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国家自然科学基金(U1130302): 作品数：16 被引量：60H指数：6; 相关作者：甘尚权王新华刘守仁高磊沈敏更多>>; 相关机构：新疆农垦科学院石河子大学新疆农业职业技术学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划兵团博士基金更多>>; 相关领域：农业科学生物学更多>>

X染色体一处新发现的SNP位点在脂尾(臀)、瘦尾绵羊群体中的多态检测及分析被引量：9: 2013年; 脂尾(臀)性状是绵羊逆境生存之需的必要性状,其在尾臀部位大量囤积脂肪的分子机理亟待解析。为此,本研究以国外新近报道的X染色体一处可能与尾脂性状相关的SNP为研究对象,检测该位点在我国巨臀脂型阿勒泰羊、短脂尾型湖羊以及瘦尾萨福克羊群体中的多态性,并验证该位点是否可作为一个有效的分子标记应用于高、低脂绵羊新品种培育。本研究成功地扩增出了含绵羊X染色体59257971位点SNP的170 bp片段,并采用PCR-RFLP方法进行SNP分型。研究结果表明我国脂臀型阿勒泰羊、短脂尾型湖羊和瘦尾萨福克羊在X染色体59257971位点均以AA基因型为主要基因型,3个群体中均没有发现GG基因型,说明脂臀(尾)与瘦尾绵羊品种间、臀尾异常丰满的阿勒泰羊与尾脂较为丰满的湖羊群体间等位基因并无明显差异,暗示该位点不能作为选育我国高、低脂绵羊品种的有效分子标记。; 甘尚权张伟张伟宋天增沈敏梁耀伟杨井泉高磊刘守仁; 关键词：等位基因分子标记

7号染色体46765080位点SNP与绵羊尾臀性状相关性研究被引量：4: 2013年; 绵羊尾(臀)脂性状是重要耐逆性状,其脂肪沉积的分子机制不清。旨在研究绵羊脂尾(臀)沉积脂肪的分子遗传机制,以最近文献报道的7号染色体一处SNP位点为候选分子标记,利用PCR-RFLP方法检测该位点在尾型极端差异的阿勒泰羊、哈萨克羊、湖羊、中国美利奴细毛羊以及萨福克羊群体中的多态性,并采用模型分析其与尾(臀)脂性状的相关性。结果表明,7号染色体46765080位点的G等位基因高频出现在表型分值较高的臀脂型阿勒泰羊群体中,A等位基因在长瘦尾绵羊品种中高频出现;等位基因频率G/A的比值与尾臀表型分值相关性模型表明G/A比值随着尾臀表型分值增加呈指数增长。以上结果表明,绵羊7号染色体46765080位点在尾(臀)脂与瘦尾绵羊群体中分布存在显著性差异,该SNP位点可作为一个理想的分子标记应用于高、低脂绵羊品种选育。; 梁耀伟张伟沈敏李欢高磊杨井泉刘守仁甘尚权王新华; 关键词：阿勒泰羊

绵羊X染色体59194976位点多态分析及其与尾(臀)脂性状相关性研究被引量：6: 2013年; 尾脂沉积能力在脂尾型绵羊和瘦尾型绵羊间存在很大的差异,但其沉积脂肪的遗传特性与分子机制仍不明晰。为此,本研究选择尾型极端差异的阿勒泰羊(巨型脂臀)、湖羊(短脂尾)和黑萨福克羊(长瘦尾),采用PCR-RFLP方法检测绵羊X染色体59194976位点多态性,分析其与尾(臀)脂沉积能力的相关性。结果表明:在阿勒泰羊群体中G等位基因属优势等位基因,其两等位基因比值(G/A)分别是湖羊和黑萨福克羊的6倍和68倍,且G等位基因在阿勒泰羊中趋于纯合。卡方检验结果表明,阿勒泰羊在该位点均处于HardyWeinberg平衡状态(p>0.05),而湖羊和黑萨福克羊在该位点均处于Hardy-Weinberg极不平衡状态(p<0.01)。以上结果提示,绵羊X染色体59194976位点SNP可作为理想的分子标记应用于高、低脂绵羊品种选育。; 王世银张伟张伟张伟沈敏李欢梁耀伟杨井泉高磊; 关键词：等位基因基因型分子标记

