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GenBank数据库中黄麻EST-SSR标记的开发及其通用性评价被引量：15: 2014年; 从GenBank公共数据库中下载黄麻表达序列标签838条,利用SSRPrimer软件对其进行SSR位点查找,利用Primer 3.0软件设计66对SSR引物,通过琼脂糖凝胶研究这些SSR引物的PCR扩增特点,以检测其多态性。结果表明,66对SSR引物在黄麻属6个不同类型材料的扩增中,42(63.6%)对引物至少在2个材料之间存在多态性。(AT)n重复基元和(GC-)n丰富的三核苷酸重复基元多态性较高,可作为黄麻SSR标记引物设计的首选。黄麻EST-SSR标记开发效率较高,不仅可以丰富黄麻分子标记的数量,而且为剖析黄麻重要性状的遗传机制奠定基础,这对于黄麻的遗传基础研究具有重要应用价值。; 张立武袁民航何雄威刘星方平平林荔辉陶爱芬徐建堂祁建民; 关键词：黄麻 EST SSR

SRAP和ISSR及两种方法结合在分析黄麻属起源与演化上的比较被引量：16: 2011年; 选用96份黄麻属种质资源,比较了SRAP、ISSR及二者结合的方法在黄麻属起源与演化研究上的可行性。结果表明:(1)SRAP方法的多态性条带比率为100%,高于ISSR方法的98.1%,平均每条引物扩增出的多态性条带亦高于ISSR方法。(2)SRAP方法构建的进化树可大致将各类型种质资源区别开来,可较明确、清晰地展现黄麻属的起源与演化趋势。但无法区分开个别种质;ISSR方法构建的进化树将很多圆果黄麻品种聚在一起,无法区别开来,且分支长度短,无法确定进化时间;(3)SRAP与ISSR结合构建的进化树将不同类型的黄麻种质资源有序排列,可清晰地明确其进化趋势及演化关系。比较而言,SRAP与ISSR分子标记结合的方法优于SRAP方法,而SRAP方法又优于ISSR方法,在进行相关研究时,应优先考虑采用SRAP与ISSR分子标记结合的方法。; 陶爱芬祁建民粟建光李爱青李木兰方平平林荔辉徐建堂吴建梅林培清; 关键词：黄麻 SRAP ISSR

A Genetic Linkage Map of Kenaf (Hibiscus cannabinus L.) Based on SRAP, ISSR and RAPD Markers被引量：4: 2011年; Kenaf (Hibiscus cannabinus L.) is one of the most economically important crops for non-wood fiber production. The objective of this study was to establish a genetic linkage map of kenaf with higher density of molecular markers. A semi-wild variety Ga42 and a cultivar Alain kenaf were used as parents to construct an F2 population consisting of 155 plants. The genetic linkage map comprising 134 marker loci was constructed, including 65 sequence-related amplified polymorphism (SRAP), 56 inter-simple sequence repeat (ISSR), and 13 randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. This map spans 2 108.9 cM and contains 20 linkage groups with an average marker density of 15.7 cM between the adjacent markers.; ZHANG Guang-qingQI Jian-minZHANG Xiao-chenFNAG Ping-pingSU Jian-guangTAO Ai-fenLAN TaoWU Wei-renLIU Ai-min; 关键词：RAPD标记 ISSR 随机扩增多态性DNA 简单重复序列

黄麻种质资源遗传多样性的SRAP分析被引量：5: 2012年; 为明确黄麻(Corchorus L.)种质资源的遗传多样性,采用SRAP分子标记方法,对来自13个国家的两个黄麻栽培种及野生种共96份黄麻种质资源进行了分析。研究结果如下:(1)供试黄麻种质资源之间的遗传距离在0.0169至0.9667之间,变幅较大,其中近缘野生种与其他种质的遗传距离最大,基本在0.8以上;圆果栽培黄麻与其他种质的遗传距离最小,平均<0.5。(2)当在聚类图上遗传距离为0.53处划切割线L1时,96份黄麻种质资源被分为两个大类群(Ⅰ、Ⅱ)、一个小类群(Ⅲ)和5个独立个类。(3)当在遗传距离为0.33处作切割线L2时,各大类群被分为不同的亚类群,并表现出按地域聚类的趋势。(4)供试黄麻种质资源基于SRAP分子标记的聚类与形态学上的表现并不完全一致。; 陶爱芬祁建民粟建光方平平林荔辉徐建堂吴建梅林培清; 关键词：黄麻 SRAP

SRAP结合ISSR方法分析黄麻属的起源与演化被引量：11: 2012年; 【目的】以SRAP结合ISSR分子标记方法从分子生物学角度分析黄麻属的起源与演化。【方法】以来自13个国家的黄麻属6个种共96份种质资源为供试材料,采用SRAP结合ISSR标记的方法,用MEGA软件结合DPS软件绘制黄麻属的进化树,并计算黄麻属各类型的进化时间。【结果】在供试黄麻种质资源中,近缘野生种黄麻处于进化树的最基础位置,且平均进化时间最长,是黄麻2个栽培种最原始的祖先类型。非洲为黄麻属野生种的起源与演化中心,中国是世界黄麻属的次生中心。非洲的野生长果种黄麻与栽培长果种黄麻起源均最早,为世界长果种黄麻的初生中心;印度-缅甸-中国毗邻地区为世界长果种黄麻的次生中心。中国南部以及与之相邻的南亚、东南亚地区为世界野生圆果种黄麻的起源中心,中国南部地区同时为世界栽培圆果种黄麻的起源中心。栽培圆果种黄麻的平均进化时间较短,说明圆果栽培种黄麻在进化上较长果种黄麻稍迟。【结论】非洲在黄麻属起源与演化上有重要地位,是世界黄麻属野生种和野生长果种黄麻及栽培长果种黄麻的起源中心;中国南部地区是世界栽培圆果种黄麻的起源中心。用SRAP与ISSR分子标记结合的方法,可较全面地计算黄麻属各类型的进化时间和绘制进化树,从而得到关于黄麻属起源与演化的较科学的结论。; 陶爱芬祁建民李木兰方平平方平平林荔辉; 关键词：黄麻 SRAP ISSR

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国家自然科学基金(31000734)

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