广州市科技攻关项目(2008Z1-E121)
- 作品数：2 被引量：10H指数：1
- 相关作者：莫德林刘小红肖正中王翀陈瑶生更多>>
- 相关机构：华南农业大学中山大学广东韶关学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广州市科技攻关项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 长白猪×蓝塘猪及其杂种基因组DNA甲基化分析被引量：9
- 2011年
- 本研究旨在分析猪基因组DNA胞嘧啶甲基化模式和程度以及父母代猪与其杂种F1代之间的甲基化差异。应用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术对6头长白公猪、50头蓝塘母猪及长×蓝51头杂交F1代3个群体共107个个体耳组织基因组DNA胞嘧啶甲基化模式和程度进行评估。应用筛选的20对引物扩增,总共得到1 074条带(CCGG位点),共得到415个甲基化位点(条带),其中79条带为甲基化多态性条带,平均甲基化多态性比率(p)达7.4%。结果显示,3个猪群中DNA甲基化程度高,且亲代和F1代杂种之间的甲基化水平存在差异,父母代及其杂交F1代3个群体基因组DNA甲基化总体水平分别是27.7%、27.8%和25.1%,且3个猪群中CCGG序列发生单链DNA外部胞嘧啶甲基化现象(20.8%)比单双链DNA内部胞嘧啶甲基化现象(17.9%)多。结果提示,使用MSAP技术检测猪种基因组甲基化多态性非常有效,且猪基因组甲基化多态性丰富,杂种F1代与其父母代之间的基因组甲基化水平存在差异。
- 肖正中刘小红王翀李加琪莫德林陈瑶生
- 关键词：甲基化MSAP
- 长白猪×蓝塘猪及其杂种基因组甲基化片段克隆与分析被引量：1
- 2011年
- 应用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术对6头长白公猪和50头蓝塘母猪及51头长白×蓝塘杂交F1代3个群体基因组DNA胞嘧啶甲基化位点进行检测,旨在克隆和分析父母代猪及其杂种F1代之间基因组DNA共同甲基化片段和差异片段,并找到其同源基因。结果显示,从MSAP条带中分离、克隆得到18条3个群体共同的甲基化片段、10条母代独有的甲基化片段和9条杂交一代独有的甲基化片段,其中有1条3个群体共有的甲基化片段通过EST拼接和电子延伸后在NCBI数据库中找到同源基因,即猪类酪氨酸蛋白激酶Lyn基因(GeneID:LOC100152890,序列号:XM_001926250)。结果表明,长蓝杂交F1代与其父母代之间的基因组甲基化存在异同,为通过MSAP技术克隆猪基因组DNA甲基化片段及寻找其对应的甲基化基因提供可能,也会为将来研究这些甲基化基因表达调控机制奠定基础。
- 肖正中刘小红王翀李加琪莫德林陈瑶生
- 关键词：甲基化MSAP
