国家重点基础研究发展计划(G199053903)
- 作品数：2 被引量：7H指数：2
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- 人源新基因hGlyrichin的克隆及其功能的初步研究被引量：7
- 2005年
- 目的:克隆获得与mL52新基因(GenBank:AY028425)同源人类新基因hGlyrichin,并研究其功能。方法:采用PCR法从人胎肝cDNA文库中扩增出该新基因,因富含甘氨酸而命名为hGlyrichin,以RT-PCR和Northern杂交分析在多种细胞株中的表达及转录本大小,并对该基因进行生物信息学分析,利用pET22b表达载体构建重组质粒pET22bh-Glyrichin,转化大肠杆菌BL-21(DE3)中进行IPTG诱导表达。结果与结论:电子PCR证实该基因定位于人染色体20q11.22,包含3个外显子和2个内含子。Northern杂交结果显示为单一转录本,大小约600 bp,与mL52全长cDNA长度相符。所编码的蛋白为含有疏水区的小分子阳离子蛋白,相对分子质量和等电点分别为8182.83和9.58,二级结构(Garn ier-Robson模型)预测是以β折叠型为主,这些特点与目前已知的大多数阳离子抗菌肽的结构及部分理化特性极为类似,该基因转化后的大肠杆菌在IPTG诱导表达时的生长受到明显抑制,初步证实了hGlyrichin具有明显的抗菌活性。
- 杨超文尹丽莉张咏鱼咏涛赵彦林李红梅赵蕾侯冰赵光沙继斌赵士富
- 关键词：抗生素类聚合酶链反应甘氨酸
- 格拉利素抗菌肽家系的发现及部分功能验证被引量：3
- 2007年
- 目的:继发现人源性新抗菌肽基因并进行功能验证后,进一步发现高度同源蛋白质家系并进行功能验证。方法:利用生物信息学分析手段对该蛋白家系各成员进行系统分析,人工合成具有代表性的不同肽段,采用比浊法和菌落计数法测定人工合成肽段的抗菌活性。结果及结论:发现了富含甘氨酸并且序列高度同源的抗菌肽家系,命名为格拉利素(G lyrich in),目前含有来自不同生物的29个成员,所有成员均无相关功能研究报道;根据多序列比对结果所合成的、代表家系中9个成员的4条多肽均有不同程度的抗菌作用。上述生物信息学分析和实验研究结果强烈提示了新抗菌肽家系的存在,其中跨越哺乳动物的抗菌肽家系的存在已得到充分证实。
- 杨超文尹丽莉沙继斌赵光胡锴勋田泽君王冬梅赵士富
- 关键词：生物信息学抗菌活性序列同源性
