中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2011JBFA02)
- 作品数：5 被引量：36H指数：3
- 相关作者：傅洪拓乔慧龚永生蒋速飞熊贻伟更多>>
- 相关机构：中国水产科学研究院淡水渔业研究中心南京农业大学更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项江苏省高技术研究计划项目农业科技跨越计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 应用SSR和SRAP标记构建青虾遗传连锁图谱被引量：9
- 2012年
- 采用SSR和SRAP标记结合拟测交策略构建青虾（Macrobrachium nipponense）遗传连锁图谱。共有175个标记（含27个SSR、148个SRAP标记）分布在53个连锁群上。每个连锁群含2~8个标记,其中不少于3个标记的连锁群有35个,连锁对18个,平均每个连锁群的标记数为3.3个;连锁群长度在6.7~91.2 cM之间,相邻标记间最大间隔为49.0 cM,最小为1.4 cM,平均间隔为13.1 cM。青虾框架图谱长度为997.2 cM,图谱观察总长度为2 270.5cM,根据估算,青虾遗传连锁图谱预期长度为4 380.6 cM,图谱的覆盖率为51.83%。本研究构建了青虾遗传连锁图谱,该图谱也是淡水虾蟹类第一张遗传连锁图谱,可为青虾QTL定位、基因克隆、遗传选育等提供指导,并为进一步构建高密度的青虾遗传连锁图谱奠定了基础。
- 乔慧吴滟傅洪拓龚永生蒋速飞熊贻伟
- 关键词：青虾日本沼虾SSRSRAP遗传连锁图谱
- 青虾泛素特异性蛋白酶9基因Usp9全长cDNA序列的克隆及表达分析被引量：1
- 2015年
- 本研究首次克隆了青虾的Usp9(ubiquitin-specific protease 9)基因全长c DNA序列,并在青虾中使用荧光定量PCR技术首次检测了Usp9基因在不同组织和发育阶段中的表达变化。青虾Usp9基因c DNA全长1259 bp,包括162 bp的5’UTR,978 bp的开放阅读框以及116 bp的3’UTR。氨基酸序列比对分析显示,青虾Usp9蛋白与太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)、凤仙花熊蜂(Bombus impatiens)及灰短尾负鼠(Monodelphis domestica)的蛋白相似度分别为99%、97%和95%。应用MEGA5.1软件对青虾与其他物种的Usp9氨基酸进行系统进化树分析,结果表明,青虾Usp9与同为甲壳纲的钩额型蚤状溞聚为一支,具有最近的亲缘关系。采用荧光定量PCR技术检测了Usp9基因的时空表达,水温28℃时,Usp9基因在青虾发育的后幼体发育期第5天PL5出现表达高峰。Usp9基因在6种成体组织中均有表达,表达水平依次为:脑>腹神经>精巢>卵巢>肌肉>肠。而在雌雄组织差异表达分析表明,精巢中Usp9基因表达量比卵巢的比值为2.86,脑组织中雄虾的表达量比雌虾为2.27,差异均为极其显著(P<0.01)。这表明Usp9基因的表达和雄性偏向基因趋势是一致的(雄性表达:雌性表达≥1.5)。本研究为进一步开展青虾Usp9基因功能等相关研究奠定了基础,并可为青虾性别的遗传调控机制研究提供参考。
- 袁晖周巧张世勇傅洪拓孙盛明乔慧张文宜
- 关键词：青虾基因克隆
- 青虾高血糖激素基因全长cDNA序列的克隆及表达分析被引量：11
- 2013年
- 本研究首次克隆了青虾(Macrobrachium nipponense)高血糖激素(crustacean hyperglycemic homone,CHH)基因全长cDNA序列,并使用荧光定量PCR技术首次检测了CHH基因在青虾不同组织中的表达。青虾CHH基因cDNA全长1 017 bp,包括241 bp的5′UTR,408 bp的开放阅读框(ORF),355 bp的3′UTR,开放阅读框编码135个氨基酸。成熟肽包含6个CHH家族中位置保守的Cys残基。青虾CHH成熟肽C端为GK,确定为ES型CHH基因。蛋白相似度比对显示,所分离的青虾CHH被归为CHH家族I型肽。系统进化树分析表明,青虾CHH多肽与罗氏沼虾聚在一起,具有最近的亲缘关系。荧光定量PCR检测显示,CHH基因在青虾不同组织中均有表达,其表达量由高到依次为眼柄、精巢、腹神经节、脑、肠、肝、心脏、卵巢。以卵巢为参照其表达量设为1时,眼柄与精巢CHH基因表达量分别为卵巢的500倍和250倍,由此推测CHH基因可能与雄性生殖过程相关。
- 金舒博王宁乔慧傅洪拓吴滟龚永生蒋速飞熊贻伟
- 关键词：青虾CDNA定量PCR
- 青虾咽侧体抑制激素基因全长cDNA序列的克隆及表达分析被引量：3
- 2013年
- 咽侧体抑制激素(Allatostatin,AST)是一类由几至几十个氨基酸构成的神经肽类激素,在甲壳动物中刺激下颌器官合成甲基法尼酯,影响甲壳动物的蜕皮和生殖。然而AST基因在甲壳动物中的克隆和表达却罕见报道。研究克隆了青虾的AST基因全长cDNA序列,在甲壳动物中使用荧光定量PCR技术检测了AST基因在不同组织中的表达。青虾AST基因cDNA全长2995 bp,包括242 bp的5′非编码区(UTR),647 bp的3′UTR,2106 bp的开放阅读框(ORF)。开放阅读框编码701个氨基酸,可转录翻译出35个AST多肽,在C末端都具有相同的Y/FXFGL-amide结构,属于A型-AST。氨基酸序列比对显示保守氨基酸为Tyr、Ala、Phe、Gly、Leu。蛋白相似度比对显示,AST多肽在无脊椎动物的进化中是相对保守的。系统进化树分析表明,青虾AST多肽与罗氏沼虾聚在一起,具有最近的亲缘关系。荧光定量PCR检测显示,AST基因在所有被检测组织中均有表达,由高到低依次为:肝胰脏>肠道>精巢>脑>心脏>卵巢。对青虾AST基因全长cDNA序列克隆和表达的研究为更进一步的了解AST多肽在青虾中的重要功能奠定了基础。
- 卜宪飞李真真乔慧傅洪拓吴滟龚永生蒋速飞熊贻伟
- 关键词：青虾基因克隆基因表达
- 青虾种质资源研究与保护进展被引量：13
- 2012年
- 为了有效开展长江中下游地区青虾规模化养殖等工作。本研究简要总结青虾基础生物学、生化组成、细胞遗传学、生化遗传学、分子遗传学及基因组学等方面的主要研究成果,并对青虾种质资源的保护利用提出了一些意见。旨在为青虾种质资源的合理利用和保护提参考资料。
- 吕丁傅洪拓乔慧吴滟龚永生蒋速飞熊贻伟
- 关键词：青虾日本沼虾种质资源
