国家自然科学基金(31100497)
- 作品数：2 被引量：24H指数：2
- 相关作者：曾艳玲谭晓风张琳江南田雷更多>>
- 相关机构：中南林业科技大学湖南工业大学康涅狄格大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金湖南省科技计划项目引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 油茶总RNA的提取与内参基因的初选被引量：9
- 2014年
- 为得到高质量的油茶总RNA及稳定的内参基因,以油茶良种‘华硕’为试验材料,采用ambion试剂盒结合CTAB法进行总RNA提取。获得的总RNA完整性好,纯度高;从前期构建的油茶转录组数据中选取ACT(肌动蛋白基因)等14个基因作为候选内参基因,共设计22对引物,通过RT-PCR反应体系的优化及琼脂糖凝胶电泳检测,快速筛选出了适合油茶不同组织(器官)的内参基因。ALB(清蛋白基因),EF1α(延伸因子基因),ETIF3H(启动因子基因),UBC2(泛素结合酶基因)可以作为油茶果实初选内参基因,EF1α可以作为油茶根、茎、花及果实内参基因,ETIF3H可以作为油茶根、茎、叶、花瓣的内参基因。
- 宋志波刘敏贾宝光田雷曾艳玲周俊琴谭晓风张琳
- 关键词：油茶RNA提取内参基因逆转录PCR
- 基于RNA-Seq的油茶种子α-亚麻酸代谢途径及相关基因分析被引量：15
- 2014年
- 以油茶果实膨大期和油脂合成高峰期的种子为材料,进行转录组测序和表达谱数据库构建,并对油茶种子α-亚麻酸代谢途径相关基因进行分析。转录组测序获得油茶种子α-亚麻酸代谢非冗余基因Unigenes序列共112条,与α-亚麻酸代谢密切相关的不饱和脂肪酸合成途径非冗余基因Unigenes序列94条,包含12种调控α-亚麻酸代谢主要酶基因。表达谱数据分析显示,果实膨大期和油脂合成高峰期的α-亚麻酸合成代谢途径相关基因具有不同的表达模式,参与油茶种子α-亚麻酸的合成及形成多种不饱和脂肪酸的物质转化。采用实时荧光定量PCR方法验证油茶种子LOX,AOS,ACOX,AOC,OPR,AACT,PLA2,HPL,DOX,MFP,FAD2,FAD3等关键基因在油茶种子油脂合成不同时期的相对表达量,结果表明各基因表达规律与表达谱数据分析结果一致。克隆、调控这些相关基因将会为提高α-亚麻酸含量的油茶育种提供依据。
- 江南谭晓风张琳曾艳玲
- 关键词：油茶表达谱
