广州市科技计划项目(2007J1-C0111)
- 作品数：4 被引量：13H指数：2
- 相关作者：郭培国李荣华缪绅裕谢国文陈健辉更多>>
- 相关机构：广州大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广州市科技计划项目广州市教育局科研项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 用基因芯片技术分析铝胁迫下小麦的基因表达谱(英文)被引量：2
- 2007年
- 目的:采用基因表达谱分析方法,探讨小麦耐铝的分子机理。方法:利用抑制消减杂交(SSH)技术,以小麦的铝敏感品种Chisholm及其耐铝近等基因系Chisholm-T(其耐铝性来自小麦品种Atlas66)的根尖为材料,构建了2个铝胁迫后的SSHcDNA文库,共含有1628个表达序列标签(EST),利用这些EST制作了小麦根系的cDNA基因芯片。以cDNA基因芯片为平台,在铝胁迫后6h、1d、3d和7d,分别比较Chisholm和Chisholm-T之间的基因表达谱差异。结果:在各个时间点,耐铝和不耐铝小麦材料之间约有5%的EST表现出差异表达。对所有差异表达的EST进行测序分析,序列数据经Pipe-Online2.0进行毗连序列群(contig)拼接,发现只有8.3%的重复序列。结论:SSH是一种非常有效的差减和均一化的建库方法。对有功能注释的差异表达基因进行功能分类分析,表明这些基因参与了植物体内的电子传递、信号传导、植物保护和次生物质的代谢活动。
- 李荣华郭培国Guihua BaiPatricia Ayoubi
- 关键词：小麦基因芯片耐铝性表达谱
- 一种适用于教学的SDS-PAGE电泳实验指导被引量：7
- 2009年
- SDS聚-丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)是一种可靠的分析蛋白质特性技术。尽管该技术的操作方法和步骤已有很多文献作了较为详细地报道,但在指导学生实验中仍发现很多操作步骤不切合实际,如制胶过程复杂、操作步骤不清晰等。经过多年实践,修改了一些SDS-PAGE的操作步骤,降低实验难度,提高实验可操作性,适合于教学活动。
- 李荣华孙莉丽郭培国缪绅裕陈健辉谢国文王厚麟
- 关键词：制胶蛋白质分析电泳
- 与小麦赤霉病抗性紧密连锁的基于AFLP片段的STS标记开发(英文)被引量：1
- 2009年
- DNA序列标签位点(STS)是一个操作简便和花费低的分子标记体系,将与某一性状密切连锁的AFLP(扩增片段长度多态性)片段转换成STS标记可直接用于分子育种工作中.本研究利用Ning 7840和Clark的重组自交系及AFLP技术,探测到一个与小麦赤霉病抗性紧密连锁的坐落在染色体3BS的主效数量特性位点(QTL),发现5个PstI-AFLP片段与该QTL显著关联;其中2个片段与赤霉病抗性达到50%左右的表型变异解析度,一个为35个碱基的相引相片段,另一个为222个碱基的相斥相片段.222个碱基的DNA片段被克隆和测序,发现11个克隆中含有5种不同的DNA序列,其中一种序列在5个克隆中完全一致,该序列被用来作为设计STS标记的DNA模板.经多次实验,开发出了一个共显性STS标记.该STS标记与原222个碱基的AFLP片段谱带(banding pattern)完全一致,具有鉴别小麦育种材料赤霉病抗病强弱和加速抗病育种进程的潜力.
- 郭培国Guihua Bai李荣华缪绅裕Dina El-Khishin陶文琴陈建辉谢国文郑燕玲
- 关键词：扩增片段长度多态性小麦
- 用基因芯片技术分析干旱胁迫下生殖生长期大麦的基因表达(英文)被引量：3
- 2007年
- 耐旱性是干旱地区稳定和增加大麦产量的一个关键因素。鉴定出与耐旱性相关的功能基因,一方面可了解大麦的耐旱机理,同时还可以促进利用生物技术来改良大麦的耐旱性。在研究中,2个在耐旱性上具有明显差异的大麦品种Tadmor(耐旱)和WI2291(干旱敏感)被选作材料,采用22000个ESTs(基因表达序列标签)的Affymetrix大麦基因芯片Barley1来分析生殖生长期干旱胁迫下2个大麦材料的差异表达基因。研究结果表明,干旱胁迫下2个大麦材料中有77个共调节基因,其中部分基因已被报道过可能与抗旱性相关。这些基因中已有功能注释的基因按其生物学功能被分为14组,猜测它们是干旱胁迫的响应基因,在抗旱性上可能不起重要作用,或者是必需的但单独不足以提高大麦的抗旱性。进一步比较2个材料差异表达的基因,发现二材料之间有372个受干旱调节基因的差异。这些基因中有功能注释基因的生物学功能中可分为15组,其中一些已被认为与抗旱性相关;而对那些未知功能的基因,推测可能亦在大麦的抗旱性上扮演一定的角色。研究所得结果可为阐述生殖生长期大麦的耐旱性机理提供新的认识。
- 郭培国Michael Baum李荣华Stefania GrandoRajeev K VarshneyAndreas GranerSalvatore CeccarelliJan Valkoun
- 关键词：干旱胁迫基因表达基因芯片大麦抽穗期
