国家自然科学基金(60903075)
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 相关作者：朱扬勇陈鸣薛慧君熊赟董家麒更多>>
- 相关机构：复旦大学内蒙古电子信息职业技术学院上海大学更多>>
- 发文基金：上海市教育委员会重点学科基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 基于多数据域描述的转录因子结合位点识别被引量：1
- 2011年
- 转录因子结合位点的识别对于理解转录调控机制起着重要作用,也是后基因组时代面临的巨大挑战之一。提出一个基于多任务学习的转录因子位点的识别方法。首先建立一个基于多任务学习理论的多数据域描述模型,然后结合核方法设计转录因子结合位点多分类识别算法。最后对取自于TRANSFAC数据库的真实数据进行交叉验证测试。实验结果表明该方法能充分地利用稀缺的训练样本,有效地捕获不同类别间的联系,从而获得了较高的预测准确率。
- 陈鸣薛慧君熊赟朱扬勇
- 关键词：多任务学习转录因子结合位点核方法
- 一种序列模式的相似性查询算法
- 2011年
- 数值型序列在很多应用中存在,如超市的POS销售记录和证券交易所的股票买卖数据等.在此类数据中查询与给定序列模式相似的子模式具有重要的现实意义.提出一种趋势融合的序列相似性查询算法NSS_QA,首先对所有序列进行单调区间的"融合"处理,然后根据各区间的长度比例和幅度比例产生序列模式的候选集,最后定义了一种新的相似性度量来计算并返回查询结果.该查询算法能找到与给定序列模式"放大"或"缩小"的模式结果.实验结果表明,提出的算法能找到在总体形状上与给定序列模式相似的所有模式,且在时间上具有较好的伸缩性能.
- 汤春蕾董家麒戴东波朱扬勇
- 关键词：相似性查询
