国家林业局948项目(2006-G50)
- 作品数：6 被引量：22H指数：3
- 相关作者：陈瑶生张豪凌飞杜红丽汪亮亮更多>>
- 相关机构：华南农业大学中山大学华南理工大学更多>>
- 发文基金：引进国际先进农业科技计划广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 猪脂联素基因启动子克隆及多态性研究(摘要)(英文)被引量：2
- 2009年
- [目的]为脂联素基因作为脂肪沉积候选基因的研究提供依据。[方法]通过猪BAC文库筛选及引物步移法(primer-walking)的测序方法获得脂联素基因的启动子序列,具体步骤:通过已经发表的部分猪脂联素基因cDNA序列设计特异引物用于BAC克隆的筛选。以超级池DNA为模板进行第1次PCR反应,筛出含阳性克隆的超级池;以挑出的阳性超级池的3维池DNA为模板进行第2次PCR反应,根据阳性板池、列池、行池序号得到可能的阳性克隆号;依照阳性克隆号从工作文库中取出相应的BAC克隆,平板划线37℃倒置培养20 h。待菌落长好后,做菌体PCR鉴定,以确认克隆的正确性。将获得的BAC阳性克隆平板划线,37℃摇菌过夜培养,进行BAC的提取、纯化与酶切回收。先以M13引物向BAC两端测序,再以发表的cDNA序列外显子1设计测序引物采用primer-walking的方法,获得连续的DNA序列。采用PCR-RFLP技术对蓝塘猪、大花白猪、大白猪、长白猪和杜洛克猪5个品种共290头猪的脂联素基因启动子区的多态性进行分析。[结果]脂联素基因的5′侧翼区-1 010 bp(G/A)的SNP位点,本地猪种中GG基因型频率明显高于外来猪种;-394 bp(T/C)的SNP位点,本地猪种基因型分布较为丰富,而在外来猪种中却没有检测到CC基因型,且外来猪中T等位基因频率较高。[结论]脂联素基因上游-1 010 bp(G/A)的SNP位点突变可能会引起该基因转录水平的改变,而-394 bp(T/C)的SNP位点与基因转录水平及与脂肪沉积可能无关。
- 凌飞汪亮亮杜红丽李仕新陈瑶生
- 关键词：脂联素基因启动子SNP
- 猪脂联素基因启动子克隆及多态性研究被引量：3
- 2010年
- [目的]为脂联素基因作为脂肪沉积候选基因的研究提供依据。[方法]通过猪BAC文库筛选及primer-walking的测序方法获得脂联素基因的启动子序列,采用PCR-RFLP技术对蓝塘猪、大花白猪、大白猪、长白猪和杜洛克猪5个品种共290头猪的脂联素基因启动子区的多态性进行了分析。[结果]脂联素基因的5’侧翼区-1 010 bp(G/A)的SNP位点,本地猪种中GG基因型频率明显高于外来猪种;-394 bp(T/C)的SNP位点,本地猪种基因型分布较为丰富,而在外来猪种中却没有检测到CC基因型,且外来猪中T等位基因频率较高。[结论]脂联素基因上游-1 010 bp(G/A)的SNP位点突变可能会引起该基因转录水平的改变,而-394 bp(T/C)的SNP位点与基因转录水平及与脂肪沉积可能无关。
- 凌飞汪亮亮杜红丽李仕新陈瑶生
- 关键词：脂联素基因启动子SNP
- 瘦肉型种公猪生长曲线分析被引量：14
- 2008年
- 随着瘦肉型猪饲养量的不断增加,对瘦肉型猪生长发育规律的研究成为养猪业研究的重要方面之一。本研究采用Logistic方程与非线性混合效应模型方法,分析瘦肉型种公猪30￣100kg生长情况,结果表明:采用Logistic方程、非线性混合效应模型均能很好地拟合杜洛克、长白与大白种公猪的生长曲线,但非线性混合效应模型的拟合效果要优于Logistic方程,Logistic方程拟合低估了猪只的生长潜能。采用非线性混合效应模型拟合的结果还表明,瘦肉型长白种公猪的成熟体重要高于杜洛克、大白种公猪,表明目前长白种公猪选育更趋向于个体大型化,而大白种公猪趋向于个体小型化。
- 刘小红张豪罗道栩李加琪陈瑶生
- 关键词：LOGISTIC方程非线性混合效应模型瘦肉型猪
- 猪育种标记辅助选择的经济效益研究
- 2009年
- 为了研究在育种群中利用MAS对猪育种中所需选择的5个性状即NBA、BF、FCR、ADG、IMF的经济效益,本研究采用3个不同规模的基础群:母猪分别为100、200、300头,公猪都为10头,利用LE、LD和DR等3种类型标记对5个性状分别进行MAS闭锁繁育选择5个世代,基础群个体间无亲缘关系;估计育种值采用的模型为SBLUP(标准BLUP)模型(以此育种值为对照)、MBLUP混合模型(使用LE和LD标记时)和QBLUP模型(利用DR标记时)。由各性状利用MAS获得的额外遗传进展计算MAS带来的经济效益。研究结果表明,利用DR标记获得的经济效益高;3个规模不同育种群利用DR标记进行MAS时,300头母猪群体获得的经济效益最高;尽管利用LE标记比利用LD标记获得更多的额外遗传进展,但还是以利用LD标记获得的经济效益更高。
- 李娅兰张豪张勤陈瑶生
- 关键词：标记辅助选择
- 标记辅助选择在猪育种中应用效果的研究
- 2009年
- 本研究针对猪育种中重点考虑的窝产活仔猪数(NBA)、达100 kg体重日增重(ADG)、饲料利用率(FCR)、达100 kg体重的背膘厚(BF)、肌内脂肪含量(IMF)5个性状,利用连锁平衡(linkage equilibrium,LE)、连锁不平衡(linkage disequilibri-um,LD)标记和直接标记(direct marker,DR)3种类型的分子遗传标记,设计了3个规模不同的基础群,母猪数分别为100、200、300头,公猪数都为10头,基础群个体间无亲缘关系,育种群实施闭锁繁育。用Monte Carlo方法模拟了MAS的5个世代选择试验。育种值估计采用标准BLUP(Standard BLUP,SBLUP)模型(此育种值作为对照)、QBLUP模型(使用DR标记)、MBLUP模型(使用LD和LE标记)。结果表明,利用DR标记在各种情况下都比利用LD和LE标记获得的选择效率高;5个性状中,MAS对低遗传力、限性性状NBA的选择效率最高;当性状的QTL方差占遗传方差基本相同时,中等遗传力性状FCR的选择效率比高遗传力性状BF的更高;当性状的遗传力差异不大时,QTL方差占遗传方差比例大的性状FCR的选择效率比QTL方差占遗传方差比例小的性状ADG的更高。当利用QBLUP模型时,MAS对NBA的选择效率最高,ADG的选择效率最低。
- 李娅兰张豪张勤王青来陈瑶生
- 与猪脂肪沉积相关的几个候选基因研究进展被引量：3
- 2009年
- 猪IGF2基因、CUP3基因、ADIPOQ基因、SCAP基因、PPARγ基因、POUIFI基因、GHRL基和Ob基因影响猪脂肪沉积。综述了与猪脂肪沉积有关的候选基因的研究进展,以期为鉴定与猪脂肪沉积相关的候选基因、对猪脂肪沉积相关性状的遗传改良及提高猪肉生产性能提供指导。
- 凌飞李静
- 关键词：脂肪沉积候选基因
