国家重点实验室开放基金(SKLMR-20090603)
- 作品数：2 被引量：33H指数：2
- 相关作者：张利莉关统伟夏占峰阮继生黄英更多>>
- 相关机构：塔里木大学中国科学院四川农业大学更多>>
- 发文基金：国家重点实验室开放基金教育部科学技术研究重点项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 艾丁湖沉积物放线菌多样性被引量：23
- 2011年
- 【目的】为了研究新疆艾丁湖低海拔、高盐环境中的放线菌多样性。【方法】本研究应用基于16S rRNA基因序列系统发育分析的免培养方法和选择性分离培养方法相结合的方式对艾丁湖沉积物样品进行放线菌多样性分析。利用放线菌特异性引物扩增16S rRNA基因并构建了16S rRNA基因克隆文库,对文库中的插入序列进行RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism限制性片段长度多态性)分析。采用不同盐浓度的9种选择性培养基分离样品中的放线菌。【结果】通过对16S rRNA基因克隆文库分析,273个克隆分布于放线菌纲(Actinobacteria)的放线菌亚纲(Actinobacteridae 208个)、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae 13个)和红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae 52个)。该环境中优势放线菌为微球菌科的罗斯氏菌属(Rothia),占到克隆总数的37%。有45.8%的序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,部分序列形成了几个独立的进化分支,可能代表着放线菌新的类群。通过分离培养,共得到55株放线菌,分布在放线菌目的6个亚目中,以链霉菌属(Streptomyces)和拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)为主要类群。有6株菌的16S rRNA基因序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,为潜在的放线菌新分类单元。【结论】研究表明,艾丁湖中的放线菌具有较高的多样性,并蕴藏着多种新类型,有进一步研究价值。
- 夏占峰关统伟阮继生黄英张利莉
- 关键词：放线菌多样性
- 新疆高盐环境土壤放线菌分离培养基比较被引量：13
- 2010年
- 根据采样点及其样品相关信息结合近几年对高盐环境放线菌的分离经验,设计出一种含有10%～30%复合盐的CMKA培养基,同时以补充10%～30%复合盐的高氏一号琼脂培养基(GA)、ISP4培养基、淀粉酪素琼脂培养基(SCK)和HV培养基为对照,对采集于新疆阿克陶盐山、罗布泊洼地和阿克苏盐碱地的3份土壤样品利用上述5种培养基进行了分离.结果表明,CMKA培养基分离效果最好,共分离到7个属的放线菌(Actinopolyspora、Streptomonospora、Nocardiopsis、Saccharomonospora、Brevibacterium、Streptomyces和Amycolatopsis),并且获得1个放线菌新种(TRM F103).ISP4、GA、HV和SCK培养基分离效果较差,获得的属级分类单元少.同时,CMKA培养基的出菌率也是最高的,说明比较适合分离高盐环境土壤放线菌,而用于分离普通环境中放线菌的ISP4、GA、HV和SCK培养基则不适于高盐环境放线菌的分离.此外,新疆的高盐环境土壤中存在着丰富的放线菌资源,包括一些新类群的存在.
- 关统伟赵珂夏占峰吕玲玲张小平张利莉
- 关键词：高盐环境放线菌
