国家自然科学基金(81000707)
- 作品数：4 被引量：8H指数：2
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- 相关机构：天津市疾病预防控制中心天津市预防医学研究所武警医学院更多>>
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- 尿道致病性大肠埃希菌新基因R049的敲除
- 2012年
- 目的探讨尿道致病性大肠埃希菌(uropathogenic E.coli,UPEC)132株新基因R049的敲除,构建R049缺失突变株。方法对基因敲除所需的质粒pKD46和pCP20分别进行抗生素抗性改造,在其bla基因(Amp)r中插入带有启动子的Zeocin抗性基因(zeo),使其均具有Zeocin抗性(Zeo)r。然后进行Red同源重组,利用pKD46(Zeo)r携带的λ噬菌体重组酶将氯霉素抗性基因替换UPEC132基因组的R049基因,再利用pCP20(Zeo)r携带的FLP重组酶消除氯霉素抗性标记,在染色体上只保留1个FRT位点。结果质粒pKD46和pCP20抗生素抗性改造完成,并利用Red同源重组完成了对UPEC132的R049基因的敲除。结论构建了尿道致病性大肠埃希菌R049缺失突变株UPEC132ΔR049,为进一步对R049基因的功能研究奠定基础。
- 杨东靖张维苏旭李力吕莉琨陈锦英
- 关键词：尿道致病性大肠埃希菌RED同源重组基因敲除
- 致病性大肠埃希菌感染小鼠肾脏的基因表达谱分析
- 2016年
- 目的了解尿道致病性大肠埃希菌(UPEC)感染小鼠肾脏的基因表达谱差异变化,探究宿主早期免疫和炎症反应过程。方法 2013年8月分别利用UPEC132菌株和磷酸缓冲液(PBS)经尿道逆行感染小鼠各20只,感染后于4和8h处死并解剖取其肾脏,随机取两组中4和8h各2只小鼠单侧肾,提取其RNA,利用基因表达谱芯片筛选其差异表达基因,并利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行信号通路分析。结果与PBS对照组相比,UPEC感染组小鼠肾脏在4和8h分别有204个和1 323个基因差异表达,KEGG通路分析共有59个差异表达基因直接与宿主细胞的6条炎症和免疫信号通路相关,包括细胞因子与其受体相互作用信号通路、抗原加工与呈递信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、Toll样受体信号通路、白细胞跨内皮迁移信号通路及自然杀伤性细胞介导细胞毒作用信号通路。结论利用表达谱芯片筛选得到的59个差异表达基因成为研究宿主早期免疫防御UPEC感染的潜在目的基因,为进一步揭示宿主与UPEC相互作用机制奠定基础。
- 杨东靖董杰张力张维李力吕莉琨郭丽茹苏旭
- 关键词：泌尿道感染致病性大肠埃希菌基因表达谱
- 尿路致病性大肠埃希菌的耐药和毒力全基因组分析被引量：4
- 2020年
- 目的:从基因组水平上探讨尿路致病性大肠埃希菌UPEC132株的耐药性和致病机制。方法:采用MIC法测定菌株UPEC132对16种抗菌药物的敏感性,多位点序列分型(MLST)方法对其分型,利用三代测序平台对其进行全基因组测序和组装,并用Prodigal软件预测和数据库筛选进行耐药和毒力基因功能注释,然后收集GenBank上23株UPEC菌株的染色体基因组序列,利用RAxML软件对UPEC132进行系统进化分析并构建系统进化树。结果:UPEC132菌株对氨苄青霉素、氨苄青霉素/舒巴坦、四环素、红霉素、氯霉素、头孢唑林耐药,其MLST分型为ST10522型。该株全基因组包括一条完整的基因组(染色体)序列及两条质粒序列,染色体、质粒P1和P2的序列大小分别为5234468 bp、117139 bp和101356 bp,鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)含量分别为50.48%、49.05%和54.04%。该株染色体、质粒P1和P2分别有4856、140和116个基因。其耐药基因多位于染色体,主要为耐多药外排泵基因簇,P2仅携带β-内酰胺酶基因blaTEM-1和四环素耐药基因tetG。UPEC132毒力基因也位于染色体,主要为菌毛黏附素9种、铁摄取系统5种和分泌性毒素3种。Afa菌毛和Ⅳ型菌毛基因簇分别位于质粒P1和P2上。系统进化树分析显示UPEC132与23株UPEC均不在同一分支。结论:UPEC132株的ST10522型为国内外首次报道的大肠埃希菌新ST型,其全基因组遗传信息被全面揭示,耐药性和致病性与其携带的多种耐药基因和毒力基因相关。
- 杨东靖苏旭吕莉琨张维王源于爱萍李晓燕
- 关键词：多位点序列分型耐药性毒力全基因组
- 尿道致病性大肠杆菌I型菌毛的研究进展被引量：4
- 2011年
- 泌尿道感染(Urinary tract infections,UTIs)是世界范围内严重的公共卫生问题。尿道致病性大肠杆菌(Uropathogenic Escherichia coli,UPEC)是引发UTIs的首要致病菌。I型菌毛是UPEC重要的毒力因子,在UPEC中分布广泛,介导其在泌尿道的粘附、侵入和定植。该文对UPECⅠ型菌毛的结构、装配和毒力机制进行综述。
- 杨东靖葛新李力
- 关键词：泌尿道感染I型菌毛
