艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项(2008ZX10004-012) 作品数:15 被引量:64 H指数:5 相关作者: 王多春 阚飙 鄢盛恺 卢金星 程颖 更多>> 相关机构: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 中国科学院 中日友好医院 更多>> 发文基金: 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 自动化与计算机技术 更多>>
广东省霍乱病例与环境来源霍乱弧菌的耐药性和分子分型研究 被引量:10 2009年 目的比较分析广东省霍乱病例及环境来源O1/O139群霍乱弧菌抗生素敏感性和分子分型特征。方法选取2006-2007年广东省霍乱病例及相关来源、环境(珠江水体和海水产品)来源的O1/O139群霍乱弧菌。采用血清学、药物敏感性试验和分子生物学方法,研究不同来源的霍乱弧菌在菌型分布、药物敏感性、毒素基因携带以及分子分型方面的异同。结果2006-2007年,广东省共分离各类来源O1/O139群霍乱弧菌170株。其中,病例及相关来源菌株37株,环境来源菌株133株(海水产品来源37株、珠江水体96株)。两种来源菌株的菌型构成均以O1群E l Tor稻叶型为主;病例及相关来源菌株以产毒株为主,ctxA毒素基因携带率(83.8%)显著高于环境菌株(4.5%);药物敏感性试验显示,以产毒株为主的病例及相关来源菌株对萘啶酸和复方新诺明的耐药率(78.8%,78.8%)高于以非产毒株为主的环境来源菌株(50.6%,13.9%,P<0.05)。环境来源菌株对多西环素的耐药率(17.7%)高于病例及相关来源菌株(0%,P<0.05)。O139群菌株对氨苄西林的耐药率(70%)高于稻叶型和小川型菌株(8.9%,0%,P<0.01)。脉冲场凝胶电泳(PFGE)聚类分析显示,O139群霍乱弧菌产毒株之间,O1群霍乱弧菌流行株之间以及其他的O1/O139群霍乱弧菌之间,PFGE型别表现为明显的遗传多样性。结论广东省O1/O139群霍乱弧菌来源复杂多样,霍乱防控形势严峻,需要密切注意菌株型别变异情况及菌株变异趋势。 李柏生 谭海玲 王多春 邓小玲 陈经雕 王晓梅 钟豪杰 柯碧霞 柯昌文 阚飙关键词:霍乱弧菌 药物敏感性试验 分子分型 脉冲场凝胶电泳 医院分离艰难梭菌耐药性研究 被引量:3 2009年 目的通过对临床分离的8株产毒型艰难梭菌进行PCR分型以及抗生素敏感性分析,初步了解临床分离艰难梭菌的耐药情况,为临床用药提供参考依据。方法临床送检的粪便标本,经生化鉴定和毒素检测后,确定8株为产毒型艰难梭菌,分别采用PCR方法进行分型,并采用Etest方法测定8株艰难梭菌对氨比西林(AC)、克林霉素(CM)、甲硝唑(MZ)、万古霉素(VA)的最小抑菌浓度,并对耐药性进行初步分析。结果8株产毒型艰难梭菌中有5株属于同一型别,7株出现耐药;3株对AC耐药;7株对CM耐药;1株对MZ耐药;未检测到对VA耐药菌株。结论临床分离艰难梭菌耐药比例高,且存在多重耐药;临床应加强艰难梭菌及厌氧菌抗生素敏感性检测。 程颖 卢金星 鄢盛恺 贾红兵 李文革关键词:艰难梭菌 ETEST 最小抑菌浓度 PCR分型 基于Ontology的流行病学调查表定制的设计与实现 2011年 目的建立流行病学调查表ontology库,实现基于ontology流行病学调查表定制。方法使用protégév3.1建立流行病学调查表ontology库,通过计算机网络技术实现B/S(服务器/浏览器)架构的流行病学调查表定制。结果通过建立ontology流行病调查表本体库可以实现流行病学调查表定制功能。结论建立流行病学调查表ontology库是实现流行病学调查表定制的基础,应用现代计算机技术和通信技术可以实现流行病学调查表的定制功能,流行病学调查表定制可以增强现场流行病学调查的工作效率,增强调查信息的可处理性。 