您的位置： 专家智库 > >

广东省自然科学基金(10151063201000036)

作品数：4 被引量：5H指数：2
相关作者：杨光付芹芹郭志云王穗湘荆春霞更多>>
相关机构：暨南大学中山大学更多>>
发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金广东省医学科学技术研究基金更多>>
相关领域：医药卫生更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 4篇医药卫生

主题

  • 4篇隐孢子虫
  • 4篇孢子虫
  • 4篇微小隐孢子虫
  • 3篇生物信息
  • 3篇生物信息学
  • 2篇亲环素
  • 2篇克隆
  • 2篇环素
  • 2篇基因
  • 1篇蛋白
  • 1篇乳酸脱氢酶
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇腺苷酸
  • 1篇酶基因
  • 1篇克隆与序列分...
  • 1篇激酶基因
  • 1篇家族
  • 1篇家族蛋白
  • 1篇巢式
  • 1篇巢式PCR

机构

  • 4篇暨南大学
  • 1篇中山大学

作者

  • 3篇孙小会
  • 3篇荆春霞
  • 3篇王穗湘
  • 3篇郭志云
  • 3篇付芹芹
  • 3篇杨光
  • 2篇李月琴
  • 2篇周天鸿
  • 1篇陈川
  • 1篇余新炳
  • 1篇刘国宁
  • 1篇张丽菊