5号染色体两候选SNP基因定位以及与绵羊臀尾性状的关联分析被引量：1: 2016年; 脂尾(臀)性状是绵羊逆境生存的耐逆性状,其臀尾部大量储积脂肪的基因组变异研究目前仍是空白。本研究以国外新近报道的5号染色体上存在的可能与尾脂性状相关联的两处SNP为研究对象,分别采用PCR-RFLP和PCR-SSCP的方法检测两SNP在我国尾型极端差异的阿勒泰羊、湖羊、细毛羊以及藏羊群体中的多态性、基因型与等位基因分布,验证两SNP是否可作为我国低脂绵羊新品种培育的分子标记。研究结果表明:两SNP在我国脂尾(臀)型阿勒泰羊、湖羊与瘦尾型中国美利奴羊细毛羊和藏羊群体中高度分化,两SNP的T等基因与A等位基因在瘦尾型绵羊品种中高频出现,存在与瘦尾性状密切相关的趋势,提示此两个SNP可作为选育低脂绵羊新品种的有效分子标记。; 唐红徐梦思孟季猛周平王立民沈敏高磊石国庆刘守仁王新华杨井泉甘尚权; 关键词：等位基因

X染色体60149273位点在脂尾(臀)和瘦尾绵羊品种中的多态性及其基因定位被引量：13: 2013年; 【目的】研究绵羊X染色体60149273位点在不同沉脂尾型绵羊品种中的多态性,为解析绵羊尾脂沉积性状的遗传机制提供基础数据。【方法】首先,采用PCR-SSCP分型方法检测X染色体60149273位点在不同脂尾类型绵羊品种的多态性,并借助PCR产物直接测序的方法确认各基因型相应序列,利用卡方检验的方法检测各基因型分布在不同品种中的平衡性。其次,利用生物信息方法将该SNP定位与绵羊androgen receptor(AR),并使用电子克隆的方法克隆出绵羊AR全长编码序列。同时以阿勒泰羊臀部脂肪RNA为材料,采用RT-PCR的方克隆绵羊AR第3—8外显子序列,利用生物信息学方法分析序列同源性以及序列的物种进化保守性。【结果】①PCR-SSCP结果显示,在脂尾(臀)型绵羊品种阿勒泰羊和湖羊群体中X染色体60149273位点未检出多态性,GG基因型占100%;而瘦尾(臀)型绵羊品种中国美利奴和萨福克羊群体中则出现了多态性,GG基因型分别下降至10%和21%。②利用比较基因组学首次电子克隆出该SNP所属基因AR的全长编码区,并从阿勒泰羊臀脂mRNA中成功扩增羊源AR第3—8外显子片段,测序结果与电子克隆序列完全一致。③物种同源性比对进一步显示,AR在哺乳类动物中高度保守,哺乳动物各物种间同源性高达90%;进化树分析结果显示,牛、绵羊、海豚和猪等哺乳动物亲缘较近。【结论】首次发现绵羊AR第3内含子一处SNP在脂尾(臀)与瘦尾绵羊品种中存在较大差异,该SNP将可作为一个分子标记运用于低脂绵羊新品种的培育,同时该SNP所属AR也可作为一个重要候选功能基因应用于绵羊尾(臀)脂沉积分子机制的相关研究。; 甘尚权沈敏李欢梁耀伟杨井泉高磊刘守仁王新华; 关键词：阿勒泰羊多态性标记基因

绵羊7号染色体46 818 598位点在脂臀阿勒泰羊群体中的多态检测及分析被引量：2: 2014年; 为了研究影响阿勒泰羊臀脂沉积的分子标记,研究以国外新近报道的7号染色体一处可能与尾脂性状关联的单核苷酸多态性(SNP)为研究对象,采用PCR-SSCP的方法检测该位点在我国脂臀型阿勒泰羊群体中的多态性,并分析该位点与脂臀性状的关联性。结果表明:绵羊7号染色体46 818 598位点SNP的各基因型在我国脂臀型阿勒泰羊群体中符合孟德尔分离定律,且等位基因比值接近1.0,该位点在阿勒泰羊群体中的分布没有差异。说明绵羊7号染色体46 818 598位点不能作为影响我国阿勒泰羊臀脂沉积性状的分子标记。; 甘尚权杨武张伟张伟沈敏刘守仁; 关键词：多态性分子标记绵羊

