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国家自然科学基金(31201362)

作品数：10 被引量：105H指数：4
相关作者：李琳李冰徐振波邓阳刘晓晨更多>>
相关机构：华南理工大学马里兰大学国立台湾大学更多>>
发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
相关领域：轻工技术与工程医药卫生更多>>

文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 7篇轻工技术与工...
  • 3篇医药卫生

主题

  • 4篇葡萄球菌
  • 4篇球菌
  • 4篇金黄色葡萄球...
  • 4篇黄色葡萄球菌
  • 4篇基因
  • 4篇基因组
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  • 3篇食品
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  • 2篇测序
  • 1篇芽孢
  • 1篇芽孢杆菌
  • 1篇易感
  • 1篇沙门氏菌
  • 1篇食源
  • 1篇食源性
  • 1篇啤酒

机构

  • 10篇华南理工大学
  • 8篇马里兰大学
  • 1篇中山大学附属...
  • 1篇武汉工程大学
  • 1篇国立台湾大学

作者

  • 10篇李冰
  • 10篇李琳
  • 9篇徐振波
  • 4篇邓阳
  • 3篇刘晓晨
  • 2篇周蓉
  • 2篇刘君彦
  • 1篇张霞
  • 1篇苏健裕
  • 1篇卞华伟
  • 1篇赵喜红
  • 1篇姬莉莉
  • 1篇侯玉超

