广东省科技计划工业攻关项目(2004B26001183)
- 作品数：2 被引量：22H指数：2
- 相关作者：杨丽萍张勇林浩然蒙子宁刘晓春更多>>
- 相关机构：中山大学西南林业大学海南大学更多>>
- 发文基金：广东省科技计划工业攻关项目广东省教育部产学研结合项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 中国大鲵脑cDNA文库构建及促甲状腺激素β亚基基因cDNA的克隆和序列分析被引量：6
- 2008年
- 以大鲵脑组织为材料,提取总RNA,应用CloneminerTM文库构建技术构建了cDNA文库。经检测,文库初始滴度为5.0×105cfu.mL-1,重组率为91.70%,插入片断大小在0.35～3.9kb,平均插入片段大小为0.791kb,文库扩增后滴度为4.0×109cfu.mL-1。随机挑选200个阳性克隆测序,经生物信息学分析,发现20个片段与已报道的基因有较高同源性,包括促甲状腺激素基因、生长激素基因及催乳素基因等,其中三个克隆为促甲状腺激素β亚基(TSHβ)基因。序列分析表明,TSHβcDNA全长序列为705bp,包含417bp开放读码框,编码138个氨基酸序列,其中前19个氨基酸为大鲵TSHβ亚基信号肽部分,后接119个氨基酸组成的TSHβ亚基成熟肽。同源性分析显示,大鲵TSHβ亚基与两栖类牛蛙、蟾蜍及爪蟾同一蛋白的同源性分别为53.6%、52.2%和60.3%。采用邻接法和最大简约法对部分脊椎动物TSHβ氨基酸序列构建分子系统树,结果显示有尾目大鲵为两栖动物中较早分化的一支,表明其进化地位较原始。RT-PCR组织分布分析发现,TSHβ基因除垂体有表达外,性腺也有少量表达。
- 杨丽萍杨慧荣张勇刘云黄海刘晓春蒙子宁黄俊海林浩然
- 关键词：CDNA文库
- 中国大鲵5个野生种群的AFLP分析被引量：16
- 2011年
- 采用AFLP技术对中国大鲵四川、贵州、湖北、陕西及河南五个野生种群的遗传多样性和遗传分化水平进行了评估。9对引物组合在5个野生种群中共扩增出507条带,其中多态性条带为354。多态位点比例(69.82%)、香农信息指数(0.362 9)和基因多样性指数(0.241 4)等参数均较高,显示中国大鲵遗传多样性水平较为丰富。AMOVA分析发现,中国大鲵遗传多样性绝大部分位于种群内(97.94%)。种群间遗传分化较弱(Фst=0.021,P<0.001)。根据种群间遗传距离构建的UPGMA树基本依照流域进行聚类,结合化石证据,推测中国大鲵由北向南进行扩散。
- 杨丽萍蒙子宁刘晓春张勇黄俊海黄景林浩然
- 关键词：遗传分化AFLP系统地理学
