测序,结合GenBank上海福特牛该基因编码区核苷酸序列进行比对分析,并采用邻接法构建分子系统进化树。结果表明:在检测的样本中(水牛除外),有5个核苷酸多态位点,定义了9种单倍型;群内核苷酸多样性(Pi)在0.000 00~0.001 96之间,说明群体内遗传多样性程度较低。构建的分子系统发育树表明,瘤牛、蒙古牛、鲁西黄牛间关系密切,瘤牛和普通牛与牦牛关系相对较近,而与大额牛关系相对较远。
- 陈仁金杨章平毛永江冀德君常洪陈莹施雪奎吴海涛
- 关键词：牛亚科系统进化
- 奶牛IL-8基因结构和功能的生物信息学分析被引量：6
- 2013年
- 以奶牛IL-8基因为研究对象,运用生物信息学方法,对其编码的蛋白质结构、理化性质、信号肽、跨膜结构、亚细胞定位、二级结构以及高级结构进行生物信息学分析,并推测与其他物种的进化关系。结果表明:奶牛IL-8蛋白为稳定亲水性跨膜蛋白,定位于细胞外。二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,有2个Ser和2个Thr,可能成为蛋白激酶磷酸化位点,此外还有12个糖基化位点。保守结构域分析表明,奶牛IL-8蛋白有一个SCY锌指保守结构域。IL-8蛋白氨基酸邻接系统树分析表明,奶牛IL-8基因与绵羊的亲缘关系最近,具有较高的同源性。
- 刘贤慧杨章平吴正常甘宗辉刘姗
- 关键词：奶牛IL-8基因生物信息学
- 利用微卫星标记分析滩羊群体的遗传多样性及遗传分化被引量：2
- 2010年
- 利用10对微卫星标记对小尾寒羊、宁夏牧区园区白滩羊、保种场滩羊和黑滩羊的遗传多样性和遗传分化进行分析,根据DC和DA遗传距离构建系统树。结果表明:10个微卫星座位中共检测到167个等位基因,每个座位在每个群体均检测到5个以上的等位基因。座位和群体期望杂合度均在0.8左右;座位平均多态信息含量为0.722 3～0.838 5;园区白滩羊平均多态信息含量为0.794 6,保种场白滩羊平均多态信息含量为0.778 4,黑滩羊平均多态信息含量为0.772 3,群体平均多态信息含量为0.772 3～0.794 6。群体间表型分化系数为0.089 3,总群体近交系数为0.674 0,群体内近交系数为0.642 0。运用DC和DA遗传距离,分别采用UPGMA和NJ法构建的系统聚类图基本一致。综合遗传分化系数、遗传距离及聚类图,结果提示,滩羊与小尾寒羊群体间遗传分化程度最大,黑滩羊与白滩羊群体间存在一定的遗传分化,2个白滩羊群体间遗传分化程度相对最小。
- 陈仁金杨章平汤晓良李云龙张亚琴毛永江吴海涛
- 关键词：滩羊小尾寒羊微卫星DNA遗传分化
