陕西省科技攻关计划(2004K09-G12)
- 作品数：7 被引量：17H指数：3
- 相关作者：陈腾李生斌陈峰辛娜阎春霞更多>>
- 相关机构：西安交通大学西安医学院附属医院中国科学院更多>>
- 发文基金：陕西省科技攻关计划教育部科技基础资源数据平台建设项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生历史地理农业科学更多>>
- 中国甘肃裕固族X-STR遗传多态性及其应用研究被引量：5
- 2008年
- 为研究中国甘肃裕固族人群X染色体STR基因座的遗传多态性及其在群体遗传学中的应用,采用PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合银染显带技术,检测120名(女55,男65)裕固族无关个体9个X-STR基因座(DXS7130、DXS7132、DXS6804、DXS7423、DXS7424、DXS6789、DXS6799、DXS8378和HPRTB)的等位基因频率及基因型分布,以及存在连锁的X-STR基因座的单体型多态性;同时,利用X-STR构建系统发生树和进行聚类分析,分析裕固族与我国其他民族的群体遗传关系。结果发现,DXS7130、DXS7132、DXS6804、DXS7423、DXS7424、DXS6789、DXS6799、DXS8378和HPRTB基因座分别检出8、6、6、5、6、7、6、4、6个等位基因和16、14、13、6、13、20、11、6、12种基因型,9个X-STR基因座女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。由DXS7130和DXS8378基因座组成的单体型共检出15种,由DXS6789、DXS6799、DXS7424和DXS6804基因座组成的单体型共检出55种,单体型多样性分别为0.8212和0.9947。群体遗传多态性指标显示上述9个X-STR基因座均具有较高多态性,在法医学个体识别、亲权鉴定及群体遗传学研究中有重要应用价值。对裕固族与我国其他民族群体遗传关系的研究结果显示,裕固族与蒙古族及同处西北的汉族、藏族关系较近,而与回族、维族关系较远,提示裕固族是一个在起源上与蒙古族、汉族以及藏族关系密切的民族群体。
- 陈艳炯陈峰辛娜张洪波郑海波余兵李生斌陈腾
- 关键词：X染色体短串联重复序列单体型遗传多态性聚类分析
- 云南纳西族10个X-STR基因座遗传多态性研究被引量：3
- 2007年
- 为研究云南纳西族人群10个位于X染色体的短串联重复序列基因座及单倍型的遗传多态性，采用PCR扩增。变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合银染显色分型技术，对98名云南纳西族无关男性个体x染色体的10个STR基因座进行基因分型。结果显示。98名无关男性个体中。DXS7423、DXS7424、DXS6799、DXS7133、DXS6804、DXS8378、HPRTB、DXS7130、DXS7132和DXS6789分别检出4、7、6、3、6、5、5、7、6和8个等位基因。等位基因频率分布在0．0102（DXS7132、DXS6789）～0．7347（DXS7133）之间．由DXS8378与DXS7130基因座组成的单倍型共检出20种，由DXS6789、DXS6799和DXS7424基因座组成的单倍型共检出56种。单倍型多样性分别为0．8553和0．9649，说明所选的10个X—STR位点有较高的多态性信息，在基因组多样性研究、法医学个体识别、亲权鉴定中具有重要应用价值。
- 陈腾辛娜朱俊艳余兵金天博李生斌
- 关键词：X染色体短串联重复序列遗传多态性单倍型
- 中国内蒙古鄂伦春族线粒体DNA高变区Ⅰ和高变区Ⅱ遗传多态性被引量：1
- 2008年
- 收集50份鄂伦春族无关人群外周血样本,用ABIPRISM377测序仪对其mtDNAHVRⅠ和HVRⅡ进行测序,计算多态性位点数、单倍型数目、单倍型频率、平均核苷酸差异数目等多态性指标;结合已发表的其他民族mtDNA遗传资料,根据Nei法计算鄂伦春族与各群体之间的遗传距离,进行聚类分析,绘制系统发生树。鄂伦春族群体mtDNA两个高变区与CRS序列比对,分别发现52和24个多态性位点,分别界定了38和27种单倍型,单倍型多态性分别为0.964±0.018和0.929±0.019;平均核苷酸差异分别为7.379和2.408;用HVRⅠ序列多态性数据计算Fst和dA两种遗传距离,相关系数r为0.993(P<0.01);基于HVRⅠ序列的系统树显示鄂伦春族与中国台湾、南方汉族和中国香港人群遗传距离较近,与北方汉族、蒙古族及其国外人群遗传距离相对较远。我国鄂伦春族人群mtDNA具有相对独特的遗传特征,其遗传多态性和个体识别力较高,可用于民族起源、迁徙、法医学个体识别等领域研究。