传媒

  • 9篇现代食品科技
  • 1篇食品工业科技

年份

  • 1篇2016
  • 5篇2015
  • 3篇2014
  • 1篇2013
共 10 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
基因组De novo组装结合比较RNA-Seq策略在VBNC状态乳杆菌转录组学研究中的应用被引量：3
2016年
本文应用有参考基因组组装策略对一株提取自啤酒中的乳杆菌的两种生理状态进行转录组学分析。利用基因组测序技术得到此株乳杆菌的全部基因组信息之后,把此株乳杆菌用低温诱导至VBNC状态,对正常状态和VBNC状态乳杆菌提取总RNA。对RNA质量进行验证,将符合要求的RNA进行逆转录形成c DNA,之后进行文库构建和Solexa测序。通过相关指标对测序结果进行评估,之后以此前获得的全基因组序列为对照,进行转录组与基因组的序列比对和基因表的达差异分析。结果显示比对率大于95%,表达上调的基因有21个,表达下降的基因有7个。本文所应用的基因组De novo组装结合比较RNA-Seq策略与常规De novo RNA-Seq策略相比,省却De novo拼接与组装的繁琐步骤,具有更高的准确性,为今后食品微生物在不同生理状态中分子调控机制的研究提供重要基础。
徐振波侯玉超刘君彦邓阳张霞李冰李琳
关键词：乳杆菌转录组VBNC
De novo测序技术在啤酒易感乳杆菌全基因组研究中的应用被引量：2
2015年
本文应用De novo测序技术对一种未经测序的啤酒易感乳杆菌进行全基因组研究,包括全基因组遗传信息的首次获取以及基因功能的生物信息学分析与注释。通过对1株从啤酒中分离获得的乳杆菌基因组DNA进行提取与纯化,构建了符合质量要求的测序文库,并进行了De novo测序;通过对De novo测序数据进行筛选与质量评价,进一步对筛选后的数据进行了De novo组装与结果评价,最后获得乳杆菌全基因组序列;在获得全基因组序列的基础上,对全基因组序列进行基因预测,并对预测基因进行GO基因功能注释、COG基因功能注释与KEGG生物通路注释,获取了该乳杆菌的基因序列与基因功能信息。该乳杆菌全基因组测序数据与组装结果良好,获得的序列中共有1,824个预测基因,其中分别有545、1,303、120条预测基因有相应的GO、COG、KEGG注释。本研究为该啤酒易感乳杆菌功能基因的研究与生物信息学分析提供了基础数据和技术参考。
刘君彦李琳李冰邓阳徐振波
关键词：DE
环介导恒温核酸扩增法在病原微生物快速检测领域的应用被引量：11
2014年
环介导恒温核酸扩增法(loop-mediated isothermal amplification of DNA,简称LAMP)是一种新型的核酸扩增方法,可以针对靶基因的目标区域形成多种片段的扩增产物。目前对于LAMP产物的检测主要有沉淀法,荧光法和电泳法。与PCR相比,LAMP不需要模板的热变性、长时间的温度循环、繁琐的电泳等,其扩增与检测过程可以实现一步完成。因此LAMP技术具有快速、简单、高特异性、高灵敏度和成本低廉的优点。随着LAMP技术的不断完善,在可预见的将来,其将在核酸扩增领域逐渐取代PCR反应,推动检测技术向更快捷简便、更精确廉价的方向发展。目前LAMP技术已应用于致病微生物和胚胎性别鉴定等检测,其中致病微生物包括致病细菌、真菌、病毒及寄生虫等。该检测技术在食品安全、临床医疗及水产等主要领域也受到广泛应用。本文主要介绍LAMP反应的特点及其在细菌、病毒、寄生虫和水产动物病原微生物快速检测领域中的应用。
李琳周蓉李冰赵喜红卞华伟
关键词：核酸扩增
金黄色葡萄球菌耐药性与生物被膜能力的鉴定被引量：13
2014年
本文选择常见的典型食源性微生物金黄色葡萄球菌,从食品微生物安全角度出发,对127株葡萄球菌的菌株特性、耐药性与生物被膜生长能力进行研究,包括菌株生化鉴定;PCR扩增葡萄球菌特异16S rRNA与金葡菌特异femA基因,通过对耐药基因mecA和orfX检测确定菌株的耐药特性;最后,运用结晶紫染色法进行生物被膜能力检测。127株菌株包括119株金葡菌(均携带16S rRNA与femA)与8株凝固酶阴性葡萄球菌8株(仅携带16S rRNA)。119株金葡菌中,107株携带mecA基因与orfX基因,为耐甲氧西林金葡球菌(MRSA);8株凝固酶阴性葡萄球菌中,均携带mecA基因。所有菌株均能生成生物被膜,其中能形成强、中等与弱粘附生物被膜能力菌株分别有5(3.9%)、47(37.0%)和75(59.1%)株。金葡菌中耐药性与生物被膜较为普遍,由于食源性微生物形成生物被膜后,具有逃逸常规消毒和杀菌手段的能力,成为食品安全中的潜在隐患。
桂中玉李琳李冰徐振波
关键词：金黄色葡萄球菌耐药性细菌生物被膜食品安全
金黄色葡萄球菌肠毒素在食源性微生物中的研究进展被引量：64
2013年
由细菌污染引起的食源性疾病依然是影响人类公共健康和食品安全的最大问题之一。其中,金黄色葡萄球菌是人类的一种重要病原菌,引起许多严重感染。金黄色葡萄球菌属于革兰氏阳性球菌,广泛分布于自然界,是引起化脓性疾病的重要病原菌,也是引起食品污染和细菌性食物中毒的一种重要细菌。食品受金黄色葡萄球菌污染后,不仅会腐败变质,而且部分菌株产生金黄色葡萄球菌肠毒素(Staphylococcal enterotoxins,SEs)而引起食物中毒,由金黄色葡萄球菌肠毒素引起的食物中毒占整个细菌性食物中毒的首位。所以,对SEs的研究以及快速、精确的检测和筛查,成为关键环节。本文拟对金黄色葡萄球菌肠毒素生物学性状、致病性、检验方法等方面的研究进展进行综述。当然,对金黄色葡萄球菌及其主要致病因子肠毒素的研究有待进一步深入与发展。
徐振波刘晓晨李琳李冰
