安徽省自然科学基金(11040606M95)
- 作品数:3 被引量:29H指数:3
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- 分子标记在兰花遗传育种中的研究进展被引量:4
- 2012年
- 综述了RFLP、RAPD、SCAR、ISSR、SRAP、AFLP、SSR等分子标记的基本原理和主要特点,从遗传多样性分析、亲缘关系研究、种质资源鉴定、遗传图谱构建与辅助选择育种等方面介绍了分子标记在兰花遗传育种工作中的现状及其研究进展,并提出展望。
- 黄有凯陈程汪天张水明
- 关键词:分子标记兰花遗传育种
- 16个蝴蝶兰品种EST-SSR遗传多样性分析被引量:9
- 2013年
- 利用NCBI上提供的8188条蝴蝶兰EST序列开发EST-SSR引物,用来分析市场上较常见的16个蝴蝶兰栽培品种的遗传多样性。成功开发出9对多态性引物,这9对引物在16个蝴蝶兰品种上共检测出45个等位基因,每对引物可检测等位基因2~12个,平均为5个;SSR引物多态性信息量(PIC)变化范围为0.527~0.981,平均为0.755;16个蝴蝶兰品种间的遗传相似系数在0.550~0.875之间,平均为0.728,表明供试品种间的亲缘关系较近。UPGMA聚类分析结果表明,在遗传相似系数为0.70处可将16个蝴蝶兰品种分为4大类,第Ⅰ类包括满天红、巨宝红玫瑰等10个品种,第Ⅱ类包括夕阳红、富乐夕阳、昌新皇后和新原美人4个品种,第Ⅲ类包括萨拉黄金1个品种,第Ⅳ类包括台湾阿妈1个品种,聚类结果与花色特征比较一致。该研究结果对蝴蝶兰品种选育有一定参考价值。
- 张水明陈程陈芳芳汪天
- 关键词:EST-SSR聚类分析
- 蝴蝶兰EST资源SSR标记分析与开发被引量:18
- 2012年
- 利用SSRIT软件对NCBI上蝴蝶兰的8188条EST序列按照碱基重复单元数8以上的标准进行SSR位点查找,发掘出246条EST序列,共含有261个SSR位点,检出率为3.19%。二核苷酸重复是最主要的重复类型,占SSR总数的94.25%。SSR的不同重复单元中,最常见的重复单元是:(TA)n和(GA)n,其余出现频率较高的依次为(TC)n、(AT)n和(AG)n。设计了32对EST-SSR引物,以蝴蝶兰品种‘V31’的DNA为模板进行PCR扩增,发现16对引物能扩增出预期产物。进一步用这16对引物对16个蝴蝶兰品种(系)进行PCR扩增,9对引物有多态性,多态性条带数在2-12个之间。结果表明,设计开发的蝴蝶兰的ESToSSR标记是有效的。
- 张水明陈程龚凌燕汪天
- 关键词:EST-SSR分子标记