广西高等学校科研项目(201203YB038)
- 作品数：3 被引量：19H指数：3
- 相关作者：吴耀生唐银琳罗育蒋东周青鸟更多>>
- 相关机构：广西医科大学桂林医学院广东医学院更多>>
- 发文基金：广西高等学校科研项目国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 绞股蓝法呢基焦磷酸合酶基因的克隆及其序列分析被引量：8
- 2014年
- 目的：克隆并分析绞股蓝法呢基焦磷酸合酶（FPS）基因的全长序列。方法：参照罗汉果法呢基焦磷酸合酶基因，设计扩增绞股蓝FPS基因的3’RACE引物，采用3＇RACE和5＇RACE法克隆绞股蓝FPS基因全长eDNA。结果：获得绞股蓝FPS基因全长eDNA序列共1288个核苷酸，包含一个1026核苷酸的开放读框，编码342个氨基酸残基，推断该蛋白的相对分子质量为3．94x10^4。NCBIBlast结果显示绞股蓝FPS基因编码蛋白的氨基酸序列与已知的植物FPS氨基酸序列的同源性为91％～74％，核酸序列的同源性为88％-78％。结论：克隆了绞股蓝FPS基因全长eDNA序列，为进一步研究绞股蓝FPS基因的表达及三萜皂苷合成通路关键酶分子的进化奠定了基础。
- 蒋东唐银琳陶晨陈吴耀生
- 关键词：绞股蓝基因克隆
- 白皮黄瓜鲨烯合酶基因cDNA克隆及生物信息学分析被引量：6
- 2016年
- 为认识葫芦科植物中葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因结构特征,克隆白皮黄瓜鲨烯合酶(squalene synthase,SS)基因c DNA并进行生物信息学分析。根据葫芦科植物绞股蓝、罗汉果、红花栝楼等的鲨烯合酶基因cDNA序列,设计白皮黄瓜鲨烯合酶引物,分别采用3'RACE和5'RACE技术扩增鲨烯合酶基因3'端和5'端。获得白皮黄瓜鲨烯合酶基因的两个cDNA克隆,命名为CsSS1和CsSS2,其cDNA序列全长分别为1 627 bp和1 534 bp,都编码417个氨基酸残基,分子质量为47.6 k D。成功克隆得到白皮黄瓜鲨烯合酶基因全长cDNA序列并对其进行序列分析,后续可用于葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因正选择位点功能分析。
- 马成通钱洁颖刘镛陶晨陈苏荷玲晁耐霞吴耀生
- 关键词：白皮黄瓜鲨烯合酶RACE基因克隆生物信息学分析
- 红花栝楼鲨烯合酶基因的克隆及其序列分析被引量：8
- 2015年
- 目的克隆红花栝楼鲨烯合酶（squalene synthase,SS）的基因并进行序列分析,为进一步研究葫芦科植物三萜合成通路关键酶SS的正选择位点与功能的关联性分析奠定基础。方法根据绞股蓝与罗汉果SS基因c DNA比对分析的结果,设计SS的5’端简并引物,采用3’RACE扩增红花栝楼SS全长c DNA基因。结果获得红花栝楼SS c DNA全长共1 466个核苷酸,其中包括一个含有1 254个核苷酸的开放读码框,编码417个氨基酸残基。通过NCBI的Blast比对,发现红花栝楼SS基因编码的氨基酸序列与已知植物SS基因编码的氨基酸序列同源性为78%~94%,核苷酸的同源性为74%~93%。结论成功克隆了红花栝楼SS的全长c DNA,为进一步研究红花栝楼SS基因结构、基因表达、基因突变提供了基础,并为葫芦科植物三萜合成通路关键酶SS的正选择位点与功能的关联性分析提供了数据支持。
- 陶晨陈马成通吴耀生周青鸟苏荷玲晁耐霞罗育
- 关键词：鲨烯合酶RACE基因克隆
