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国家自然科学基金(31071944)

作品数:7 被引量:17H指数:3
相关作者:王正寰杨刚刘楠王小明郑灿军更多>>
相关机构:华东师范大学中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心)中国疾病预防控制中心更多>>
发文基金:国家自然科学基金上海市青年科技启明星计划更多>>
相关领域:医药卫生生物学更多>>

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 4篇医药卫生
  • 3篇生物学

主题

  • 3篇啮齿
  • 2篇绦虫
  • 2篇啮齿类
  • 2篇啮齿类动物
  • 2篇微卫星
  • 2篇棘球绦虫
  • 2篇棘球蚴
  • 1篇定居点
  • 1篇动物
  • 1篇多态
  • 1篇多态性
  • 1篇多态性分析
  • 1篇休闲
  • 1篇休闲活动
  • 1篇岩羊
  • 1篇野生动物
  • 1篇遗传多态
  • 1篇遗传多态性
  • 1篇遗传多态性分...
  • 1篇英文

机构

  • 5篇华东师范大学
  • 3篇中国疾病预防...
  • 2篇中国疾病预防...
  • 1篇教育部
  • 1篇新疆维吾尔自...
  • 1篇上海科技馆

作者

  • 5篇王正寰
  • 1篇郑灿军
  • 1篇刘楠
  • 1篇王小明
  • 1篇杨刚

传媒

  • 2篇中国寄生虫学...
  • 1篇兽类学报
  • 1篇Zoolog...
  • 1篇中国血吸虫病...
  • 1篇Scienc...
  • 1篇中国病原生物...