李亚品 方立群 史套兴 高素青 李艳丽 李秀君 杨红 张文义 钱全 卫兰 王真 曹务春关键词:ONTOLOGY 定制 马鞍山市金黄色葡萄球菌鉴定及SPA基因多态性分析 被引量:4 2011年 目的鉴定分离自马鞍山的金黄色葡萄球菌,探索使用金黄色葡萄球菌SPA基因对菌株进行多态性分析。方法采集马鞍山市食品、食物中毒和腹泻患者标本,按照GB/4789.10-2003和WS/T80-1996进行金黄色葡萄球菌的分离培养。对分离的菌株,用过氧化氢酶和血浆凝固酶试验后,用生化实验对菌株进行鉴定。提取鉴定为金黄色葡萄球菌的DNA作为模板,PCR扩增菌株的SPA蛋白X区域并测序,测序结果提交数据库(http://www.seq-net.org/)进行分型,采用分型软件Ridom Staph Type对分型结果进行聚类分析。结果 共分离和鉴定54株金黄色葡萄球菌,其中食品、食物中毒和腹泻标本分别为36株、11株和7株。所有菌株的过氧化氢酶及血浆凝固酶均为阳性,生化实验鉴定为金黄色葡萄球菌。54株菌株可分成19个型,分别为t 189型11株、t 701型9株、t 091型7株、t 1376型5株、t 011型、t 127型各2株、t 084型、t 163型、t 459型、t 547型、t 548型、t 791型、t 954型、t 1544型、t 4336型、t 5269型、t 5353型各1株,同时发现2个新型,分别为t 5269和t 5353型。两起食物中毒的型别分别为t 189型和t 701型。结论 SPA基因分型方法具有快速、易于标准化的特点,可用于食物中毒的流行病溯源。 汪永禄 王多春 詹圣伟 郑锦绣 陶勇 王利 闫笑梅 陶晓霞 张建中 阚飙关键词:金黄色葡萄球菌 食物中毒 双重巢式PCR监测外环境水中霍乱弧菌结果分析 被引量:1 2010年 霍乱弧菌(Vibrio cholerae)中只有产生霍乱肠毒素(CT)的O1及O139血清群能够引起腹泻和霍乱流行.监测外环境的霍乱弧菌有助于追踪霍乱的传播趋势[1].由于外环境存在的大量非致病霍乱弧菌及其他杂菌,分离培养数量相对较低的致病霍乱弧菌十分困难.本研究建立双重巢式PCR方法,用以鉴定致病霍乱弧菌[2],并于2007年6月至2008年6月,对福州地区闽江以及白马河水中霍乱弧菌按月进行动态监测. 陈爱平 杨劲松 徐海滨 董新平 罗朝晨 阚飙 王多春关键词:霍乱弧菌 巢式PCR 肾综合征出血热疫情与NDVI的时间关系——以内蒙古自治区大杨树镇为例 被引量:7 2009年 利用月度肾综合征出血热发病人数和长时序月度NDVI值的相互关系,对肾综合征出血热的发病趋势及发病人数进行预测。研究区大杨树镇2001—2005年共有144例完整的HFRS病人资料,以及同期详细的宿主动物捕获数据。基于Landsat TM影像以及Google earth影像,大杨树地区土地利用分为4种类型,山地、林地、农田以及居民点。各类土地利用类型的NDVI数据由SPOT-4卫星的VGT-S10数据集(10d最大化合成的NDVI数据)提供。对HFRS病例与NDVI之间的关系进行图解分析、相关分析和回归分析。研究表明,NDVI的峰值多出现于8月,而HFRS发病人数的峰值多出现在11月。前朔3个月的农田NDVI值与HFRS病例数之间的相关系数为0.67(P值<0.001)。农田NDVI峰值比HFRS病例的峰值提前了3个月。研究量化了NDVI与HFRS之间的关系,为HFRS早期预警系统的建立提供了依据。 闫磊 黄华国 张文义 王剑波 任玉环 方立群 黄晓霞 曹务春 闫守邕 王世文关键词:肾综合征出血热 SPOT NDVI 临床患者粪便标本中艰难梭菌感染状况研究 被引量:8 2009年 目的探讨医院艰难梭菌带菌及感染状况,分析艰难梭菌相关性腹泻(CDAD)的临床特征,为临床提高艰难梭菌分离率以及采取积极有效的防控措施奠定基础。