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中央高校基本科研业务费专项资金(KYZ201125)

作品数:3 被引量:7H指数:2
相关作者:陈园园张良云李琴张瑾李强更多>>
相关机构:南京农业大学更多>>
发文基金:中央高校基本科研业务费专项资金国家教育部博士点基金江苏省自然科学基金更多>>
相关领域:理学生物学更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 2篇理学
  • 1篇生物学

主题

  • 2篇支持向量
  • 2篇支持向量机
  • 2篇向量
  • 2篇向量机
  • 1篇代数
  • 1篇多样性
  • 1篇人类基因
  • 1篇双代数
  • 1篇特异
  • 1篇启动子
  • 1篇启动子预测
  • 1篇子群
  • 1篇位点
  • 1篇粒子群
  • 1篇粒子群优化
  • 1篇类基因
  • 1篇基因
  • 1篇剪接
  • 1篇剪接位点
  • 1篇OPF

机构

  • 3篇南京农业大学

作者

  • 3篇张良云
  • 3篇陈园园
  • 2篇张瑾
  • 2篇李琴
  • 1篇王忠伟
  • 1篇李强
  • 1篇张文

传媒

  • 1篇生物物理学报
  • 1篇安徽农业大学...
  • 1篇中国科学:数...

年份

  • 1篇2015
  • 1篇2014
  • 1篇2012
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
Hom-Hopf代数的对极和Drinfel’d偶被引量:3
2012年
本文证明了带有等价Hom-范畴的Hom-双代数是Hom-Hopf代数,在基本结构定理成立的前提下,构造了对极使其成为Hom-Hopf代数.研究了拟三角Hom-Hopf代数的对极,并给出了Hom-Hopf代数的Radford公式.最后,对有限维Hom-Hopf代数,引入了Drinfel’d偶的概念,同时证明了Drinfel’d偶是拟三角Hom-Hopf代数.
王忠伟陈园园张良云
基于位置关联权重矩阵及序列组分的多样性增量识别剪接位点被引量:4
2014年
前体mRNA的剪接是真核基因表达的关键阶段,识别剪接位点对基因表达也起着至关重要的作用。作者用紧邻与非紧邻的位置关联权重矩阵及组成分的多样性增量得到的五维特征向量来表示序列,应用支持向量机对供体位点和受体位点进行识别。采用5-fold交叉检验,得到供体和受体位点的马修斯相关系数分别为0.924和0.947,ROC曲线下面积分别为99.08%和99.54%。与一些传统方法相比,这一方法考虑了位点之间的相关性和序列的生物信息,表现出特征少、精度高等优点。
李琴张瑾骈聪陈园园李强张良云
关键词:支持向量机剪接位点
基于粒子群优化的支持向量机算法识别人类基因启动子
2015年
人类基因启动子识别是医学研究的基本需要。提取DNA序列碱基的PZ曲线特征、二核苷酸空间结构特征、保守信号似然得分,以及K联体似然得分,结合GC含量变化和非均匀指数,构建基于粒子群优化的支持向量机算法来识别人类基因启动子。利用粒子群优化支持向量机参数进行优化避免了人为选择的随机性,并且在分类问题中表现出较好的稳健性。对测试集的10-折交叉检验结果为:敏感性为92%,特异性为91%,马修斯关联系数为0.83。该结果表明,基于粒子群优化的支持向量机算法能有效识别启动子序列。
张文陈园园张瑾骈聪李琴张良云
关键词:粒子群优化支持向量机启动子预测
共1页<1>
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