- 阎春霞陈峰党永辉李涛郑海波陈腾李生斌
- 关键词：鄂伦春族线粒体DNA遗传多态性聚类分析
- 中国青海藏族、汉族mtDNA控制区遗传多态性被引量：2
- 2008年
- 目的研究中国青海藏族、汉族mtDNA控制区遗传多态性。方法收集69份青海藏族和青海汉族无关人群外周血样本,对其mtDNA控制区进行序列分析,计算多个多态性指标,结合其他民族mtDNA遗传资料,根据Nei法计算包括青海藏族和汉族群体在内的11个群体之间的Fst和Rst遗传距离,进行聚类分析,绘制系统发生树。结果在青海藏族和汉族群体mtDNA控制区中分别发现56和59个多态性位点。Rst遗传距离显示青海藏族人群与各人群之间遗传距离均较远(P<0.05);青海汉族人群与西安汉族、蒙古族、长沙汉族等人群之间距离较近(P>0.05)。结论我国青海藏族和汉族人群mtDNA具有相对独特的遗传特征,其遗传多态性和个体识别力较高,可用于民族起源、迁徙、法医学个体识别等领域研究。
- 穆豪放陈峰熊新张博阎春霞陈腾邓亚军
- 关键词：法医遗传学遗传多态性藏族汉族
- 运用多重PCR-直接测序法检测ABO基因型及其遗传多态性被引量：2
- 2008年
- 根据ABO基因座第6和7外显子9个SNP位点设计引物,复合扩增后直接测序,根据测序结果判定不同物证检材ABO基因型及其在藏族群体中的多态性分布。成功地检测出经过不同方法处理的血痕、毛发、口腔拭子、骨骼、混合斑等101例腐败、降解及微量检材的ABO基因型,结果与免疫血清学分型一致,且该方法具有灵敏度高、特异性好、操作简单、结果准确、客观及能够发现新等位基因等优点。对80名青海藏族无关个体的调查表明,ABO基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡,杂合度H为0.675,多态信息含量PIC为0.672,个人识别力DP值为0.874,非父排除率PE值为0.391,偶合度I为0.126;青海藏族ABO等位基因频率O>B>A,且O等位基因频率高达0.6125。多重PCR-直接测序法检测ABO基因型适用于法医学不同来源的样本,提高了ABO血型系统的个体识别能力;ABO基因型在青海藏族人群中的分布具有较高多态性,可用于法医学个体识别及群体遗传学研究。
- 陈峰陈腾阎春霞党永辉穆豪放于晓光张博邓亚军
- 关键词：多重PCRDNA测序群体遗传学青海藏族
- 中国甘肃青海5个民族群体STR基因座遗传多态性及其应用研究被引量：5
- 2006年
- 目的：研究中国甘肃青海地区5个少数民族群体（土族、撒拉族、东乡族、保安族、裕固族）STR基因座的遗传多态性及其应用。方法：选择9个STR基因座（D3S1358，VIVA，FGA，TH01，TPOX，CSF1PO，D5S818，D13S317，D7S820），采用STR复合扩增及荧光标记STR基因扫描技术，用ABI377全自动测序仪进行基因分型，同时检测5个少数民族群体的606个健康无关个体血液样本，计算5个少数民族群体的多态信息量、杂合度、个体识别力以及非父排除率等遗传多态性指标。结果：9个STR位点的基因型在5个少数民族群体中的分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律。5个少数民族群体9个STR位点的多态信息量范围在0．6054～0．8735之间；杂合度在0．6158～0．8736之间；个体识别力在0．7964～0．9691之间；非父排除率在0．4610～0．8838之间。采用基于基因频率的聚类分析发现，甘肃青海地区的土族、撒拉族、保安族及东乡族在起源上较为接近，而裕固族则相对较远；5个民族群体与中国南北方民族各群体之间有明显的基因交流现象。结论：在5个少数民族群体中，9个STR位点均为高度多态性遗传性标记，可用于群体遗传学、法医学等领域的研究，具有较高的应用价值。
- 陈腾金天博辛娜赖江华李生斌
- 关键词：群体遗传学短串联重复序列遗传多态性聚类分析
- 云南怒族人群HPRTB、DXS7423、DXS101基因座遗传多态性
- 2007年
- 乔可高树辉沈靓赖江华
- 关键词：法医物证学X染色体STR遗传多态性
