创新研究群体科学基金(21321064)
- 作品数：2 被引量：4H指数：2
- 相关作者：邹汉法叶明亮刘哲益程凯郑昊更多>>
- 相关机构：中国科学院大学中国科学院更多>>
- 发文基金：创新研究群体科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 赖氨酸胍基化对蛋白质组分析的影响被引量：2
- 2014年
- 赖氨酸胍基化在蛋白质组学定性和定量研究中起着重要作用,本文系统分析了胍基化前后,HeLa细胞蛋白质经胰蛋白酶酶解产生的3种不同类型肽段的质谱鉴定情况,并探讨了不同肽段质谱响应改变的内在原因。发现赖氨酸在侧链能选择性地发生胍基化反应(其选择性达到96.8%),转化为高精氨酸,碱性增强。因此在正离子质谱模式下,C端为赖氨酸的肽段产生了更多的y离子,提供了许多新的离子碎片信息。在鉴定结果中,此类肽段所占总肽段的比例由原来的51.7%上升为57.3%,并且有1 015条新的肽段被检测到。对于不含有赖氨酸的肽段,其鉴定结果在胍基化前后基本没有变化。结果表明,胍基化可以在一定程度上提高质谱鉴定的灵敏度和互补性,提高蛋白质分析的覆盖率。
- 郑昊毛家维潘彦博刘忠山刘哲益叶明亮邹汉法
- 关键词：质谱蛋白质组学
- 一种位点注释的蛋白质数据库用于磷酸化肽段的鉴定被引量：2
- 2015年
- 磷酸化修饰的分析一直是蛋白质组学研究的热点之一。在鸟枪法的蛋白质组学研究中,通过在数据库检索中设定磷酸化为可变修饰可以直接鉴定磷酸化修饰的位点。但是翻译后修饰的引入会增加数据检索空间,造成鉴定灵敏度的降低。为了解决这一问题,我们构建了一种位点注释的数据库,这种数据库包含蛋白质的磷酸化位点信息,并开发了一种新的数据库检索策略用于磷酸化肽段的可靠鉴定。用不同类型的数据作为分析对象,通过Mascot检索软件对这种新的数据库检索策略进行了考察,证明了这种方法在保证鉴定结果可靠性的前提下提高了磷酸化肽段鉴定的灵敏度。
- 程凯王方军边阳阳叶明亮邹汉法
- 关键词：蛋白质组学磷酸化
