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江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ12658)

作品数：2 被引量：0H指数：0
相关作者：彭武林饶友生王樟凤柴学文更多>>
相关机构：南昌师范学院更多>>
发文基金：江西省自然科学基金江西省教育厅科学技术研究项目更多>>
相关领域：生物学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇生物学

主题

  • 2篇珍珠鸟
  • 2篇密码子
  • 2篇基因
  • 2篇基因表达
  • 1篇用法
  • 1篇密码子偏性
  • 1篇密码子用法
  • 1篇Z染色体

机构

  • 2篇南昌师范学院

作者

  • 2篇柴学文
  • 2篇王樟凤
  • 2篇饶友生
  • 2篇彭武林

传媒

  • 1篇江西农业大学...
  • 1篇生物信息学

年份

  • 2篇2013
共 2 条 记 录，以下是 1-2
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排序方式：
珍珠鸟(Taeniopygia guttata)小染色体基因表达的密码子偏性
2013年
从NCBI数据库(http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/mapview/map)下载珍珠鸟全部小染色体基因的cDNA序列,最终共有1 586个基因的CDS序列纳入统计分析。密码子的偏性分析使用CodonW(1.4.2)完成,初步确定了UUC、UCC、UCG等27个密码子为珍珠鸟小染色体基因表达的"最优"密码子。对应分析表明,影响珍珠鸟小染色体基因密码子使用的主要因素分别为GC3s、CDS的GC含量基以及因的表达丰度。珍珠鸟小染色体基因的密码子用法受到了基因碱基组成的显著影响,其密码子的偏性是碱基组成及选择等因素综合作用的结果。本研究的目的是系统探究珍珠鸟小染色体基因的密码子用法,探究鸟类基因表达的分子调控机制。
王樟凤柴学文黄润红彭武林饶友生
关键词：珍珠鸟密码子偏性
珍珠鸟(Taeniopygia guttata)Z染色体基因表达的密码子用法
2013年
从EMBL数据库下载珍珠鸟(Taeniopygia guttata)Z染色体全部基因的cDNA序列,共有610个基因的CDS序列纳入统计分析。使用CodonW(1.4.2)对CDS序列进行密码子偏性研究,确定了UUC、CUC、CUG等28个密码子为珍珠鸟Z染色体基因表达的"最优"密码子。对应分析表明,影响珍珠鸟Z染色体基因表达的密码子用法的主要因素分别为GC3s(同义密码子第3位的G C频率)、CDS的GC含量以及基因的表达水平。据此推论,珍珠鸟Z染色体基因表达的密码子偏性是核苷酸组成和选择等因素综合作用的结果。
王樟凤柴学文彭武林黄润红饶友生
关键词：珍珠鸟Z染色体密码子用法
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