上海市教委科研基金(06BZ017)
- 作品数：3 被引量：7H指数：2
- 相关作者：唐子圣吴明桃王友群陈慧梁景平更多>>
- 相关机构：上海交通大学医学院附属第九人民医院中国药科大学中国科学院更多>>
- 发文基金：上海市教委科研基金上海市科学技术委员会科研基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 口腔龈上菌斑5种DNA提取方法的比较被引量：3
- 2011年
- 目的寻找方便、快捷、经济、获取细菌信息量最多的细菌基因组DNA抽提方法。方法采用洗涤+冻融+BeadBeater+酚氯仿抽提法(X法)、试剂盒法(Y法)、洗涤+冻融+试剂盒法(Z法)、直接煮沸法(U法)和加Chelex-100后煮沸法(V法)5种DNA抽提方法,分别提取3例慢性牙周炎患者龈上菌斑DNA,检测DNA片段大小和浓度;同时运用变性梯度凝胶电泳分析样本微生物多样性和相似度,从多个角度对5种DNA提取方法进行评价。结果 X法DNA片段集中于3 000～20 000bp处;Y法和Z法DNA片段均匀分布于500～20 000 bp处;U法无明显DNA片段出现;V法DNA片段主要分布于500～2 000 bp处。Y法、Z法与V法所提DNA浓度较高,X法与U法所提DNA浓度较低。X法、Y法、Z法和V法反应的龈上菌斑微生物多样性无显著差异。X法、Y法和Z法的相似度较高,而V法与X法、Y法、Z法的相似度较低。结论洗涤+冻融+Bead Beater+酚氯仿抽提法,试剂盒法,洗涤+冻融+试剂盒法,加Chelex-100后煮沸法的DNA提取效果无显著差异;直接煮沸法的DNA提取效果较差。
- 刘莹吴明桃陈慧庞小燕赵立平唐子圣
- 关键词：DNA提取
- 变性梯度凝胶电泳技术在口腔微生物研究中的应用被引量：1
- 2010年
- 变性梯度凝胶电泳(Denatured Gradient GelElectrophoresis,DGGE)技术是一种能将大小相同而序列不同的DNA分子分离的分子生物学技术,无需经过传统培养方法,便能分析环境和人体微生态菌群的组成和结构,具有高通量、省时、经济等优点。该文从该技术在根管感染、龋病、牙周微生物、口腔生物膜等方面的应用进行综述。
- 吴明桃徐晓唐子圣
- 关键词：变性梯度凝胶电泳龋病根管感染
- 应用16SrDNA基因芯片检测4种产黑色素感染根管可疑致病菌被引量：3
- 2007年
- 目的:研制快速检测牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)、牙髓卟啉单胞菌(Porphyromonas endodontalis,Pe)、中间普氏菌(Prevotella intermedia,Pi)和变黑普氏菌(Prevotella nigrescens,Pn)的芯片系统。方法:利用Genebank中细菌16SrDNA保守区序列,设计一对通用引物;通过已知Pg、Pe、Pi和Pn的16SrDNA可变区序列,设计合成对应的特异性寡核苷酸探针。先用通用引物PCR扩增所有标准菌株的DNA并作荧光标记,PCR产物和已点样有Pg、Pe、Pi和Pn4种探针的芯片杂交,并用荧光扫描仪进行分析。结果:芯片上的Pg、Pe、Pi和Pn4种探针只与相对应的Pg、Pe、Pi和Pn的PCR产物反应,而与其他标准菌株的PCR产物无反应。结论:应用16SrDNA基因芯片可以准确检测Pg、Pe、Pi和Pn,快速、灵敏、特异性高,有望在临床上得到应用。
- 江禾曹慧敏唐子圣朱彩莲梁景平赵建龙王友群刘正
- 关键词：RDNA微阵列芯片
