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广东省卫生厅资助课题(B2006067)
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黄晓平
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食管不典型增生和早期食管鳞癌全基因组的变化特征分析
2008年
目的应用SNP芯片检测食管不典型增生和早期食管鳞癌全基因组的DNA拷贝数异常和杂合性缺失(LOH),探讨它们的变化特征。方法应用Affymetrix GeneChip Human Mapping 250K NspArray芯片检测1例原发性食管重度不典型增生和4例原发性早期食管鳞癌病变组织和配对正常食管组织的DNA拷贝数的变化和LOH。结果食管重度不典型增生只有极少数的DNA片段发生扩增,未发生缺失或LOH。早期食管鳞癌发生DNA扩增的染色体有1p、1q、2p、2q、3q、4q、5p、6p、6q、7q、8q、11p、11q、12p、12q、14q、17q、18p、19q、20q、22q和X;发生DNA缺失的染色体有1p、2q、3p、3q、4p、4q、8p、9p、9q、10q、11P、13q、16p、18q、19p、19q和22q;发生LOH的染色体有3q和9q。其中1p、19q、4q、11p等染色体发生扩增和3q、11p、2q、16p等染色体发生缺失罕见报道。结论食管重度不典型增生DNA的变异不明显;早期食管鳞癌DNA发生明显的扩增和缺失,但很少发生LOH。250K SNP芯片能够有效地检测食管不典型增生和早期食管鳞癌全基因组范围DNA拷贝数的变化及LOH,分辨率高,定位精确,这些结果为进一步定位筛选和克隆与早期食管鳞癌相关的基因提供了重要的理论信息。
张旭
朱志华
林鹏
杨弘
傅剑华
张兰军
龙浩
文静
黄晓平
方嬿
戎铁华
关键词:
食管不典型增生
食管癌
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