云南省科技厅科研基金(2008CD194)
- 作品数：3 被引量：12H指数：2
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- 相关机构：云南省烟草农业科学研究院浙江大学更多>>
- 发文基金：云南省科技厅科研基金云南省烟草公司项目云南省烟草专卖局(公司)科技项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 烟草MITE位点间多态性(IMP)标记开发及其遗传作图应用被引量：8
- 2012年
- 为在烟草(Nicotiana tabacum)上进行IMP(inter-MITE polymorphism,MITE位点间多态性)标记开发,利用美国烟草基因组测序数据和MITE(miniature inverted repeat transposable element,微型反向重复转座元件)结构特征,通过生物信息学方法获得11 581组具有特异TIR(terminal inverted repeat,末端重复元件)序列的MITE及其多序列联配结果,并根据联配结果设计219条烟草IMP引物;利用9个不同类型烟草代表性品种进行测试,其中119条引物PCR扩增成功,引物开发成功率为54.6%;进一步对一个烤烟遗传群体亲本‘红花大金元’和‘HicksBroadleaf’进行标记筛选,共获得29个多态性标记,群体检测表明有21个标记可以整合定位到一个SSR标记遗传连锁图上.说明IMP标记在烟草中是一种可以利用的分子标记,但跟其他标记一样表现出较低的多态性,需高通量检测平台与之配套来提高其开发效率.
- 高玉龙桂毅杰肖炳光薄世平严广号樊龙江
- 关键词：烟草分子标记
- 应用IMP标记分析30份烟草品种的遗传关系被引量：5
- 2012年
- MITE（miniature inverted repeat transposable element）是植物中存在的高重复的一类转座元件。基于邻近MITE扩增多态设计的分子标记称为IMP标记（inter MITE polymorphisms）。从133个IMP引物中筛选出32个稳定多态的引物,并以30个烟草品种为材料,获得185个多态条带,平均每对引物检测多态条带5.78个。聚类分析显示,参试品种间遗传距离的变化范围为0.02~0.81、平均为0.33。30份烟草品种可分为3类,晒烟、香料烟、北方烤烟品种等属I类;第II类主要是美国NC系列品种、Coker系列品种和中国云烟系列烤烟品种;第III类为2个白肋烟品种。结果表明,IMP标记能够在烟草中扩增并获得品种间多态信息,可用于品种间的遗传关系分析,这为烟草的遗传研究及分子辅助育种奠定基础。同时,聚类结果显示,30个栽培烟草品种之间亲缘关系较近,丰富烟草种质资源应是今后育种的方向之一。
- 谢贺高玉龙宋中邦桂毅杰樊龙江肖炳光卢秀萍
- 关键词：烟草
- 烟草IMP分子标记体系的建立与优化
- 2012年
- 为满足烟草遗传分析的需求,建立稳定的IMP标记扩增方法,对IMP分子标记体系进行了优化。以烟草DNA为模板,利用Li-cor4300凝胶分离系统,优化了模板、Mg2+、dNTP、聚合酶浓度等IRD荧光引物扩增反应体系主要参数,建立分析IMP标记的平台。结果显示,影响烟草荧光引物扩增反应最大的因素是dNTPs和引物浓度,反应体系对Mg2+浓度的要求较宽泛,同时,不同的引物对各因素的浓度要求也有差异。最终确定20μL反应体系中,模板DNA70ng,Mg2+浓度2.0mmol/L,dNTPs为0.2mmol/L,rTaqDNA聚合酶1.5U,引物浓度均为1μmol/L。该体系扩增条带稳定,重复性好,适合烟草遗传多样性分析。
- 谢贺高玉龙桂毅杰宋中邦樊龙江肖炳光卢秀萍
- 关键词：烟草PCR反应体系
