国家公益性行业科研专项(nyhyzx200903017-08)
- 作品数:6 被引量:41H指数:4
- 相关作者:王国平洪霓徐文兴王利平王彦芬更多>>
- 相关机构:华中农业大学武汉市蔬菜科学研究所更多>>
- 发文基金:国家公益性行业科研专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 中国柑橘叶斑驳病毒和碎叶病毒发生状况及其分子特性研究被引量:10
- 2017年
- 柑橘叶斑驳病毒(Citrus leaf blotch virus,CLBV)和柑橘碎叶病毒(Citrus tatter leaf virus,CTLV)均可侵染柑橘的不同种。为明确CLBV及CTLV在中国柑橘上的发生状况和分子特性,采用RT-PCR技术对来源于中国7个省的342份和346份柑橘样品进行检测,检出率分别为9.6%和11.0%。对14个CLBV分离物和15个CTLV分离物的外壳蛋白(Coat protein,CP)基因部分序列分析显示,CLBV分离物间cp核苷酸和编码氨基酸序列相似性分别为82.1%~100%和88.1%~100%,CTLV分离物的cp核苷酸和编码氨基酸序列相似性分别为89.5%~100%和92.5%~100%。测定的14个CLBV分离物在系统进化树中聚为2个组;而CTLV分离物分组不明显,该病毒的系统进化与寄主来源无明显关系。
- 项周程桥谢宗周王国平洪霓
- 关键词:柑橘碎叶病毒系统进化分析
- 侵染我国芋的杆状DNA病毒分子鉴定及特异性检测被引量:8
- 2013年
- 采用已报道杆状DNA病毒属(Badnavirus)的通用检测引物BadnaFP/BadnaRP,从7份芋样品中扩增到Badnavirus病毒的RT/RNaseH基因保守区域,获得12个克隆序列,长度为576bp。序列分析结果显示,来自不同样品的克隆间核苷酸和氨基酸序列相似性分别为78.8%~99.5%和81.3%~99.5%;来自同一样品扩增产物的克隆间在序列上也存在较大差异,核苷酸和氨基酸序列相似性分别为89.6%~100%和92.7%~100%。在系统进化树中,本研究所获序列与Badnavirus病毒的亲缘关系相对较近,聚在同一簇,表明此病毒为Badnavirus属病毒,但与芋杆状病毒(Tarobacillifo硎virus,TaBV)序列相似性较低,核苷酸和氨基酸相似性分别为58.0%~62.2%和58.5%~64.1%,推测为杆状DNA病毒属的一个新种。根据所测定序列设计了用于该病毒检测的引物P197/P433,对51份芋样品检测结果表明,该引物可有效检测来源于我国芋的Badna—virus病毒。
- 施世明王彦芬王国平王利平徐文兴洪霓
- 关键词:PCR
- 芋病毒病田间调查及毒氟磷对芋病毒病的防治效果被引量:7
- 2012年
- 对芋病毒病及类似病害症状进行调查,其症状表现主要分为羽状花叶、叶片向上卷曲并伴有黄化或花叶、脉间黄化、明亮褪绿黄斑、褪绿斑点(斑驳)及叶片皱缩和叶缘黄化。采用RT-PCR和PCR技术对随机采集的32份表现症状的鄂芋一号样品进行了芋花叶病毒(DsMV)和芋杆状病毒(TaBV)2种病毒的检测,检出率均为68.8%。同时,利用30%毒氟磷可湿性粉剂500倍液和1 000倍液对芋病毒病进行田间药效试验,第一次施药后10 d调查,毒氟磷可湿性粉剂500倍液和1 000倍液的防治效果分别为30.9%和24.9%;第二次施药后15 d调查,500倍液和1 000倍液防治效果分别为72.8%和59.4%。田间药剂试验结果表明,毒氟磷可湿性粉剂500倍液比1 000倍的防治效果好,从田间芋头长势可看出,毒氟磷对芋头生长有明显的促进作用。
- 王彦芬Syeda Amber Kazmi曲林宁王国平刘玉平洪霓
- 关键词:病毒病
- 芋花叶病毒的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析被引量:4
- 2012年
- 采用RT-PCR技术对采自中国湖北、浙江和山东的91份芋[Colocasia esculenta(L.)Schott]样品的芋花叶病毒(Dasheen mosaicvirus,DsMV)进行了检测,检出率为26.4%。对其中14个DsMV分离物的317bp扩增产物(为外壳蛋白基因的一部分)序列分析的结果显示,各分离物内的核苷酸变异相对较低,而分离物间存在较大的分子变异,相似性为68.3%~97.8%。对来自湖北和浙江的2个DsMV分离物DsMV-SCS和DsMV-JH的外壳蛋白基因(coatproteingene,cp)进行了测序,全长分别为951bp和987bp,二者cp核苷酸和氨基酸序列相似性分别为79.0%和82.3%,与已报道DsMV的cp核苷酸和氨基酸序列相似性分别为73.0%~92.1%和74.8%~98.2%,在构建的系统发育树上聚在两个不同的簇,各DsMV分离物的系统进化关系与其寄主和地理来源无显著相关性。
- 施世明王国平徐文兴王利平洪霓
- 关键词:芋花叶病毒RT-PCR外壳蛋白基因
- 来源于猕猴桃的柑橘叶斑驳病毒的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析被引量:19
- 2016年
- 柑橘叶斑驳病毒(Citrus leaf blotch virus,CLBV)为柑橘病毒属(Citrivirus)代表种。本研究采用RT-PCR技术从我国栽培猕猴桃上首次检测到CLBV.总检出率为13.3%。测定了5个CLBV分离物的外壳蛋白基因(coat protein gene,cp)序列,全长均为1092核苷酸(nt),分离物间印基因核苷酸和编码氨基酸序列相似性分别为83.2%~99.7%和91.9%~98.9%,这些分离物与新西兰报道的CLBV猕猴桃分离物M3.A核苷酸序列相似性仅为83%左右,与来源于柑橘及近缘种的CLBV分离物印基因核苷酸序列相似性为84%-86%。在基于该病毒印基因核苷酸序列的系统进化树中,本研究所测定的CLBV猕猴桃分离物与新西兰报道的除M3-A外的猕猴桃分离物聚在同一组群。研究结果为进一步明确CLBV在我国猕猴桃上的侵染和危害特点及建立该病毒的分子检测技术提供了重要信息。
- 朱晨熹王国平郑亚洲杨作坤王利平徐文兴洪霓
- 关键词:猕猴桃
- 侵染藠头的大蒜潜隐病毒分子鉴定及部分序列分析
- 2013年
- 藠头(Allium chinenseG.Don),为百合科葱属鳞球茎多年生植物,是一种高产、高营养和具有食疗作用的蔬菜类作物,也常作为中药材加以利用和研究。国内外学者对发生在葱属植物上的病毒病原鉴定和分类做了深入研究,但针对蓖头病害的发生特点和病原鉴定研究不多,自Chen等u0在我国发病野生蓖头样品中发现2种病毒即蓖头花叶病毒(Scallion mosaic virus,ScaMV)和蘸头x病毒(Scallion virus X,ScaVX)后,国内外没有更多有关蓖头病毒病的研究报道。
- 吴承春洪霓刘勇徐文兴王国平
- 关键词:分子鉴定藠头侵染葱属植物多年生植物