方法随机收集20例要求做粪便培养的患者标本,采用艰难梭菌毒素A/B检测试剂盒进行毒素检测,对标本进行厌氧培养与分离,并进行耐氧实验,用API 20A生化条进行确证。结果20例患者经艰难梭菌选择性培养基培养后,8株疑似菌落进行涂片镜检和耐氧实验,6株革兰阳性杆菌耐氧实验阳性,再经API 20A鉴定,4株为艰难梭菌,占所有患者的20%;毒素阳性1例,占5%。结论艰难梭菌的感染与某些内科基础性疾病的存在相关;水样的粪便标本更易于培养出艰难梭菌。 程颖 卢金星 鄢盛恺 王靖 李杰 刘迎春关键词:艰难梭菌 艰难梭菌相关性腹泻 中国宿主动物中Amur汉坦病毒M片段全基因序列分析 被引量:1 2009年 目的测定中国宿主动物中Amur病毒M片段全基因序列,以了解其分子特征。方法设计特异的PCR引物,用RT-PCR法分段扩增JilinAP06株M片段全长,PCR产物经克隆后进行序列测定,然后进行系统发育分析和重组分析。结果JilinAP06株M片段全基因序列共3615个核苷酸,A+T含量为59.3%,G+C含量为40.7%,包含1个单一的开放读码框架,其最大读码框架从41-3448,由3408个核苷酸组成,共编码1135个氨基酸。序列同源分析表明,JilinAP06株与中国的人源Amur HV株同源性为96.0%-97.8%,与韩国大林姬鼠来源的SoochongHV同源性为85.6%.86.7%,与HTNV原型株76—118同源性仅为79.5%,而与其他各型病毒间的同源性均低于79.0%。氨基酸同源分析,其氨基酸序列与中国的人源株Amtll-HV同源性为98.1%~98.4%,与韩国大林姬鼠来源的Soochong HV同源性为96.4%-97.0%,与HTNV原型株76—118同源性为91.7%,而与其他各型病毒间的同源性均低于92.0%。系统发育分析结果显示,JilinAP06与Amur病毒构成一个相对独立的分支。结论从中国宿主动物中获得了AmurHV的M片段全基因序列。 郭卫东 张文义 江佳富 池海谊 王文瑞 王中元 金鹰 杨红 方立群 曹务春关键词:汉坦病毒 M片段 山西省从粪便中分离到产霍乱毒素的拟态弧菌 2010年 目的从山西省霍乱样粪便中分离到拟态弧菌,并检测其是否携带霍乱毒素基因。方法采集患者粪便、患者家用自来水、金鱼和鱼缸水标本,按照WS289-2008和《霍乱防治手册》(第5版)方法 ,对标本进行增菌和选择性培养基的分离培养,疑似菌落以霍乱弧菌血清凝集试验检测,并用API20E系统鉴定菌种。同时,疑似菌落用PCR检测O1、O139群特异性和是否携带霍乱毒素基因。结果粪便标本经增菌后接种选择性培养基,在庆大琼脂和碱性琼脂上均有霍乱弧菌疑似菌落,但在TCBS琼脂上为绿色、透明、中等大小、光滑、湿润的菌落;血平板上可见灰白色、湿润菌落,有透明溶血环;染色镜检湿片暗视野下未见流星状运动细菌。氧化酶和粘丝实验阳性,霍乱弧菌O1、O139群血清凝集试验阴性。菌株经API20E鉴定为拟态弧菌(93.5%可能性)。环境标本中未分离和检测到拟态弧菌。PCR检测该拟态弧菌中携带霍乱毒素基因,而O1、O139群特异性为阴性。结论从急性霍乱样腹泻粪便中分离到1株拟态弧菌,对于临床类似霍乱样症状的病例标本,当病原的霍乱弧菌血清凝集为阴性时,应进一步做霍乱毒素的检测。 郝瑞娥 王多春 张秋香 张凡非 李京 赵嵘 姚素霞 杨红霞关键词:粪便 霍乱毒素 拟态弧菌 2009年珠江河口霍乱弧菌动态探讨 本文采用09年珠江河口四个样区(老城区、城郊新区、城郊农渔业区、南沙围垦区)河水样本中分离的霍乱弧菌数据,以及同步实测的环境数据(包括水表温度、河水PH值),研究霍乱弧菌与环境之间的动态关系,阐述霍乱弧菌在珠江河口的比重... 岳玉娟 龚建华 王多春关键词:霍乱弧菌 温度 PH值 检出率 文献传递