传媒

  • 2篇中国人兽共患...
  • 1篇中国公共卫生
  • 1篇热带医学杂志

年份

  • 1篇2018
  • 1篇2012
  • 1篇2011
  • 1篇2010
共 4 条 记 录，以下是 1-4
全选 清除 导出
排序方式：
微小隐孢子虫LDH基因的克隆与序列分析被引量：2
2010年
目的克隆微小隐孢子虫(Cryptosporidiumparvum,Cp)南京株(NJ)乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)基因,测序并分析微小隐孢子虫NJ株CpLDH与其他隐孢子虫分离株LDH基因序列的差异。方法根据微小隐孢子虫已知LDH基因序列设计合成2对引物,应用巢式PCR技术从微小隐孢子虫NJ株基因组DNA中扩增LDH基因,并将其克隆到pMD18-T载体上,阳性克隆的重组质粒经PCR及双酶切鉴定后,用双脱氧链终止法对重组质粒中的插入序列进行测序,应用生物信息学方法分析CpLDH基因序列和其他物种LDH序列的同源性。结果巢式PCR扩增得到特异的CpLDH基因序列,经PCR及双酶切鉴定获得了正确的pMD18-T-CpLDH重组质粒。测序表明,NJ株微小隐孢子虫LDH基因全长966bp,编码322个氨基酸,该基因序列已登录GenBank,登录号为HM001298。序列分析表明,我国微小隐孢子虫NJ株与国外分离的Iowa II株LDH基因编码的氨基酸序列具有98%的同源性。结论成功克隆了微小隐孢子虫NJ株LDH基因;序列测定及同源性分析表明,微小隐孢子虫NJ株在LDH酶关键结构位点存在突变。
郭志云杨光荆春霞付芹芹孙小会王穗湘李月琴余新炳周天鸿
关键词：微小隐孢子虫乳酸脱氢酶巢式PCR生物信息学
微小隐孢子虫亲环素型肽脯氨酰顺反异构酶基因克隆与分析
2012年
目的克隆微小隐孢子虫(C.parvum)南京株(NJ)亲环素型肽脯氨酰顺反异构酶基因,测序并分析C.parvumNJ株与其他隐孢子虫分离株CyP-type PPIase基因序列的差异以及亲缘关系。方法根据GenBank上C.parvumIowa II株CyP-type PPIase基因序列,设计2对引物,应用巢式PCR扩增目的基因,并将其克隆入pMD18-T载体,对重组子进行双酶切和菌落PCR鉴定并测序,应用生物信息学方法分析C.parvum NJ株CyP-type PPIase基因与其它隐孢子虫株的核苷酸和氨基酸序列差异。结果巢式PCR扩增获得特异的目的基因,双酶切和菌落PCR鉴定获得正确的重组子,测序表明,扩增基因组DNA序列为746bp,含有目的基因ORF全长570bp,编码190个氨基酸。序列分析表明,我国C.parvum NJ株与国外分离的Iowa II株CyP-type PPIase基因的氨基酸序列具有99%的同源性。进化树分析表明,C.parvumNJ株与Iowa II株CyP-type PPIase基因之间的亲缘关系最近,与脑膜炎双球菌的亲缘关系最远。结论成功克隆C.parvumCyP-type PPIase基因,C.parvumCyP-type PPIase基因在氨基酸水平高度保守。
付芹芹杨光王穗湘孙小会郭志云张丽菊陈川刘国宁荆春霞
关键词：微小隐孢子虫克隆
微小隐孢子虫腺苷酸激酶基因克隆及分析被引量：1
2011年
目的获得微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum,Cp)南京(NJ)株的腺苷酸激酶(adenylate kinase,AK)基因的核苷酸和氨基酸序列,比对分析与其他隐孢子虫株AK基因序列的差异。方法采用昆明种小鼠建立微小隐孢子虫NJ株感染模型,根据GenBank微小隐孢子虫Iowa II株AK基因已知序列设计合成2对引物,应用巢式PCR方法从微小隐孢子虫NJ株基因组DNA中扩增AK基因,并将其克隆入pMD18-T载体;对重组质粒pMD18-T-CpAK经PCR及酶切鉴定后测序,应用生物信息学方法分析微小隐孢子虫NJ株AK基因与其他虫株的核苷酸和氨基酸序列差异。结果巢式PCR扩增获得特异的AK基因序列,酶切及PCR鉴定为正确的pMD18-T-CpAK重组质粒,扩增序列为903bp,含隐孢子虫AK全长基因663 bp;核苷酸序列测定及同源性分析表明,微小隐孢子虫NJ株AK基因与人隐孢子虫TU502 type 2株AK的同源性为99%,与微小隐孢子虫Iowa II株AK序列同源性为98%;进化树分析表明,微小隐孢子虫NJ株的AK基因与人隐孢子虫TU502 type 2株AK基因亲缘关系最近。结论成功克隆到微小隐孢子虫NJ株AK基因并获得GenBank基因登录号(HM067440),该AK基因在不同物种间高度保守。
付芹芹荆春霞杨光郭志云孙小会王穗湘李月琴周天鸿
关键词：隐孢子虫克隆生物信息学
微小隐孢子虫CyPs家族蛋白的生物信息学分析被引量：2
2018年
目的探讨微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum)Iowa Ⅱ株亲环素(CyPs)家族蛋白与微小隐孢子虫感染、致病、生存及与宿主免疫调控之间的关系。方法利用生物信息学工具,获取微小隐孢子虫Iowa Ⅱ株Cy Ps家族蛋白的序列信息,然后进行结构域预测、重要氨基酸位点的分析、motif搜索、蛋白的理化性质分析、信号肽预测和跨膜区预测,最后对不同物种的CyPs进行多重比对与进化树分析,并结合Blast-P同源比对和文献分析结果进行C.parvum Iowa Ⅱ株CyPs家族蛋白的功能预测。结果搜索到了C.parvum基因组中7个含有cyclophilin superfamily典型结构域的CyPs编码基因,分别是cgd1_870、cgd2_1660、cgd2_4120、cgd5_3350、cgd7_520、cgd8_1560和cgd8_2350。通过功能预测发现,cgd1_870的N端含有信号肽,是一个典型的分泌型肽酰脯氨酸顺反异构酶(PPIase),很有可能是隐孢子虫和宿主相互作用的重要分子基础;cgd2_1660属于Cyclophilin_PPIL3_like亚家族,缺乏环孢菌素A(CsA)结合需要的关键氨基酸残基,无法结合CsA发挥免疫抑制作用;cgd2_4120属于cyclophilin_ABH_like亚家族,且含有CsA_PPIase_1 motif,在隐孢子虫细胞内可以作为CsA的胞内受体发挥着对隐孢子虫的免疫抑制作用;cgd7_520不仅具有CyPs家族的典型功能而且还具有WD40家族蛋白的相关功能,可能在隐孢子虫的生存过程中发挥着重要的作用;cgd8_2350还含有一个RRM结构域,不仅具备亲环素家族典型的PPIase活性,并且能够结合核酸参与基因表达过程的各种RNA加工过程,是一个对基因转录后水平有重要影响的蛋白。结论隐孢子虫基因组中存在7种CyPs的编码基因,其特征与功能均存在异同,其中cgd1_870具有分泌型的信号肽,是一个分泌性蛋白。
郭志云荆春霞黄小英杨光
关键词：微小隐孢子虫亲环素生物信息学分析
全选 清除 导出
共1页<1>
聚类工具0