FABP4基因在阿勒泰羊尾脂沉积与代谢模型中的表达变化规律被引量：16: 2015年; FABP4(Fatty acid binding protein 4)参与细胞内脂肪酸的转运和脂肪酸代谢,是当前研究动物脂肪沉积与代谢的热门候选基因。为了研究FABP4基因在绵羊尾脂沉积与代谢中的作用,文章采用生物信息学方法分析了FABP4氨基酸序列在各物种中的保守性;利用半定量RT-PCR方法检测了该基因在阿勒泰羊主要组织中的表达;采用饥饿法成功建立了模拟阿勒泰羊尾脂沉积与代谢的动物模型,利用q PCR和i TRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术同时验证FABP4基因m RNA和蛋白在阿勒泰羊非饥饿组与饥饿组尾脂中的表达变化。序列分析结果表明,绵羊FABP4氨基酸序列在物种间高度保守,提示FABP4基因可能由于其重要的生物功能而在进化中表现出其物种的保守性。组织表达谱结果显示,FABP4 m RNA在阿勒泰羊肠脂与尾脂中均高丰度表达,暗示FABP4基因可能在脂肪中行驶着重要的生理生化功能。q PCR与i TRAQ结果显示,FABP4 m RNA与蛋白在两种极端条件下尾脂中的表达差异均不显著(P>0.05),表明FABP4基因可能不是绵羊尾脂沉积与代谢两种极端差异表型的决定基因。以上研究结果为进一步研究FABP4基因在绵羊尾脂中的生物功能奠定了基础。; 许瑞霞高磊赵伟利张伟张伟宋广超甘尚权; 关键词：阿勒泰羊

绵羊X染色体59327581位点在3种不同尾型绵羊品种中的多态检测及分析被引量：6: 2013年; 脂尾(臀)性状是绵羊逆境生存之需的必要性状,其在尾臀部位大量囤积脂肪的分子机理仍不明晰。为此,本研究以国外新近报道的X染色体一处可能与尾脂性状关联的SNP为研究对象,检测该位点在我国尾型极端差异的阿勒泰羊、湖羊以及细毛羊群体中的多态性,并验证该位点是否可作为1个有效的分子标记应用于低脂绵羊新品种培育。成功地扩增出了含绵羊X染色体59327581位点SNP的385bp片段,并采用PCR-SSCP方法进行SNP分型,后DNA测序只鉴定出1种基因型。结果表明,我国脂臀型阿勒泰羊、短脂尾型湖羊以及长瘦尾型中国美利奴羊在X染色体59327581位点处无多态性,说明我国绵羊X染色体59327581位点不能作为选育低脂绵羊品种的有效分子标记。; 甘尚权张伟张伟沈敏梁耀伟杨井泉高磊刘守仁; 关键词：等位基因分子标记

阿勒泰羊臀脂沉积性状4个候选基因的表达及分析被引量：5: 2016年; 阿勒泰羊的抗寒性能与其肥硕的尾脂(臀脂)高度相关。试验旨在通过检测影响脂肪沉积相关基因THRSP、CEBPα、PRKAG3和SREBF1的组织表达模式,期望寻找到影响阿勒泰羊臀脂沉积的关键基因,为进一步阐明绵羊臀脂沉积的分子调控机理提供参考。采集3只3岁健康阿勒泰母羊心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮下脂肪、尾脂8个组织,运用荧光定量PCR技术对上述基因在以上各个组织中的表达情况进行分析。结果表明,THRSP和CEBPα基因在阿勒泰羊肝、皮下脂肪和尾脂中的表达量显著高于其他组织(P<0.01),暗示此2个基因可能与脂肪的生成密切相关。PRKAG3基因在脂肪合成组织中低表达(P<0.01),提示其可能与脂肪的分解密切相关。研究结果为进一步阐明阿勒泰羊臀脂消长的生物学现象提供了科学思路。; 王耀武甘尚权刘守仁狄冉胡文萍王翔宇贺小云刘秋月储明星; 关键词：阿勒泰羊候选基因表达谱

绵羊X染色体59571364与59912586位点在脂尾、瘦尾绵羊群体中的多态性检测及分析被引量：10: 2013年; 为了探讨绵羊X染色体上两处SNP(59571364和59912586)与绵羊尾脂沉积性状的关系,继而为利用分子标记辅助选择育种技术培育低脂绵羊品种提供依据,文章以尾型极端差异的阿勒泰羊、湖羊、中国美利奴细毛羊以及萨福克羊为研究对象,利用PCR-RFLP检测两位点在群体中的多态性,并分析了两个SNP位点在阿勒泰羊群体中的单倍型。结果表明:59571364位点的TT基因型和59912586位点的GG基因型在瘦尾中国美利奴与萨福克羊群体中属于优势基因型,而两种基因型在脂尾(臀)阿勒泰羊与湖羊群体中比率均不足2%;两位点在阿勒泰羊群体中的单倍型分析结果显示,CA单倍型为主单倍型,比率高达55%,CA与TA两单倍型约占88.33%。以上结果提示,绵羊X染色体59571364与59912586位点在脂尾(臀)与瘦尾绵羊群体中分布存在较大差异,可作为理想的分子标记应用于高、低脂绵羊品种选育。; 张伟张伟张伟沈敏李欢高磊梁耀伟杨井泉刘守仁; 关键词：阿勒泰羊 SNP位点多态性

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