广州市属高校科研项目(2012C135)
- 作品数：3 被引量：8H指数：2
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- 基因芯片筛选CD133^+/CD133^-肺腺癌细胞中新的耐药基因被引量：3
- 2014年
- 背景与目的肿瘤干细胞可能是肿瘤多药耐药的主要原因,CD133是目前较为公认的肿瘤干细胞标记物。本研究旨在应用功能分类基因芯片筛选CD133+和CD133-肺腺癌细胞中差异表达的肿瘤耐药基因,寻求新的肺癌耐药相关基因。方法免疫磁珠分选法分选A549细胞,采用功能分类基因芯片筛选CD133+和CD133-肺腺癌细胞中差异表达的肿瘤耐药基因,并使用RT-qPCR验证。顺铂半数有效抑制浓度(half inhibiting concentration,IC50)、阿霉素IC50作用A549细胞48 h后,RT-qPCR检测肿瘤耐药基因CYP2C19、CYP2D6、CYP2E1、GSK3α、PPARα和PPARβ/δ的表达变化。结果共筛查出31个差异表达的肿瘤耐药基因,与CD133-细胞相比,CD133+细胞有30个基因表达上调,1个基因表达下调。RT-qPCR结果与芯片一致。A549细胞经1.97μg/mL顺铂或0.61μg/mL阿霉素作用48 h后,CYP2C19、CYP2D6、CYP2E1、GSK3α、PPARα和PPARβ/δ等肿瘤耐药基因表达上调。结论利用功能分类基因芯片筛选出31个可能与CD133+肺腺癌细胞耐药相关的基因,其中CYP2C19、CYP2D6、CYP2E1、GSK3α、PPARα和PPARβ/δ为新发现的肺癌耐药相关基因。
- 王红艳郑少秋涂永生张雅洁
- 关键词：CD133耐药
- 肺癌转移相关microRNA miR-29b的生物信息学分析被引量：4
- 2014年
- 目的:应用生物信息学分析A549细胞中在CD133阳性低表达的miR-29b的靶基因及其功能,为以miR-29b为靶点的肿瘤研究提供线索。方法:利用miRNA PCR芯片筛选A549细胞中CD133阳性和CD133阴性差异表达的miRNA,选用miRecords预测miR-29b的靶基因,合并已证实的靶基因,利用GOEAST和DAVID数据库对所得靶基因进行功能富集分析和信号转导通路富集分析。结果:A549细胞中与CD133阴性比较,miR-29b在CD133阳性中表达下调。miR-29b靶基因有106个,其靶基因功能富集于结合和细胞外基质形成等作用(P<0.01);信号转导通路显著富集于JAK-STAT和TGF-β等信号转导通路(P<0.05)。结论:miR-29b可能与肺癌转移相关,miR-29b的靶基因显著富集在与肿瘤相关的信号通路中。
- 王红艳郑少秋涂永生张雅洁
- 关键词：肺癌靶基因生物信息学
- 顺铂间歇性干预对A549中干细胞及EMT相关基因表达的影响被引量：1
- 2015年
- 目的:研究肺癌细胞A549在顺铂(DDP)间歇性干预后肿瘤干细胞(CSC)标志物(CD133)和上皮细胞间质转化(EMT)标志物(E-cadherin、β-catenin、Vimentin和Fibronectin)表达的变化,探讨肺癌耐药和CSC及EMT之间的相关性。方法:应用CCK-8法检测A549细胞对DDP的敏感性,DDP IC50间歇性处理A549细胞,采用Western blot法检测CD133蛋白表达变化,RT-q PCR法测定A549细胞处理前后E-cadherin、β-catenin、Vimentin和Fibronectin mRNA的表达。结果:肺腺癌细胞A549经DDP间歇性干预后,CSC标记物CD133蛋白表达增高,E-cadherin和β-catenin mRNA的相对表达量均显著降低,Vimentin mRNA的相对表达量显著增高。结论:A549细胞经DDP间歇性干预后有CSC标志物的表达,并表现出EMT的特性。
- 王红艳张雅洁
- 关键词：耐药肿瘤干细胞上皮细胞间质转化
