国家自然科学基金(31201568)
- 作品数：2 被引量：14H指数：2
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- 相关机构：安徽农业大学安庆师范学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金安徽省高校省级自然科学研究项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 大豆TPS基因家族全基因组鉴定、分类与表达分析被引量：11
- 2014年
- 利用大豆基因组数据库,通过生物信息学分析,鉴定并获得大豆TPS家族基因所有成员的全序列、基因结构和定位信息。利用序列比对对大豆TPS家族基因进行进化和分类分析,同时通过soybase大豆发育表达芯片数据库相关信息,对该家族基因成员的组织表达谱进行了检测。研究结果表明,大豆基因组中含有20个TPS家族基因成员。系统发育分析将这些TPS基因分成了两个亚家族。基因定位分析表明,这些成员基因分别分布于大豆的14条染色体上。启动子分析表明,全部大豆TPS家族基因的启动子区都含有逆境反应顺式作用元件。转录水平芯片数据分析同时显示,大豆TPS家族基因大多在花、根、根瘤等组织中存在优势表达。该研究结果将促进大豆TPS家族基因的功能研究与利用。
- 谢翎汪章勋黄勃
- 关键词：大豆进化分析
- 大豆CYS家族基因的鉴定、启动子分析及EST表达研究被引量：3
- 2014年
- 利用大豆基因组数据库,通过生物信息学分析,鉴定并获得大豆所有CYS家族基因的序列、结构以及定位信息。全基因组分析检测表明,大豆染色体DNA中共含有19个CYS家族基因成员。基因定位分析表明,这些基因分别分布于大豆的12条染色体。系统进化分析将大豆的全部CYS基因分成了3个亚家族。启动子分析揭示,19个大豆CYS基因的上游调控序列都含有逆境反应顺式元件。EST表达谱分析表明,大豆CYS家族基因大多在子叶、花、叶片以及种皮等组织中优势表达。
- 谢翎金正俊汪章勋黄勃
- 关键词：进化分析
