上海市青年科技启明星计划(06QA14004)
- 作品数:6 被引量:41H指数:5
- 相关作者:陆豪杰杨芃原张莹贾韦韬许亚伟更多>>
- 相关机构:复旦大学上海市胸科医院更多>>
- 发文基金:上海市青年科技启明星计划国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:理学生物学更多>>
- 蛋白质组学中质谱分析前的预富集研究进展被引量:5
- 2007年
- 回顾了近年来生物质谱分析鉴定蛋白质及多肽前的预富集方法研究进展,其中包括固相微萃取富集方法、靶上富集方法、电洗脱富集方法以及磷酸化蛋白质/肽段的富集方法,总结和归纳了各种方法所具有的优缺点,引用文献59篇。
- 张莉娟陆豪杰杨芃原
- 关键词:生物质谱蛋白质多肽预富集磷酸化
- MALDI质谱成像技术在非小细胞肺癌中的应用研究被引量:7
- 2007年
- 采用基质辅助激光解吸电离时间飞行质谱成像技术分析组织切片已在基础与临床医学研究中迅速发展。质谱成像技术通过对冰冻组织切片表面的质谱扫描可以快速直观地得到组织中的分子,如蛋白、多肽等分布信息。采用质谱成像技术对人的非小细胞肺癌组织切片及癌旁组织切片进行研究,对基质覆盖方式和质谱条件进行了优化,初步建立了以质谱成像法寻找非小细胞肺癌中生物标志物的方法。在-20℃制备10μm的冰冻组织切片,用15g·L^-1的α-腈基-4-羟基肉桂酸(含0.1%三氟乙酸)的50%乙腈水溶液,以气流辅助喷洒的方式覆盖在组织切片表面,循环10次,置于干燥器中待干后,用正离子反射式和线性模式分别进行质谱扫描。通过对来自3位患者的10对肺癌/癌旁组织研究,结果表明,癌组织中有m/z3000~3500范围内的特征性簇峰出现。质谱成像技术用于非小细胞肺癌能够直观地在分子水平上反映出癌组织和正常组织间的差异,有望进一步提高肺癌临床诊断的准确度。
- 张莹陈岗陆豪杰杨芃原
- 关键词:基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱非小细胞肺癌组织切片
- 蛋白质组学中基质辅助激光解吸电离的基质研究进展被引量:15
- 2007年
- 基质辅助激光解吸电离(MALDI)技术是近年来发展起来的新的质谱离子化技术。本文较为系统地综述了应用于蛋白质组学中的MALDI基质的最新进展以及不同的基质的优缺点及应用范围,并且归纳了其发展趋势。
- 许亚伟陆豪杰杨芃原
- 关键词:基质辅助激光解吸电离质谱基质蛋白质多肽
- 聚甲基丙烯酸甲酯固定化碳纳米管作为MALDI基质的研究被引量:2
- 2008年
- 将聚甲基丙烯酸甲酯材料在多壁碳纳米管表面原位聚合,利用这种修饰的碳纳米管作为基质辅助激光解析离子化(MALDI)的基质,利用修饰后的碳纳米管可以"溶解"的特性实现了稳定的MALDI离子化,并且消除了在低质量端的基质噪音.此类聚合物衍生的碳纳米管具有相对较好的亲水性表面,可"溶解"在溶剂中.此方法适用于有机小分子、多肽、聚合物和蛋白质酶解肽段的质谱分析.实验表明聚甲基丙烯酸甲酯固定化碳纳米管能有效地吸收和传递激光能量,可与样品充分地分散混合,质谱检测背景低,重现性好,具有较宽的可测质量范围.此方法在小分子快速检测和蛋白质组学方面有很大的应用前景.
- 贾韦韬吴慧霞陆豪杰蔡瑞芳杨芃原
- 关键词:碳纳米管质谱基质
- 基质辅助激光解吸电离质谱用于生物组织的质谱成像应用进展被引量:7
- 2009年
- 基质辅助激光解吸电离质谱(MALDIMS)用于分析组织切片已成为质谱学的一个新领域。质谱成像技术通过直接对组织切片表面的质谱扫描,可以快速直观地分析组织中的分子,如蛋白质、多肽、药物分子、代谢产物等及其空间分布信息。本工作综述了组织切片的质谱成像原理,方法学和相关应用。
- 张莹陆豪杰杨芃原
- 关键词:基质辅助激光解吸电离质谱生物组织
- 含有28个氨基酸的复杂多肽的串级质谱全序列分析研究被引量:6
- 2007年
- 利用MALDI-TOF/TOFMS和ESI-MS/MS对一种含有多达28个氨基酸的复杂合成多肽成功进行了全序列测定.通过调节激光强度、碰撞诱导解离(CID)能量等质谱参数以及依据不同序列分析软件,获得了涵盖所有b型和y型碎片离子的串级质谱图.结果显示这种方法可以有效地解决denovo测序方法遇到的谱峰过于复杂导致运算死机等问题.通过讨论如何对含有超过20个氨基酸片断的多肽进行合格串级质谱实验,为蛋白质组学肽段序列测定提供了新的方法和思路.
- 贾韦韬陆豪杰贠栋杨芃原
- 关键词:多肽