年份

  • 1篇2022
  • 1篇2021
  • 1篇2020
  • 1篇2019
  • 2篇2014
  • 1篇2013
7 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
基于粪便DNA的藏狐微卫星位点筛选及个体识别(英文)被引量:4
2014年
藏狐是我国青藏高原东部多房棘球绦虫和石渠棘球绦虫最主要的野生动物终末宿主。棘球绦虫会导致一类称为棘球绦虫病的致死性人兽共患疾病,青藏高原东部牧区是该病重要的流行区。因此作为终末宿主,评估藏狐种群的棘球绦虫感染率对于该病的流行病学研究意义明显。而要获取这方面信息,首先必须了解藏狐的种群数量。为此,我们基于非损伤取样的原则,使用藏狐新鲜粪便作为研究材料,从已发布的藏狐及近缘种的48个微卫星位点中筛选了11个用于藏狐粪便DNA多态性分析。对2011-2012年7-8月间收集的128份有效藏狐粪便样品(2011年68份,2012年60份)进行特异性PCR扩增,并用琼脂糖凝胶电泳和荧光引物标记法进行基因分型,根据各位点的等位基因频率计算出各位点的基因型数(N),期望杂合度(H e)、观测杂合度(H o)、多态信息含量(PIC)以及不同个体基因型相同概率值(PI)。结果发现,各位点N介于4-7,H e为0.66-0.80,H o为0.17-0.68,PIC为0.5496-0.7623。11个位点的累积PI值满足个体识别的需要(PI biased=1.283×10-11;PIsibs=7.572×10-5)。但是,由于粪便DNA质量差异较大,不同位点的扩增成功率差异较大(0.176-0.926)。我们发现,按照扩增成功率由高到低排列,前6个微卫星位点(P03,CXX172,CPH6,CPH8,P01i,P08)的扩增成功率均超过0.6,且累积PI值小于0.004(PI biased=2.775×10-7;PI sibs=3.606×10-3),表明这6个位点可以对藏狐进行个体识别。因此,针对本研究的数据,制定了如下的个体识别原则:(1)只有粪便DNA至少成功扩增出前6个微卫星位点的样品可以进入下一步分析;(2)所有位点的信息均相同的两个样品被认为是来自同一个体;(3)保险起见,如果仅有一对位点信息不相等,此两个样品依然被判定来自同一个体。在此基础上,我们从2011年样品中识别出30个藏狐个体,从2012年样品中识别出21个个体。
杨应远刘楠左清秋仁青彭措谢飞杨刚王正寰
关键词:藏狐微卫星DNA粪便DNA
Genetic diversity and population structure of a Sichuan sika deer(Cervus sichuanicus) population in Tiebu Nature Reserve based on microsatellite variation
2014年
Cervus sichuanicus is a species of sika deer(Cervus nippon Group). To date, research has mainly focused on quantity surveying and behavior studies, with genetic information on this species currently deficient. To provide scientific evidence to assist in the protection of this species, we collected Sichuan sika deer fecal samples from the Sichuan Tiebu Nature Reserve(TNR) and extracted DNA from those samples. Microsatellite loci of bovine were used for PCR amplification. After Gene Scan, the genotype data were used to analyze the genetic diversity and population structure of the Sichuan sika deer in TNR. Results showed that the average expected heterozygosity of the Sichuan sika deer population in TNR was 0.562, equivalent to the average expected heterozygosity of endangered animals, such as Procapra przewalskii. Furthermore, 8 of 9 microsatellite loci significantly deviated from the Hardy-Weinberg equilibrium and two groups existed within the Sichuan sika deer TNR population. This genetic structure may be caused by a group of Manchurian sika deer(Cervus hortulorum) released in TNR.
Ya HEZheng-Huan WANGXiao-Ming WANG
关键词:四川梅花鹿微卫星位点PCR扩增
青海省玉树市人群定居点周围小型啮齿类动物种群动态及棘球绦虫感染调查被引量:5
2021年
目的调查青海省玉树市人群定居点周围小型啮齿类动物种群动态及其棘球蚴感染情况。方法2018年5、8月和10月,在青海省玉树市巴塘乡和隆宝镇牧场布置鼠夹捕捉啮齿类动物,测量捕获的动物体质量和头体长并根据形态学进行种类鉴定。提取动物肝脏组织和病灶组织DN A,PCR扩增棘球绦虫线粒体cox1基因进行虫种鉴定,PCR检测阳性组织样本进行病理观察。计算啮齿类动物棘球蚴感染率,基于棘球绦虫cox1基因序列构建系统进化树。结果累计捕获小型啮齿类动物285只,其中高原鼠兔143只(50.2%)、青海田鼠141只(49.5%)、高原松田鼠1只(0.3%),高原鼠兔和田鼠在栖息地选择上表现出明显分离。青海田鼠数量与植被覆盖度呈正相关(r=0.350,P=0.264),在8月达到最高水平;高原鼠兔数量与植被覆盖度呈负相关(r=-0.371,P=0.235),在8月活动频率最低、5月活动频率最高。高原鼠兔雌雄性别比例为1:0.96,田鼠雌雄性别比例为0.82:1;高原鼠兔体质量(r=0.519,P<0.01)和头体长(r=0.578,P<0.01)随月份呈逐渐增大趋势,田鼠体质量(r=-0.401,P<0.01)和头体长(r=-0.570,P<0.01)随月份呈逐渐下降趋势;田鼠中未发现棘球绦虫感染,高原鼠兔石渠棘球绦虫感染率为2.1%。系统进化树显示,青海省玉树市石渠棘球绦虫和四川省甘孜藏族自治州石渠县境内发现的石渠棘球绦虫cox1基因序列一致。结论青海省玉树市人群定居点周围小型啮齿类动物主要为高原鼠兔和青海田鼠,高原鼠兔和青海田鼠分别在5月和8月达到最大种群数量;随着玉树市棘球蚴病防治措施的有效实施,人群定居点周围小型啮齿类动物棘球蚴感染率处于较低水平,但仍然存在棘球蚴病传播风险。
王旭左清秋余晴宋成玺王正寰肖宁王元甲翁晓东韦旭周鸿让崔小玉
关键词:啮齿类动物高原鼠兔青海田鼠种群动态
四川省石渠县啮齿类动物棘球蚴感染情况调查被引量:4
2019年
目的调查石渠县啮齿类动物构成及其棘球蚴的感染状况,为当地的棘球蚴病防治提供科学依据。方法于2015年7-8月在四川省石渠县云波沟设置4个间距为500 m的样方(0.25ha2)捕捉啮齿类动物,通过形态学方法进行物种鉴定,采用分子生物学技术检测啮齿类动物棘球蚴感染情况。结果共捕获啮齿类动物368只,其中高原鼠兔占19.0%(70/368),长尾仓鼠占0.5%(2/368),青海田鼠占74.2%(273/368),白尾松田鼠占5.4%(20/368),肢体残缺无法分类鉴定的田鼠占0.8%(3/368)。啮齿类动物DNA检测棘球蚴感染率为4.9%(95%CI:2.7%~7.1%),其中多房棘球蚴感染率为0.3%(0-0.8%),石渠棘球绦虫感染率为4.6%(2.5%~6.8%),未检测到细粒棘球蚴感染的个体。t检验显示4个样方中青海田鼠的捕获数均显著多于高原鼠兔(t=-3.431,P<0.05)。χ^2检验显示高原鼠兔和青海田鼠石渠棘球蚴感染率显著高于多房棘球蚴感染率(χ^2=值分别为14.578和7.515,均P<0.05),兔形目动物棘球蚴感染率显著高于啮齿目动物棘球蚴感染率(χ^2=4.850,P<0.05)。结论在石渠县青海田鼠和高原鼠兔是主要啮齿类物种和棘球蚴的主要野外中间宿主。在包虫病的防治中应加强对这两种物种的检测,控制棘球蚴病的传播。