关键词：金黄色葡萄球菌食品安全金黄色葡萄球菌肠毒素
金黄色葡萄球菌基因组岛对多重耐药表型与生物被膜能力的影响机制被引量：1
2015年
本文选择常见的典型食源性微生物金黄色葡萄球菌,从耐药性微生物感染防控角度出发,对广州地区临床分离的127株葡萄球菌的耐药表型、基因组岛分型与生物被膜生长能力进行研究。通过微量肉汤稀释法检测确定菌株对26种抗菌药物的药敏结果;PCR扩增葡萄球菌属特异性基因16S r RNA、金黄色葡萄球菌菌株特异性基因fem A、耐药基因mec A以检测确定菌株耐药特性;多重PCR检测金葡菌基因组岛SCCmec基因元件中ccr复合物,mec复合物以对其进行分型。107株耐药型金葡菌均为多重耐药,且呈耐9种或以上抗生素占76.1%(86/113)。113株葡萄球菌SCCmec分型结果为:I型0株,II型12株,III型73株,IV型10株,V型11株,5株为无法分型;本文对基因组岛和金黄色葡萄球菌耐药表型与生物被膜能力的相关性进行分析与探讨,为进一步对各种食源性微生物引起的食品污染进行安全控制,提供了研究基础。
邓阳梁晏瑞苗健李琳李冰徐振波
关键词：金黄色葡萄球菌多重耐药性生物被膜防控措施
食源性微生物MRSA及其检测方法在食品安全中的研究进展被引量：5
2015年
食品安全在世界卫生组织的定义是指所有食品中有毒、有害物质对人体健康影响的公共卫生问题。2008年"三聚氰胺"事件后,在近几年的全国两会上,食品安全问题连续成为焦点话题;而同期全国人大常委会通过的《食品安全法》,更显示了食品安全的严重与令人担忧,其监测与控制显得迫在眉睫。作为典型的食源性微生物,金葡菌尤其是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)其新型的耐药特点显示了细菌耐药性的发展和进化可能是由于大量抗生素在畜牧业中的滥用而造成的。由于抗菌药物的研制周期跟不上耐药性出现的速度,使得细菌治疗面临越来越严峻的考验,甚至出现无药可用的情况,严重威胁人类健康。本文结合食品安全抗生素滥用问题与最近出现的超级细菌耐药问题,根据在相关领域多年的研究数据,对常见的食源性微生物MRSA及其检测方法在食品安全中的研究进展进行综述。
邓阳刘晓晨李冰李琳徐振波
关键词：食品安全
金黄色葡萄球菌生物被膜基因型的分子鉴定被引量：4
2015年
本文选用常见的典型食源性微生物金黄色葡萄球菌,从食品微生物安全角度出发,采用生物被膜菌落结晶紫染色法定量检测58株金黄色葡萄球菌菌株生物被膜的形成能力。并对金黄色葡萄球菌生物被膜相关基因型进行分型研究,包括ica调控子分型(ica A、ica D、ica BC)与粘附特性分型(agr、atl E和aap)研究。结果显示,所有检测菌株均能生成生物被膜,其中3株能生成强粘附性生物被膜,占5.2%;生成中等生物被膜能力菌株有23株,占39.7%;32株金黄色葡萄球菌生成弱粘附生物被膜,占55.2%。实验所用的58株菌株中有48株能扩增出ica A基因,56株扩增出ica D基因,57株扩增出ica BC基因,56株扩增出agr,分别有53株和57株染色体中存在aap和atl E基因。本实验的结论:ica操纵子为金黄色葡萄球菌生物被膜形成所必须,aap基因可能作为促进金黄色葡萄球菌生物被膜形成的一个独立因素。而atl E,agr基因是金黄色葡萄球菌生物被膜粘附过程中形成所必须的调节因子。
李冰刘晓晨李琳徐振波
关键词：金黄色葡萄球菌生物被膜ICA操纵子ATLE基因
Solexa基因组测序技术在食源性蜡样芽胞杆菌基因组研究中的应用
2015年
本文拟通过对2株从酱油渣中分离获得的蜡样芽孢杆菌用DNA纯化试剂盒提取全基因组DNA,并用胶回收试剂盒纯化后,构建质量合格的测序文库并进行Solexa基因组重测序,获得基因组序列后对其测序质量进行评估,并对基因组信息进行分析,其中包括利用mapping分析研究2株菌相对于参考基因组的各自的变异基因,并找到其共有变异基因,并对共有变异基因进行COG注释、GO功能注释及KEGG生物学通路分析,通过对变异基因的这些分析,结合文献中其他对蜡样芽孢杆菌耐盐的研究,在基因功能分析的基础上找出决定其耐盐能力的关键基因,本研究共找到49个耐盐相关基因,这些基因很可能在菌株耐盐中起着关键作用。本研究探索其耐盐机制,为酱油渣的综合利用创造条件,同时进一步为微生物在食品发酵过程中的各种耐盐机制研究提供重要依据。
李琳姬莉莉段静静金河坡李冰徐振波
关键词：蜡样芽孢杆菌
食源性沙门氏菌第Ⅰ类整合子检测及其耐药基因盒分析被引量：3
2014年
目的:了解食源性沙门氏菌的耐药性、Ⅰ类整合子分布及其耐药基因盒的结构序列,为Ⅰ类整合子的分子进化提供理论基础。方法:采用K-B纸片法检测食源性沙门氏菌对14种抗生素的敏感性;利用聚合酶链式反应(PCR)扩增整合酶基因intI1检测食源性沙门氏菌中Ⅰ类整合子携带率及可变区耐药基因盒。结果:食源性沙门氏菌对β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类和磺胺类的最高耐药率分别为18.75%、12.5%、6.25%和25%。59.4%(19/32)的食源性沙门氏菌检测出第Ⅰ类整合子。PCR扩增Ⅰ类整合子耐药基因盒,扩增产物大小为1009和1664bp,携带aadA5、dfr17和aadA2耐药基因,可分别介导对氨基糖苷类抗生素壮观霉素、链霉素和磺胺类药物甲氧苄氨嘧啶的耐药。结论:食源性沙门氏菌中也检测到较高的耐药率及整合子携带率,提示我们应该从基因水平上对食源性致病菌耐药及其传播进行监测。
周蓉李琳苏健裕李冰徐振波
关键词：沙门氏菌耐药基因盒耐药性
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