翁晓东慕志强王旭刘佳余孙晓慧王正寰
关键词:包虫病棘球蚴啮齿类
青藏高原棘球蚴病的传播生态学被引量:2
2022年
野生动物疫源性疾病不但威胁人类健康,还严重影响全球的生物多样性保护。我国青藏高原东部牧区是世界范围内已知人棘球蚴病患病率最高的地区。当地多样的野生和家养哺乳动物构成了棘球蚴病复杂而稳定的传播链。本文概述了青藏高原牧区棘球蚴病的流行病学研究现状,并从宿主动物群落结构和动态、宿主行为生态学特征、人类活动干扰等3个方面探讨影响青藏高原棘球蚴病传播的生态学原理。并在此基础上,就青藏高原棘球蚴病的综合防治及高原生态系统的保护和可持续发展提出建议。
左清秋郑佳鑫王刚王旭王小明王正寰
关键词:棘球蚴病棘球属青藏高原宿主野生动物
新疆新源县和四川石渠县啮齿动物及家畜棘球绦虫线粒体cox1基因遗传多态性分析被引量:2
2020年
目的了解新疆新源县和四川石渠县棘球绦虫线粒体细胞色素。氧化酶亚基1 (cox1)基因的遗传多态性,探讨棘球绦虫在我国的传播动力和传播方向。方法 2014-2018年,在新疆新源县、四川石渠县捕捉啮齿类动物并采集其肝组织样品,收集家畜病变脏器。提取肝组织和病变脏器组织的DNA,PCR扩增棘球绦虫cox1基因片段,经分子克隆、测序后,在NCBI数据库中比对以确定所感染的虫种。使用Clustal X2和MEGA 7剪辑序列,使用DnaSP v5和Arlequin 3.5计算核苷酸多态性和中性检验,分析新源县和石渠县棘球绦虫的遗传多样性。以石渠棘球绦虫为外群,用MrBayes 3.2.4建立基于cox1基因的贝叶斯系统进化树,总结分析虫种的基因型。采用Network 5.0绘制棘球绦虫cox1基因的单倍型网络图,分析单倍型结构。结果在新疆新源县捕获普通田鼠122只,收集绵羊病变脏器5个;在四川石渠县捕获青海田鼠144只、经营田鼠44只和高原鼠兔135只,收集牦牛病变脏器6个。其中从5只绵羊、4头牦牛的病变脏器样品DNA扩增获得细粒棘球绦虫cox1基因片段40条(新源县26条,石渠县14条),从8只普通田鼠、14只青海田鼠、5只经营田鼠和2只高原鼠兔获得多房棘球绦虫线粒体cox1基因59条(新源县20条,石渠县39条),扩增产物长度均为875 bp。细粒棘球绦虫在两地的遗传分化程度(Fst=0.088 63)高于多房棘球绦虫(Fst=0.000 88),新源县细粒棘球绦虫遗传多样性(0.002 58±0.000 46)低于石渠县(0.005 88±0.000 58),而其多房棘球绦虫遗传多样性(0.002 28±0.000 46)高于石渠县(0.001 37±0.000 30)。贝叶斯系统进化树显示,两地的细粒棘球绦虫基因型为G1型,多房棘球绦虫为亚洲型。序列比对发现25个细粒棘球绦虫cox1基因单倍型(新源县15个,石渠县9个,共同单倍型1个)和29个多房棘球绦虫cox1基因单倍型(新源县13个,石渠县15个,共同单倍型1个),两种棘球绦虫的单倍型网络图�
王旭候岩岩王莹王正寰薛垂召张尹刘白雪韩帅郑灿军伍卫平
关键词:棘球绦虫遗传多态性
Behavioral responses of blue sheep(Pseudois nayaur) to nonlethal human recreational disturbance被引量:2
2013年
Nonlethal human recreational activities have been confirmed to have negative effect on wild animals in a number of ways,including changes in behaviors,avoidance of suitable habitats and declines in breeding success.Studies on the anti-disturbance mechanism of wild animals to human disturbance can provide valuable knowledge to the management of wild animals and the evolutionary mechanisms of behavioral adaptation to their habitats.To evaluate how blue sheep(Pseudois nayaur) would react to nonlethal human recreational disturbance,we studied their anti-disturbance strategy towards human disturbance in Suyukou National Forest Park(SNFP),Helan Mountains,Yinchuan of Ningxia Hui Autonomous Region.Using multinomial logistic regression models(MLRMs),we sought to answer two questions:(1) which kind of human recreational behavior would evoke the most serious anti-disturbance behaviors in blue sheep;and(2) how would various ecological factors influence the anti-disturbance strategy of blue sheep to human recreational disturbance? We collected 10 habitat and population variables and evaluated three kinds of reaction of blue sheep-no response,vigilance and flight.A total of 921 observations qualified to enter MLRMs.We found that habitat type(HT),gender(GEN),head direction(HD),visibility index(VI),and disturbance source(DS) were the five variables that significantly influenced the intensity of reactions of blue sheep.Blue sheep were more alert to tourists than to vehicles,and roads were the habitat type that caused the most intensive reaction of alertness where human disturbance was the highest.Females were more vigilant than males.Blue sheep might feel safer when staying in open habitat,and taking a front head direction provided them with the highest vigilance.Based on these results,we present suggestions to SNFP for the management of ecotourism and blue sheep conservation.
JIANG TianYiWANG XiaoMingDING YouZhongLIU ZhenShengWANG ZhengHuan
关键词:休闲活动非致命性岩羊LOGISTIC回归模型
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